ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 14 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA07G381490
Chr07:95627635-95628030 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030142
Chr06:109219061-109219456 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00312 | TkA07G381490 |
|
TkA07G382660
Chr07:95913475-95914527 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030152
Chr06:109545485-109546537 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00312 | TkA07G382660 |
|
TkA07G386140
Chr07:96790302-96791258 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030197
Chr06:110514078-110515034 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00312 | TkA07G386140 |
|
TkA07G386750
Chr07:96936964-96940032 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030202
Chr06:110648668-110651376 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00312 | TkA07G386750 |
|
TkA07G396250
Chr07:99536428-99537027 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030308
Chr06:113960523-113961122 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00313 | TkA07G396250 |
|
TkA07G396810
Chr07:99689175-99689705 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030317
Chr06:114147895-114148242 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 72.131 / 对象 98.876 |
JCVI_TKOH_00313 | TkA07G396810 |
|
TkA07G400380
Chr07:100620440-100625290 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030377
Chr06:115029781-115034416 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.600 查询 96.070 / 对象 89.941 |
JCVI_TKOH_00313 | TkA07G400380 |
|
TkA07G400970
Chr07:100784327-100787668 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030391
Chr06:115190133-115193869 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.200 查询 100.000 / 对象 79.034 |
JCVI_TKOH_00313 | TkA07G400970 |
|
TkA07G401050
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GWHBCHF00000008
|
LXL04_030392
Chr06:115195306-115196888 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 100.000 / 对象 91.392 |
JCVI_TKOH_00313 | TkA07G401050 |
|
TkA07G402320
Chr07:101071452-101072477 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030406
Chr06:115487714-115488739 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00313 | TkA07G402320 |
|
TkA07G402880
Chr07:101229351-101232648 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_008068
Chr02:83548349-83550151 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.100 查询 91.165 / 对象 79.094 |
TkA07G402880 | |
|
TkA07G406280
Chr07:102161646-102163196 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030478
Chr06:116819048-116819890 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.600 查询 97.211 / 对象 87.143 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G406280 |
|
TkA07G406810
Chr07:102292884-102295564 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030484
Chr06:116895414-116897744 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.900 查询 100.000 / 对象 94.891 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G406810 |
|
TkA07G407020
Chr07:102346335-102350266 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030487
Chr06:116958782-116963044 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.500 查询 97.023 / 对象 93.813 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G407020 |
|
TkA07G407320
Chr07:102433747-102442561 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030490
Chr06:117065002-117065964 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G407320 |
|
TkA07G407350
Chr07:102452641-102454494 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030491
Chr06:117081464-117082850 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 99.375 / 对象 71.622 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G407350 |
|
TkA07G407370
Chr07:102457343-102459395 (+)
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|
LXL04_030492
Chr06:117086085-117087624 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.100 查询 93.410 / 对象 76.256 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G407370 |
|
TkA07G409670
Chr07:103433356-103436671 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030523
Chr06:118100699-118102792 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G409670 |
|
TkA07G409760
Chr07:103450246-103451763 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030526
Chr06:118122831-118124483 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.300 查询 100.000 / 对象 91.818 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G409760 |
|
TkA07G410020
Chr07:103523814-103528005 (+)
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|
LXL04_030532
Chr06:118182482-118188401 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 99.853 / 对象 76.437 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G410020 |
|
TkA07G410530
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GWHBCHF00000008
|
LXL04_030545
Chr06:118361661-118366344 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.500 查询 98.654 / 对象 74.456 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G410530 |
|
TkA07G410780
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GWHBCHF00000008
|
LXL04_008139
Chr02:88979109-88980427 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.600 查询 100.000 / 对象 94.054 |
TkA07G410780 | |
|
TkA07G411140
Chr07:103883987-103888131 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030562
Chr06:118583939-118586920 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.700 查询 100.000 / 对象 73.544 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G411140 |
|
TkA07G413440
Chr07:104439867-104441296 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030581
Chr06:119172448-119172902 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G413440 |
|
TkA07G413650
Chr07:104492167-104493626 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030584
Chr06:119209593-119213246 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.100 查询 100.000 / 对象 74.795 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G413650 |
|
TkA07G414330
Chr07:104705891-104715362 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030603
Chr06:119443677-119450081 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.600 查询 100.000 / 对象 75.989 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G414330 |
|
TkA07G417050
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GWHBCHF00000008
|
LXL04_033920
Chr07:65497736-65502964 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 96.599 / 对象 100.000 |
TkA07G417050 | |
|
TkA07G421120
Chr07:106425402-106428248 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030647
Chr06:120221678-120225722 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 79.837 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G421120 |
|
TkA07G421640
Chr07:106556847-106557188 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030653
Chr06:120321608-120321950 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G421640 |
|
TkA07G422560
Chr07:106805498-106808061 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030671
Chr06:120558119-120561063 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 96.627 / 对象 74.122 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G422560 |
|
TkA07G423700
Chr07:107166078-107168659 (+)
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|
LXL04_030696
Chr06:120934090-120936848 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G423700 |
|
TkA07G425350
Chr07:107531138-107532165 (+)
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|
LXL04_030712
Chr06:121236952-121238190 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.600 查询 97.509 / 对象 93.333 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G425350 |
|
TkA07G427280
Chr07:108092914-108094257 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030741
Chr06:121828270-121830159 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 71.065 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G427280 |
|
TkA07G429130
Chr07:108585915-108591191 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030760
Chr06:122216519-122221086 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G429130 |
|
TkA07G432840
Chr07:109516194-109516583 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030807
Chr06:123060458-123060754 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.900 查询 73.643 / 对象 96.939 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G432840 |
|
TkA07G433760
Chr07:109743389-109743886 (-)
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|
LXL04_030821
Chr06:123369801-123370298 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G433760 |
|
TkA07G435150
Chr07:110145914-110146774 (+)
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|
LXL04_030832
Chr06:123718932-123719798 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G435150 |
|
TkA07G436890
Chr07:110583927-110586374 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030843
Chr06:124052055-124054503 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00314 | TkA07G436890 |
|
TkA07G437060
Chr07:110636877-110641764 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_030849
Chr06:124123015-124127342 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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