同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00340

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 29

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00340

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00340 Chr08 87266151-88034379 Chr05 115617961-116360734 + High 29 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00340`	Chr08:87266151-88034379	Chr05:115617961-116360734	+	29	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 29 · 当前范围 1–29 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA08G340410 → LXL04_025706

96.9%

TkA08G340490 → LXL04_025707

100.0%

TkA08G340500 → LXL04_025708

98.3%

TkA08G340510 → LXL04_025709

100.0%

TkA08G340530 → LXL04_025710

100.0%

TkA08G340540 → LXL04_025711

98.4%

TkA08G340560 → LXL04_025712

99.2%

TkA08G340570 → LXL04_025713

99.1%

TkA08G340620 → LXL04_025714

99.0%

TkA08G340670 → LXL04_025715

98.9%

TkA08G341260 → LXL04_025717

91.4%

TkA08G341270 → LXL04_025718

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA08G340410`	`LXL04_025706`	`JCVI_TKOH_00340`	96.9	96.465 / 56.083	待复核
`TkA08G340490`	`LXL04_025707`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	94.118 / 24.513	待复核
`TkA08G340500`	`LXL04_025708`	`JCVI_TKOH_00340`	98.3	96.678 / 29.664	待复核
`TkA08G340510`	`LXL04_025709`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	62.329 / 80.531	Complex
`TkA08G340530`	`LXL04_025710`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G340540`	`LXL04_025711`	`JCVI_TKOH_00340`	98.4	98.93 / 82.96	Probable
`TkA08G340560`	`LXL04_025712`	`JCVI_TKOH_00340`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G340570`	`LXL04_025713`	`JCVI_TKOH_00340`	99.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G340620`	`LXL04_025714`	`JCVI_TKOH_00340`	99.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G340670`	`LXL04_025715`	`JCVI_TKOH_00340`	98.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G341260`	`LXL04_025717`	`JCVI_TKOH_00340`	91.4	100.0 / 95.044	Complex
`TkA08G341270`	`LXL04_025718`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G341370`	`LXL04_025719`	`JCVI_TKOH_00340`	97.1	99.174 / 85.106	Complex
`TkA08G341400`	`LXL04_025720`	`JCVI_TKOH_00340`	97.8	97.414 / 20.452	待复核
`TkA08G341420`	`LXL04_025721`	`JCVI_TKOH_00340`	70.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G341430`	`LXL04_025722`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G341490`	`LXL04_025723`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	92.713 / 10.538	待复核
`TkA08G341500`	`LXL04_025723`	`JCVI_TKOH_00340`	29.4	99.479 / 42.384	Complex
`TkA08G341550`	`LXL04_025726`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G341560`	`LXL04_025727`	`JCVI_TKOH_00340`	85.4	90.98 / 52.515	Complex
`TkA08G341610`	`LXL04_025728`	`JCVI_TKOH_00340`	86.8	98.78 / 96.0	Complex
`TkA08G342050`	`LXL04_025733`	`JCVI_TKOH_00340`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G342070`	`LXL04_025735`	`JCVI_TKOH_00340`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G342420`	`LXL04_025736`	`JCVI_TKOH_00340`	92.8	100.0 / 74.708	Complex
`TkA08G342490`	`LXL04_025739`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	96.838 / 87.814	Probable
`TkA08G342740`	`LXL04_025740`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G342800`	`LXL04_025742`	`JCVI_TKOH_00340`	83.1	100.0 / 100.0	待复核
`TkA08G342910`	`LXL04_025744`	`JCVI_TKOH_00340`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G343450`	`LXL04_025745`	`JCVI_TKOH_00340`	99.7	99.457 / 100.0	Complex