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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G026380
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 6796711-6802930 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2226 bp · TkA08G026380|TK1151|cDNA

CCCATGAATTTCTAAGTCCTTCTAGAAATTCCAGAATCACCGGTACCTCCATCGGTAATAATCATAACTCGATCATCACCTAGTCTCGGATTCTGAATCAGACATCACTCGCCTGAATCAATCTTCGTATTGATGCTACACCACCAACCACGATTCCGGACCTTCTGTATCATTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTCACAAAATTAATTACATTTTAAAATAAAAAAAAACAATTTACAAATTGGGCTTGGGCTAAAACTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1074 bp · TkA08G026380|TK1151|CDS

ATGGAAGCTGCCGCCAAAACTACGCCATGGTTCTCCTTGCCTTGGAAAAGACGCATTTTGTTTTCGGTAGTCTCCACCGCAATTGCAGTAGTTAGCCGGAGAGACGGCACCGTAAATCGGCGTCTCGTCAAATTCCTAGACTTCCGGACCCCGCCGACAACTAAACCGATCAACGGTGTCAAGACATACGACATCGTCGTAGATTCCTCTCGCAAGCTCTGGTTCCGAGTATTCGTGCCTGTACAACATGCAGTAGAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

357 aa · TkA08G026380|TK1151|PROTEIN

MEAAAKTTPWFSLPWKRRILFSVVSTAIAVVSRRDGTVNRRLVKFLDFRTPPTTKPINGVKTYDIVVDSSRKLWFRVFVPVQHAVEHLPVLVFFHGGGFVYLAPDKDIYDAFCRRIARKLPAIVVSVNYRLAPEHRYPEQHDDCFDVLKFLDDEENCLESLPEKTNISRCFLAGDSAGGNLVHHVAQRACEFNFQRLKVTGMLSIQPFFGGEERTNSEKLFEGRTPLASLKQTDWYWNAIMPPGESNNRDHPIINVSGPM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G026380
TK1151 IDTkA08G026380
OH-1004 IDLXL04_018109
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.678 / OH-1004 75.278
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G026380
位置Chr08:6796711-6802930 (+)
描述Similar to CXE18: Probable carboxylesterase 18
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g23530 对不同脂肪酸链长度的酯类发挥作用的羧基酯酶。 暂无已核实直接文献
At5g27320 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02748.x
Genetic characterization and functional analysis of the GID1 gibberellin receptors in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047415
Multiple loss-of-function of Arabidopsis gibberellin receptor AtGID1s completely shuts down a gibberellin signal.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03098.x
At3g63010 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02748.x
Genetic characterization and functional analysis of the GID1 gibberellin receptors in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047415
Multiple loss-of-function of Arabidopsis gibberellin receptor AtGID1s completely shuts down a gibberellin signal.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03098.x
At3g05120 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02748.x
Genetic characterization and functional analysis of the GID1 gibberellin receptors in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047415
Multiple loss-of-function of Arabidopsis gibberellin receptor AtGID1s completely shuts down a gibberellin signal.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03098.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0407500 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1 encodes a soluble receptor for gibberellin.2005 · DOI: 10.1038/nature04028
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018109 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0048444 floral organ morphogenesis 生物过程
GO:0048530 fruit morphogenesis 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1905516 positive regulation of fertilization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05120
ath:AT3G63010
ath:AT5G23530
ath:AT5G27320
dosa:Os05g0407500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.459
排名 1 · TkA08G026380 · TK1151
内质网0.248
排名 2 · TkA08G026380 · TK1151
细胞核0.165
排名 3 · TkA08G026380 · TK1151
细胞膜0.092
排名 4 · TkA08G026380 · TK1151
溶酶体／液泡0.077
排名 5 · TkA08G026380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10340Say1_Mug18069-184 aa
PF00135COesterase74-132 aa
PF20434BD-FAE80-186 aa
PF07224Chlorophyllase86-214 aa
PF07859Abhydrolase_391-313 aa
PF12146Hydrolase_4149-214 aa
PF00135COesterase171-185 aa
PF10340Say1_Mug180213-254 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G026380PF10340Say1_Mug180691844.5e-0729.8
TkA08G026380PF00135COesterase741321.1e-0731.9
TkA08G026380PF20434BD-FAE801862.7e-1040.9
TkA08G026380PF07224Chlorophyllase862140.002817.2
TkA08G026380PF07859Abhydrolase_3913132.2e-59201.5
TkA08G026380PF12146Hydrolase_41492140.04213.9
TkA08G026380PF00135COesterase1711851.1e-0731.9
TkA08G026380PF10340Say1_Mug1802132544.5e-0729.8
TkA08G026380PF12146Hydrolase_42723040.04213.9
TkA08G026380PF07442Ponericin2842970.2412.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LT10拟南芥sp|Q9LT10|CXE18_ARATH Probable carboxylesterase 1856.500%Swiss-Prot高置信
Q940G6拟南芥sp|Q940G6|GID1C_ARATH Gibberellin receptor GID1C39.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LYC1拟南芥sp|Q9LYC1|GID1B_ARATH Gibberellin receptor GID1B36.900%Swiss-Prot中等置信
Q9MAA7拟南芥sp|Q9MAA7|GID1A_ARATH Gibberellin receptor GID1A35.100%Swiss-Prot中等置信
Q6L545水稻sp|Q6L545|GID1_ORYSJ Gibberellin receptor GID134.400%Swiss-Prot中等置信

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