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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G103490
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 26926126-26934098 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1570 bp · TkA07G103490|TK1151|cDNA

CGGCAGGTCACGTATCTGTGTCATTCCCGCGTACACAACCTTCCACTAACGACAAACCGGTTTGCCAACAAGAAGTCTATTTTAAATACATTCAGTCCTTCTCCCATTCTAAACCAAATATACAAAATGAAAACCACTCCCTCTACCCTTGTAACCAAAACGTTACAATGCTTATTGTCACTCCACCATATTCTAACATGCGCTTACCACTGGTCTCGAACCACACTCTTTTCATTTCTTCGGGTTGTTTCTCCTTCGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

642 bp · TkA07G103490|TK1151|CDS

ATGTTAGGGTACTTGGTTTTAGCCAACTTGGAAACTCGAAATCCTACAAATCGCCCAGAAAGCTACGATCTTCTTTTCACCGCCGTCTCAGCTGTGACTGTGTCTAGCATGACCACAGTTGAGATGGAGGTTTTCTCGAATACCCAACTCTTTTGTTTGGCTATTTTGATGCTTTTGGGCGGAGAAGTTTTCACCTCGATGCTTGAACTTCAAGTCCAGAAATTTAAGTTGTTCGAAAAGATCAAAAGACATGCCACCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

213 aa · TkA07G103490|TK1151|PROTEIN

MLGYLVLANLETRNPTNRPESYDLLFTAVSAVTVSSMTTVEMEVFSNTQLFCLAILMLLGGEVFTSMLELQVQKFKLFEKIKRHATSNAKIENGSVPSNTNVDLKYNSIKFLGVIAFGYFLIVQVSGFLLVSLYVGIVSSAKEVLTHKKLNVQVFSIVTTISTFTNCGFLPTNENMMVFRKNLGLLVILIPLSLLGNTLYPVFPDWCYYFLGR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G103490
TK1151 IDTkA07G103490
OH-1004 IDLXL04_027906
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 45.905
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G103490
位置Chr07:26926126-26934098 (-)
描述Similar to HKT1: Sodium transporter HKT1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10310 钠转运蛋白，在植物耐盐性中发挥核心作用。
The Arabidopsis HKT1 gene homolog mediates inward Na(+) currents in xenopus laevis oocytes and Na(+) uptake in Saccharomyces cerevisiae.2000 · DOI: 10.1104/pp.122.4.1249
AtHKT1 is a salt tolerance determinant that controls Na(+) entry into plant roots.2001 · DOI: 10.1073/pnas.241501798
Glycine residues in potassium channel-like selectivity filters determine potassium selectivity in four-loop-per-subunit HKT transporters from plants.2002 · DOI: 10.1073/pnas.082123799
Altered shoot/root Na+ distribution and bifurcating salt sensitivity in Arabidopsis by genetic disruption of the Na+ transporter AtHKT1.2002 · DOI: 10.1016/s0014-5793(02)03488-9
Functional analysis of AtHKT1 in Arabidopsis shows that Na(+) recirculation by the phloem is crucial for salt tolerance.2003 · DOI: 10.1093/emboj/cdg207
AtHKT1 facilitates Na+ homeostasis and K+ nutrition in planta.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.042234
Microarray-based rapid cloning of an ion accumulation deletion mutant in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0404780101

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YGP9 似乎参与钾-钠稳态的调节。 暂无已核实直接文献
Os06g0701700 似乎参与钾-钠稳态的调节。
Two types of HKT transporters with different properties of Na+ and K+ transport in Oryza sativa.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01077.x
Glycine residues in potassium channel-like selectivity filters determine potassium selectivity in four-loop-per-subunit HKT transporters from plants.2002 · DOI: 10.1073/pnas.082123799
Sodium transport and HKT transporters: the rice model.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01764.x
Rice OsHKT2;1 transporter mediates large Na+ influx component into K+-starved roots for growth.2007 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7601732
Diversity in expression patterns and functional properties in the rice HKT transporter family.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.138008
A role for the OsHKT 2;1 sodium transporter in potassium use efficiency in rice.2020 · DOI: 10.1093/jxb/erz113
UniProt: Q93XI5 似乎参与钾-钠稳态的调节。 暂无已核实直接文献
Os04g0607600 可能的阳离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027906 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0035725 sodium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0008324 monoatomic cation transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015079 potassium ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G10310
dosa:Os02g0175000
dosa:Os06g0701700
osa:4328468
osa:4341971
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.754
排名 1 · TkA07G103490 · TK1151
内质网0.103
排名 2 · TkA07G103490 · TK1151
细胞质0.101
排名 3 · TkA07G103490 · TK1151
溶酶体／液泡0.061
排名 4 · TkA07G103490 · TK1151
线粒体0.048
排名 5 · TkA07G103490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02386TrkH19-203 aa
PF15706TMEM132_C31-59 aa
PF15706TMEM132_C113-140 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G103490PF02386TrkH192031.9e-1350.5
TkA07G103490PF15706TMEM132_C31590.05913.8
TkA07G103490PF15706TMEM132_C1131400.05913.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84TI7拟南芥sp|Q84TI7|HKT1_ARATH Sodium transporter HKT148.000%Swiss-Prot中等置信
A2YGP9水稻sp|A2YGP9|HKT21_ORYSI Cation transporter HKT2;141.400%Swiss-Prot中等置信
Q0D9S3水稻sp|Q0D9S3|HKT21_ORYSJ Cation transporter HKT2;141.400%Swiss-Prot中等置信
Q93XI5水稻sp|Q93XI5|HKT22_ORYSI Cation transporter HKT2;240.900%Swiss-Prot中等置信
Q7XPF7水稻sp|Q7XPF7|HKT14_ORYSJ Probable cation transporter HKT1;442.100%Swiss-Prot中等置信

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