ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 71 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA07G095090
Chr07:24796072-24803665 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_037868
Chr09:23544405-23546074 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 86.577 / 对象 33.077 |
TkA07G095090 | |
|
TkA07G095290
Chr07:24846513-24856579 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_017885
Chr04:2861162-2864977 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.800 查询 64.062 / 对象 53.247 |
TkA07G095290 | |
|
TkA07G095670
Chr07:24948425-24950321 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027810
Chr06:24349569-24350897 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.500 查询 83.154 / 对象 98.354 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G095670 |
|
TkA07G095910
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GWHBCHF00000008
|
LXL04_038291
Chr09:36713217-36713593 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
57.900 查询 45.860 / 对象 73.786 |
TkA07G095910 | |
|
TkA07G095940
Chr07:25022100-25022822 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_029708
Chr06:97846390-97849918 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 85.833 / 对象 58.857 |
TkA07G095940 | |
|
TkA07G095980
Chr07:25026310-25028986 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027814
Chr06:24451617-24453002 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G095980 |
|
TkA07G096010
Chr07:25037921-25039213 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_026690
Chr06:1453349-1461181 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.300 查询 86.243 / 对象 99.390 |
TkA07G096010 | |
|
TkA07G096070
Chr07:25047509-25048357 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027824
Chr06:24525478-24526326 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G096070 |
|
TkA07G097140
Chr07:25351072-25352240 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_026775
Chr06:2757414-2758284 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA07G097140 | |
|
TkA07G097910
Chr07:25552788-25557460 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027861
Chr06:24926087-24930319 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 99.395 / 对象 68.189 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G097910 |
|
TkA07G098460
Chr07:25693720-25694739 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_002430
Chr01:48548442-48550010 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
71.400 查询 100.000 / 对象 63.602 |
JCVI_TKOH_00292 | TkA07G098460 |
|
TkA07G099540
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GWHBCHF00000008
|
LXL04_027876
Chr06:25379350-25381334 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.000 查询 91.087 / 对象 91.189 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G099540 |
|
TkA07G099550
Chr07:25968463-25972235 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027877
Chr06:25381363-25383324 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.300 查询 76.684 / 对象 59.200 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G099550 |
|
TkA07G100310
Chr07:26140603-26141648 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027884
Chr06:25545375-25547015 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 54.930 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G100310 |
|
TkA07G100700
Chr07:26236337-26237199 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_034865
Chr08:5428347-5431513 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.107 / 对象 44.758 |
TkA07G100700 | |
|
TkA07G101430
Chr07:26381108-26381927 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027889
Chr06:25780459-25784290 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 92.169 / 对象 37.871 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G101430 |
|
TkA07G101440
Chr07:26383013-26384068 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_000340
Chr01:6379027-6380082 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA07G101440 | |
|
TkA07G101770
Chr07:26461211-26461745 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027892
Chr06:25835761-25838280 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 94.958 / 对象 16.992 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G101770 |
|
TkA07G101810
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|
LXL04_027894
Chr06:25859376-25868537 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 98.837 / 对象 10.918 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G101810 |
|
TkA07G101930
Chr07:26504836-26505628 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027894
Chr06:25859376-25868537 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 98.256 / 对象 10.854 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G101930 |
|
TkA07G101950
Chr07:26505872-26507415 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027895
Chr06:25886045-25890123 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 94.595 / 对象 32.209 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G101950 |
|
TkA07G102060
Chr07:26536125-26537960 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027900
Chr06:25939394-25941418 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 85.160 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G102060 |
|
TkA07G102270
Chr07:26605366-26606510 (+)
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|
LXL04_027902
Chr06:25991759-25996377 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.200 查询 97.721 / 对象 61.969 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G102270 |
|
TkA07G103490
Chr07:26926126-26934098 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027906
Chr06:26285909-26289766 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 100.000 / 对象 45.905 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G103490 |
|
TkA07G105080
Chr07:27293712-27294029 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_007549
Chr02:51833191-51836772 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
68.100 查询 65.714 / 对象 39.535 |
TkA07G105080 | |
|
TkA07G106350
Chr07:27596832-27602186 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027928
Chr06:26945346-26949798 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G106350 |
|
TkA07G106620
Chr07:27682283-27683086 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_029856
Chr06:102208344-102217559 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.100 查询 71.930 / 对象 28.929 |
TkA07G106620 | |
|
TkA07G106720
Chr07:27711135-27712166 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027932
Chr06:27051390-27056876 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
68.000 查询 94.776 / 对象 38.788 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G106720 |
|
TkA07G106960
Chr07:27768186-27774531 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027935
Chr06:27111385-27117414 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 55.529 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G106960 |
|
TkA07G107110
Chr07:27824219-27824861 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_017016
Chr03:138915127-138915785 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA07G107110 | |
|
TkA07G108000
Chr07:27998604-27999347 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_001232
Chr01:22463563-22464306 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA07G108000 | |
|
TkA07G108240
Chr07:28054404-28055782 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027945
Chr06:27450316-27453286 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.600 查询 100.000 / 对象 54.485 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G108240 |
|
TkA07G108310
Chr07:28069105-28070867 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_023497
Chr05:45539476-45543760 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 48.899 |
TkA07G108310 | |
|
TkA07G108950
Chr07:28237714-28238637 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_005270
Chr01:159361179-159364610 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
72.700 查询 64.646 / 对象 56.221 |
TkA07G108950 | |
|
TkA07G108960
Chr07:28239839-28242503 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027954
Chr06:27627687-27629882 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 66.574 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G108960 |
|
TkA07G109520
Chr07:28364983-28366751 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027960
Chr06:27752036-27753717 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 92.493 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G109520 |
|
TkA07G109560
Chr07:28376053-28377897 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027959
Chr06:27743659-27748817 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 97.283 / 对象 30.703 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G109560 |
|
TkA07G109870
Chr07:28438186-28440004 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027964
Chr06:27816100-27816868 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G109870 |
|
TkA07G109890
Chr07:28446472-28447929 (-)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027965
Chr06:27823373-27826261 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 50.832 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G109890 |
|
TkA07G110020
Chr07:28482786-28485882 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027969
Chr06:27866151-27872426 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
64.200 查询 75.879 / 对象 34.160 |
JCVI_TKOH_00304 | TkA07G110020 |
|
TkA07G110940
Chr07:28741007-28744858 (+)
GWHBCHF00000008
|
LXL04_027987
Chr06:28200443-28204680 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.700 查询 74.277 / 对象 77.778 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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CM104804.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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CM104804.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.500 查询 97.727 / 对象 68.421 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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61.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104804.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.231 / 对象 31.311 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00305 | TkA07G139670 |