同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00032

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 17

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00032

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00032 Chr01 114051662-114777679 Chr01 48667447-49353825 mixed High 17 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00032`	Chr01:114051662-114777679	Chr01:48667447-49353825	mixed	17	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 17 · 当前范围 1–17 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G456210 → LXL04_002438

98.9%

TkA01G456300 → LXL04_002439

100.0%

TkA01G456620 → LXL04_002443

99.6%

TkA01G456900 → LXL04_002446

100.0%

TkA01G457030 → LXL04_002447

99.5%

TkA01G457380 → LXL04_002449

95.0%

TkA01G457610 → LXL04_002454

98.9%

TkA01G457640 → LXL04_002457

99.5%

TkA01G457690 → LXL04_002459

100.0%

TkA01G457790 → LXL04_002460

99.2%

TkA01G458000 → LXL04_002461

97.8%

TkA01G458050 → LXL04_002463

95.8%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G456210`	`LXL04_002438`	`JCVI_TKOH_00032`	98.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G456300`	`LXL04_002439`	`JCVI_TKOH_00032`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G456620`	`LXL04_002443`	`JCVI_TKOH_00032`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G456900`	`LXL04_002446`	`JCVI_TKOH_00032`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G457030`	`LXL04_002447`	`JCVI_TKOH_00032`	99.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G457380`	`LXL04_002449`	`JCVI_TKOH_00032`	95.0	96.654 / 58.559	待复核
`TkA01G457610`	`LXL04_002454`	`JCVI_TKOH_00032`	98.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G457640`	`LXL04_002457`	`JCVI_TKOH_00032`	99.5	63.953 / 100.0	待复核
`TkA01G457690`	`LXL04_002459`	`JCVI_TKOH_00032`	100.0	100.0 / 65.217	Complex
`TkA01G457790`	`LXL04_002460`	`JCVI_TKOH_00032`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G458000`	`LXL04_002461`	`JCVI_TKOH_00032`	97.8	97.38 / 100.0	Complex
`TkA01G458050`	`LXL04_002463`	`JCVI_TKOH_00032`	95.8	93.588 / 90.724	Strict
`TkA01G458160`	`LXL04_002464`	`JCVI_TKOH_00032`	91.9	76.514 / 99.774	Probable
`TkA01G458170`	`LXL04_002465`	`JCVI_TKOH_00032`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G458220`	`LXL04_002466`	`JCVI_TKOH_00032`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G458330`	`LXL04_002469`	`JCVI_TKOH_00032`	94.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G458340`	`LXL04_002470`	`JCVI_TKOH_00032`	99.9	99.587 / 66.483	待复核