LXL04_002469 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_002469

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 49342894-49344969 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

747 bp · LXL04_002469|LXL04_002469|OH1004|cDNA

ATGGCAGTGGGGTTTAGGATAATGTGGTGTTGCTACTATGGTTCGAAGAAAAGAGGGTTGTCATTGGAAGAAAAGCGGGAAAAGATGCTTCAAATCTTTTACGACTCCCAAGATTTTTACCTTCTCAAAGAACTTGAAAAGTTGGGCCCTAGAAAAGGCGTTATCAGCCAATCTGTCAAAGATGTTGTCCAAACTCTAGTGGATGATGACTTGGTCTCAAAAGACAAGATAGGAACCTCGGTATACTTTTGGAGTCTTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

747 bp · LXL04_002469|LXL04_002469|OH1004|CDS

ATGGCAGTGGGGTTTAGGATAATGTGGTGTTGCTACTATGGTTCGAAGAAAAGAGGGTTGTCATTGGAAGAAAAGCGGGAAAAGATGCTTCAAATCTTTTACGACTCCCAAGATTTTTACCTTCTCAAAGAACTTGAAAAGTTGGGCCCTAGAAAAGGCGTTATCAGCCAATCTGTCAAAGATGTTGTCCAAACTCTAGTGGATGATGACTTGGTCTCAAAAGACAAGATAGGAACCTCGGTATACTTTTGGAGTCTTCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

248 aa · LXL04_002469|LXL04_002469|OH1004|PROTEIN

MAVGFRIMWCCYYGSKKRGLSLEEKREKMLQIFYDSQDFYLLKELEKLGPRKGVISQSVKDVVQTLVDDDLVSKDKIGTSVYFWSLPSCAGNQLRNMSKKLESDLEISKKRHMELVEQCESLKKGREDSDAREEALSEFKAIEQKYNNLKEELGQYADNDPATFEAMITKFRKFYDLILEEAIKVAHEAANRWTDNIFTLRQWCSNNFPQAKEQLEQLYNEVGITEDFDYLELPAVTPVTVKQVKADE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_002469`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_002469

位置 Chr01:49342894-49344969 (-)

描述 Similar to MND1: Meiotic nuclear division protein 1 homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g29170`	减数分裂过程中正确的同源染色体配对以及有效的交叉和基因内重组所必需的。	The Arabidopsis thaliana MND1 homologue plays a key role in meiotic homologous pairing, synapsis and recombination.2006 · DOI: 10.1242/jcs.02967 AtMND1 is required for homologous pairing during meiosis in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1186/1471-2199-7-24 The interplay of RecA-related proteins and the MND1-HOP2 complex during meiosis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1371/journal.pgen.0030176

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002469 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006302 double-strand break repair 生物过程

GO:0007129 homologous chromosome pairing at meiosis 生物过程

GO:0007131 reciprocal meiotic recombination 生物过程

GO:0009553 embryo sac development 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0010212 response to ionizing radiation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0003690 double-stranded DNA binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G29170

bta:618239

hsa:84057

mmu:76915

xla:108699336

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.617

排名 1 · LXL04_002469 · OH-1004

细胞质0.454

排名 2 · LXL04_002469 · OH-1004

线粒体0.046

排名 3 · LXL04_002469 · OH-1004

内质网0.037

排名 4 · LXL04_002469 · OH-1004

细胞膜0.036

排名 5 · LXL04_002469 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03962.22Mnd129-87 aa

PF18517.7LZ3wCH180-231 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_002469	`PF03962.22`	Mnd1	29	87	2.1e-25	89.4
LXL04_002469	`PF18517.7`	LZ3wCH	180	231	1.4e-20	73.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GYD2`	拟南芥	Meiotic nuclear division protein 1 homolog	68.880%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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