ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 58 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA05G414340
Chr05:103091946-103106164 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021657
Chr04:134333396-134352230 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
45.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G414340 |
|
TkA05G414380
Chr05:103117885-103119416 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021659
Chr04:134359824-134361125 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 78.736 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G414380 |
|
TkA05G414390
Chr05:103119826-103125352 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_035253
Chr08:18544040-18545841 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
60.500 查询 97.880 / 对象 98.828 |
TkA05G414390 | |
|
TkA05G414540
Chr05:103157329-103157884 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021661
Chr04:134419620-134420175 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G414540 |
|
TkA05G415210
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GWHBCHF00000006
|
LXL04_021669
Chr04:134584784-134594133 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 99.707 / 对象 42.184 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G415210 |
|
TkA05G416040
Chr05:103529563-103531785 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021688
Chr04:135194935-135196935 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 64.550 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416040 |
|
TkA05G416430
Chr05:103633683-103634102 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021692
Chr04:135269681-135270318 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.683 / 对象 84.177 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416430 |
|
TkA05G416440
Chr05:103635470-103636384 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021698
Chr04:135515287-135516885 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 100.000 / 对象 57.331 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416440 |
|
TkA05G416540
Chr05:103671854-103672240 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021703
Chr04:135596311-135603975 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 94.531 / 对象 22.491 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416540 |
|
TkA05G416550
Chr05:103673624-103674106 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021703
Chr04:135596311-135603975 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.625 / 对象 28.439 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416550 |
|
TkA05G416570
Chr05:103675421-103675750 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_030659
Chr06:120385814-120386629 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.800 查询 85.321 / 对象 33.579 |
TkA05G416570 | |
|
TkA05G416590
Chr05:103679086-103679565 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021703
Chr04:135596311-135603975 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 29.554 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416590 |
|
TkA05G416620
Chr05:103692230-103696816 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021705
Chr04:135618185-135621305 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.500 查询 81.953 / 对象 68.276 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416620 |
|
TkA05G416630
Chr05:103697801-103703604 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021706
Chr04:135623807-135628468 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.600 查询 88.350 / 对象 49.524 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416630 |
|
TkA05G416720
Chr05:103724183-103729086 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021710
Chr04:135661961-135666369 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.900 查询 86.689 / 对象 42.705 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416720 |
|
TkA05G416750
Chr05:103733857-103736635 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021711
Chr04:135667863-135669116 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.400 查询 95.261 / 对象 71.875 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G416750 |
|
TkA05G416840
Chr05:103764054-103764419 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_017420
Chr03:148608437-148609159 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.700 查询 100.000 / 对象 58.738 |
TkA05G416840 | |
|
TkA05G417150
Chr05:103830081-103830392 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021714
Chr04:135767544-135768584 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 29.769 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417150 |
|
TkA05G417520
Chr05:103930341-103930931 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021725
Chr04:135939572-135940159 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417520 |
|
TkA05G417570
Chr05:103949633-103950118 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021726
Chr04:135951579-135959651 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 47.774 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417570 |
|
TkA05G417580
Chr05:103950451-103951956 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019062
Chr04:22923959-22924739 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G417580 | |
|
TkA05G417610
Chr05:103961947-103965777 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021730
Chr04:135971424-135975254 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417610 |
|
TkA05G417740
Chr05:103994254-103994789 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021734
Chr04:136037527-136038279 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 94.040 / 对象 56.800 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417740 |
|
TkA05G417840
Chr05:104040620-104041845 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021739
Chr04:136080243-136084012 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.700 查询 100.000 / 对象 33.946 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417840 |
|
TkA05G417940
Chr05:104054279-104054728 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021740
Chr04:136094016-136096143 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 99.329 / 对象 30.390 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G417940 |
|
TkA05G418740
Chr05:104316182-104319021 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021758
Chr04:136365817-136367633 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 97.525 / 对象 97.044 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G418740 |
|
TkA05G419110
Chr05:104390944-104396486 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021759
Chr04:136440505-136444666 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 47.791 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G419110 |
|
TkA05G419520
Chr05:104497909-104498346 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021764
Chr04:136564945-136569021 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.100 查询 70.345 / 对象 41.296 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G419520 |
|
TkA05G419620
Chr05:104515938-104517578 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021765
Chr04:136569157-136569810 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 43.070 / 对象 91.244 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G419620 |
|
TkA05G419820
Chr05:104567042-104567359 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_032026
Chr07:15124595-15127866 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
58.100 查询 58.095 / 对象 44.928 |
TkA05G419820 | |
|
TkA05G419890
Chr05:104588770-104595005 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021772
Chr04:136690612-136696125 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.300 查询 99.907 / 对象 96.942 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G419890 |
|
TkA05G420300
Chr05:104689165-104698779 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021776
Chr04:136759331-136771836 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 95.806 / 对象 49.661 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G420300 |
|
TkA05G420750
Chr05:104817305-104817753 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021783
Chr04:136891454-136892160 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 93.023 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G420750 |
|
TkA05G421250
Chr05:104963847-104964688 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021791
Chr04:137017457-137021565 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.200 查询 81.739 / 对象 38.367 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G421250 |
|
TkA05G421600
Chr05:105067762-105070495 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021794
Chr04:137032007-137034477 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
63.900 查询 85.185 / 对象 71.429 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G421600 |
|
TkA05G421800
Chr05:105133428-105140833 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021796
Chr04:137042643-137048785 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.100 查询 99.904 / 对象 65.801 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G421800 |
|
TkA05G422530
Chr05:105296612-105301715 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021788
Chr04:137002807-137006387 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 99.618 / 对象 58.916 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G422530 |
|
TkA05G422570
Chr05:105308215-105308661 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_014055
Chr03:41318919-41321184 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.000 查询 79.710 / 对象 33.520 |
TkA05G422570 | |
|
TkA05G422670
Chr05:105340179-105341579 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019613
Chr04:35243378-35244778 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G422670 | |
|
TkA05G423120
Chr05:105486503-105487274 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_001355
Chr01:24630912-24634483 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 99.379 / 对象 39.604 |
TkA05G442390 | |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 53.091 |
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96.500 查询 100.000 / 对象 6.532 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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97.400 查询 100.000 / 对象 65.411 |
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83.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
65.400 查询 82.290 / 对象 80.885 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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64.100 查询 99.153 / 对象 48.131 |
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97.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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48.900 查询 95.000 / 对象 93.151 |
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92.300 查询 99.185 / 对象 49.660 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.495 / 对象 51.842 |
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