参考基因组比较

展示 TK1151 与 OH-1004 两个橡胶草材料的组装诊断、GFF 基因目录和后续同源/共线性 ID 对照入口。

TK1151 和 OH-1004 是同一物种不同材料,不是同一品种的简单版本升级。本模块定位为两个橡胶草参考基因组之间的基因同源与共线性 ID 对照。

比较概览

ID 对照记录
84884
TK1151 / OH-1004 基因层对照
共线性区块
427
JCVI/MCScanX 锚点区块
High 置信区块
302
高一致性块
Medium 置信区块
125
保留为辅助证据

参考组装摘要

TK1151 TK1151
TK1151_GWHBCHF00000000
gap 数: 1917 · 端粒扫描序列: 9
双端支持: 0
证据类型: GFF gene catalog + DIAMOND/RBH + JCVI/MCScanX anchors
OH-1004 OH1004
OH1004_GCA_047496595.1
gap 数: 131 · 端粒扫描序列: 711
双端支持: 0
证据类型: GFF gene catalog + DIAMOND/RBH + JCVI/MCScanX anchors

Gene 目录统计

参考材料基因数
TK1151TK115145224
OH1004OH-100440057

基因目录示例

参考基因组基因 ID位置描述
TK1151 TkAUNG000010 GWHBCHF00000001:2719-3172 TK1151
TK1151 TkAUNG000020 GWHBCHF00000001:3584-5635 TK1151
TK1151 TkAUNG000050 GWHBCHF00000001:9900-14018 TK1151
TK1151 TkAUNG000080 GWHBCHF00000001:22628-29341 TK1151
TK1151 TkAUNG000100 GWHBCHF00000001:41094-42316 TK1151
TK1151 TkAUNG000140 GWHBCHF00000001:51240-53271 TK1151