LXL04_030741 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030741

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 121828270-121830159 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1890 bp · LXL04_030741|LXL04_030741|OH1004|cDNA

ATGCATCCCGGAAGCCTCGCAATCATTCTTCTCTTCCTCCTATCGACACCCATCGCCGCCGTCGACTTCCTCTTCAACTCCTTCAACACCACCGCCGACCTCCTGTTAGTGCGTGACGCCCGCATCGAGCCACCGGCGATCCGCTTATCCAATGACTCCAATCAGTGGTCAATCGGTCGAGCTTTCTACTCACCGCGACTTCAAATGCTCCGGCAAGGCTCAGGTAACATTACTGTGTTCTCGACTCAGTTCGTATTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1890 bp · LXL04_030741|LXL04_030741|OH1004|CDS

ATGCATCCCGGAAGCCTCGCAATCATTCTTCTCTTCCTCCTATCGACACCCATCGCCGCCGTCGACTTCCTCTTCAACTCCTTCAACACCACCGCCGACCTCCTGTTAGTGCGTGACGCCCGCATCGAGCCACCGGCGATCCGCTTATCCAATGACTCCAATCAGTGGTCAATCGGTCGAGCTTTCTACTCACCGCGACTTCAAATGCTCCGGCAAGGCTCAGGTAACATTACTGTGTTCTCGACTCAGTTCGTATTTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

629 aa · LXL04_030741|LXL04_030741|OH1004|PROTEIN

MHPGSLAIILLFLLSTPIAAVDFLFNSFNTTADLLLVRDARIEPPAIRLSNDSNQWSIGRAFYSPRLQMLRQGSGNITVFSTQFVFSILPEISSSPGFGIAFVLSNTTEPSGAIGGQYLGLFSNRAARNVAPLIAVEFDTGINTELNETDGNHVGIDLNNIESEVKVGAGYYNSTGSLIPVDMRNGQNVHAWIEFDGSRTEINVTIAPAGMSKPIRPLLTYTNPAIANYISSDMYVGFSASKTTWIEAQRVLAWSFSDTG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030741`
TK1151 ID	TkA07G427280
OH-1004 ID	LXL04_030741
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 71.065 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030741

位置 Chr06:121828270-121830159 (-)

描述 Similar to LECRKS1: L-type lectin-domain containing receptor kinase S.1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g15530`	参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。	暂无已核实直接文献
`At3g55550`	参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。	暂无已核实直接文献
`At4g29050`	L型凝集素结构域受体激酶 V.9。	暂无已核实直接文献
`At3g53810`	花粉发育期间必需。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0531400`	含凝集素结构域的受体激酶，参与盐胁迫反应。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030741 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:1901001 negative regulation of response to salt stress 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G15530

ath:AT3G53810

ath:AT3G55550

ath:AT4G29050

dosa:Os04g0531400

osa:4336489

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.854

排名 1 · LXL04_030741 · OH-1004

内质网0.086

排名 2 · LXL04_030741 · OH-1004

细胞质0.074

排名 3 · LXL04_030741 · OH-1004

细胞核0.041

排名 4 · LXL04_030741 · OH-1004

溶酶体／液泡0.033

排名 5 · LXL04_030741 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139.27Lectin_legB21-271 aa

PF00069.32Pkinase347-613 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr349-615 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030741	`PF00139.27`	Lectin_legB	21	271	1e-62	212.6
LXL04_030741	`PF00069.32`	Pkinase	347	613	6.4e-51	174.0
LXL04_030741	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	349	615	6.5e-47	160.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M9E0`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase S.1	61.513%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9M2S4`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase S.4	44.426%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9SZD5`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase V.9	41.623%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9M345`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.2	40.728%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q7XUN6`	水稻	L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2	42.741%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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