ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 50 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G407670
Chr04:102480771-102490240 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_027299
Chr06:12791351-12792427 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
60.000 查询 76.010 / 对象 89.385 |
TkA04G407670 | |
|
TkA04G407810
Chr04:102513679-102519997 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038227
Chr09:34690948-34697612 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.400 查询 100.000 / 对象 68.153 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G407810 |
|
TkA04G408010
Chr04:102587468-102589612 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038231
Chr09:34793528-34794935 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 80.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G408010 |
|
TkA04G408020
Chr04:102589923-102590270 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038232
Chr09:34795761-34797473 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 98.261 / 对象 19.825 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G408020 |
|
TkA04G408800
Chr04:102917414-102917875 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_020760
Chr04:108055299-108056016 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 90.667 |
TkA04G408800 | |
|
TkA04G408960
Chr04:102958301-102959004 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_009909
Chr02:135797087-135797791 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G408960 | |
|
TkA04G408990
Chr04:102978485-102988239 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039841
ChrUn:113538-117587 (-)
JAJTUU010000052.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.400 查询 88.321 / 对象 44.161 |
TkA04G408990 | |
|
TkA04G409010
Chr04:102996306-102997321 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038247
Chr09:35235946-35244958 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.900 查询 67.969 / 对象 37.826 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G409010 |
|
TkA04G409600
Chr04:103153808-103155516 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_013154
Chr03:25022904-25024743 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 99.003 |
TkA04G409600 | |
|
TkA04G409820
Chr04:103234940-103236208 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038252
Chr09:35441866-35444482 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 83.929 / 对象 49.735 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G409820 |
|
TkA04G410400
Chr04:103348870-103349578 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038260
Chr09:35574806-35579855 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 94.068 / 对象 56.345 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G410400 |
|
TkA04G412070
Chr04:103786933-103787624 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_001994
Chr01:38609811-38612529 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.400 查询 99.441 / 对象 69.825 |
TkA04G412070 | |
|
TkA04G413030
Chr04:104030629-104033048 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038272
Chr09:36205861-36209492 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 98.276 / 对象 82.609 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G413030 |
|
TkA04G413250
Chr04:104074997-104075356 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038278
Chr09:36266207-36266567 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
58.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G413250 |
|
TkA04G413600
Chr04:104165448-104167178 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_029038
Chr06:78707914-78708183 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.000 查询 36.296 / 对象 56.180 |
TkA04G413600 | |
|
TkA04G414070
Chr04:104258041-104259371 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038282
Chr09:36476158-36477024 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 42.439 / 对象 34.118 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G414070 |
|
TkA04G414200
Chr04:104293968-104297696 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038283
Chr09:36485869-36493077 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.800 查询 95.161 / 对象 65.238 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G414200 |
|
TkA04G414270
Chr04:104320202-104320604 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_026743
Chr06:2359944-2360345 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.700 查询 83.036 / 对象 94.898 |
TkA04G414270 | |
|
TkA04G414290
Chr04:104325196-104328852 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038286
Chr09:36509251-36512241 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 87.529 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G414290 |
|
TkA04G414860
Chr04:104475277-104475588 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_027380
Chr06:14550239-14550550 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G414860 | |
|
TkA04G414880
Chr04:104481805-104482197 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038294
Chr09:36717922-36719472 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 50.980 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G414880 |
|
TkA04G415210
Chr04:104587626-104591077 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038300
Chr09:36791644-36793194 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.400 查询 81.132 / 对象 50.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G415210 |
|
TkA04G418850
Chr04:105542902-105548874 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_029455
Chr06:91041657-91063499 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.500 查询 91.914 / 对象 35.588 |
TkA04G418850 | |
|
TkA04G419340
Chr04:105631970-105636872 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_020077
Chr04:51177557-51179570 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.800 查询 95.909 / 对象 97.183 |
TkA04G419340 | |
|
TkA04G419430
Chr04:105652530-105653132 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038346
Chr09:38292998-38297532 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.000 查询 100.000 / 对象 57.190 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G419430 |
|
TkA04G419460
Chr04:105664150-105673344 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038350
Chr09:38324414-38325232 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G419460 |
|
TkA04G419790
Chr04:105766691-105769637 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038358
Chr09:38508608-38511088 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 54.567 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G419790 |
|
TkA04G420040
Chr04:105824696-105826594 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_027210
Chr06:11121727-11123374 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G420040 | |
|
TkA04G420150
Chr04:105856162-105856527 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_009155
Chr02:118881681-118884598 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
57.500 查询 33.058 / 对象 27.027 |
TkA04G420150 | |
|
TkA04G420170
Chr04:105857808-105858200 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_001147
Chr01:21095217-21100121 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 93.396 / 对象 10.808 |
TkA04G420170 | |
|
TkA04G420180
Chr04:105861737-105862198 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038363
Chr09:38601388-38601849 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G420180 |
|
TkA04G420370
Chr04:105927916-105929755 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_007589
Chr02:53265337-53276248 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.800 查询 60.265 / 对象 23.214 |
TkA04G420370 | |
|
TkA04G420480
Chr04:105958202-105958513 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038370
Chr09:38736351-38740370 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 85.437 / 对象 26.347 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G420480 |
|
TkA04G420510
Chr04:105961916-105962723 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038370
Chr09:38736351-38740370 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 51.796 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G420510 |
|
TkA04G420850
Chr04:106058683-106059571 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_034316
Chr07:96286748-96293630 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.100 查询 68.456 / 对象 14.468 |
TkA04G420850 | |
|
TkA04G420900
Chr04:106087687-106088619 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038376
Chr09:38866242-38867168 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
72.300 查询 100.000 / 对象 99.675 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G420900 |
|
TkA04G422470
Chr04:106459220-106459579 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038379
Chr09:39054719-39055078 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G422470 |
|
TkA04G422600
Chr04:106515656-106516099 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038381
Chr09:39092802-39093740 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.900 查询 99.237 / 对象 41.667 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G422600 |
|
TkA04G422680
Chr04:106529738-106530310 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_032162
Chr07:17705563-17706440 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.400 查询 100.000 / 对象 75.397 |
TkA04G422680 | |
|
TkA04G423120
Chr04:106654684-106655145 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038363
Chr09:38601388-38601849 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00203 | TkA04G423120 |
|
TkA04G423480
Chr04:106747257-106749898 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038358
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CM104807.1
|
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99.700 查询 100.000 / 对象 87.019 |
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CM104807.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104803.1
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100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104799.1
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|
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TkA04G454930 |