基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_025742
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 116203880-116205467
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA967 bp · LXL04_025742|LXL04_025742|OH1004|cDNA
ATGTATCAAGCTTGCTTCAATAACAAGTTCACGAATTCACTTGTGTACTACGTGTTATTGTCATTTTTACTTCTCATTTCACCTTTTCTTTTCATTTGGGAACTCATCACCACCCTCCCATCATGTTTCCAACCTATCGAAAACATGTCGGGGAAAGTGGTTTTGATCACCGGTGCTTCATCAGGACTCGGAGAGCTCATGGCTTACGAATATGCAAAAAGAGGTGCATGCCTAGCAATTGTAGCAATAAAAGAACTCGA...
CDS
下载 CDS FASTA954 bp · LXL04_025742|LXL04_025742|OH1004|CDS
ATGTATCAAGCTTGCTTCAATAACAAGTTCACGAATTCACTTGTGTACTACGTGTTATTGTCATTTTTACTTCTCATTTCACCTTTTCTTTTCATTTGGGAACTCATCACCACCCTCCCATCATGTTTCCAACCTATCGAAAACATGTCGGGGAAAGTGGTTTTGATCACCGGTGCTTCATCAGGACTCGGAGAGCTCATGGCTTACGAATATGCAAAAAGAGGTGCATGCCTAGCAATTGTAGCAATAAAAGAACTCGA...
317 aa · LXL04_025742|LXL04_025742|OH1004|PROTEIN
MYQACFNNKFTNSLVYYVLLSFLLLISPFLFIWELITTLPSCFQPIENMSGKVVLITGASSGLGELMAYEYAKRGACLAIVAIKELDSRLMQVADKALELGSPDVLFMFADVSKVEECRRFVDDTIKRFDRLDHLVCNAGIGNLYSVNIDVTKFAPVMDINFWGSIYPTHFAIPHLMRTGGKIVVNASSAGVLHPPKGGFYNASKAALIGFYESLRFEVSPRITITILTLGFIETRIITAKYLTSGVGGHLKKDFSSLLP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_025742 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_025742 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:116203880-116205467 (-) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to HSD7: 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase-like 4B | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006694 steroid biosynthetic process 生物过程 GO:0008202 steroid metabolic process 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005811 lipid droplet 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0004303 estradiol 17-beta-dehydrogenase [NAD(P)+] activity 分子功能 GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能 GO:0070524 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase (NADP+) activity 分子功能 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G50590 ath:AT5G50600 ath:AT5G50690 ath:AT5G50700 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.669
细胞质0.125
高尔基体0.093
细胞膜0.085
细胞核0.085
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00106.32adh_short52-238 aaPF13561.13adh_short_C258-238 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_025742 | PF00106.32 | adh_short | 52 | 238 | 6.3e-39 | 134.2 |
| LXL04_025742 | PF13561.13 | adh_short_C2 | 58 | 238 | 3.5e-25 | 89.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LUF2 | 拟南芥 | 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase-like 4B | 44.966% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
P0DKC7 | 拟南芥 | 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase-like 4A | 44.966% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
P0DKC6 | 拟南芥 | 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1B | 47.518% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
P0DKC5 | 拟南芥 | 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1A | 47.518% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |