TkA05G421600 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G421600

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 105067762-105070495 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

570 bp · TkA05G421600|TK1151|cDNA

ATGAACAGTTTCGCAGTGAACATGCGAATTTCGCAAACAGCTTTTCTTGTACAGCGAATCCCATCGGCGATCTATCCTCAGTTTAACTGCATGATCTTCATGATTTCAACAAGCATTGGTACATCTTCTGTTTCCTGTAAAGCGGGAAACAAGAACAACTTCCCTTTCTGGATTCCCATTTACCTATTTTCAAGATTCTCTGGGATTCAATGGCTTTACAAGAGCTTGAAGAATCTCCTTTTTGTTGATGTTGTTGATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

570 bp · TkA05G421600|TK1151|CDS

ATGAACAGTTTCGCAGTGAACATGCGAATTTCGCAAACAGCTTTTCTTGTACAGCGAATCCCATCGGCGATCTATCCTCAGTTTAACTGCATGATCTTCATGATTTCAACAAGCATTGGTACATCTTCTGTTTCCTGTAAAGCGGGAAACAAGAACAACTTCCCTTTCTGGATTCCCATTTACCTATTTTCAAGATTCTCTGGGATTCAATGGCTTTACAAGAGCTTGAAGAATCTCCTTTTTGTTGATGTTGTTGATGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

189 aa · TkA05G421600|TK1151|PROTEIN

MNSFAVNMRISQTAFLVQRIPSAIYPQFNCMIFMISTSIGTSSVSCKAGNKNNFPFWIPIYLFSRFSGIQWLYKSLKNLLFVDVVDDDDDDYDGSLDYTLASMLLRPGPICALLNAQFPEVNEDVKNVPRVYIKTLYDRVVKPEQQEKMIAKWPPSHVYSLESDHSPNFSSPFALFGLLVKVAASVGCT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G421600`
TK1151 ID	TkA05G421600
OH-1004 ID	LXL04_021794
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	63.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 85.185 / OH-1004 71.429 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G421600

位置 Chr05:105067762-105070495 (-)

描述 Similar to MES17: Methylesterase 17

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g10870`	甲酯酶，可高效且特异性地将吲哚-3-乙酸甲酯（MeIAA）水解为生长素吲哚-3-乙酸（IAA）。	Inactive methyl indole-3-acetic acid ester can be hydrolyzed and activated by several esterases belonging to the AtMES esterase family of Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.118224

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021794 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程

GO:0009696 salicylic acid metabolic process 生物过程

GO:0010150 leaf senescence 生物过程

GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程

GO:0031408 oxylipin biosynthetic process 生物过程

GO:0033310 chlorophyll a catabolic process 生物过程

GO:0033473 indoleacetic acid conjugate metabolic process 生物过程

GO:0045727 positive regulation of translation 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ag:BAE54383

ath:AT3G08720

ath:AT3G10870

ath:AT4G16690

ath:AT5G58310

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.318

排名 1 · TkA05G421600 · TK1151

细胞核0.232

排名 2 · TkA05G421600 · TK1151

内质网0.183

排名 3 · TkA05G421600 · TK1151

线粒体0.109

排名 4 · TkA05G421600 · TK1151

溶酶体／液泡0.107

排名 5 · TkA05G421600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SG92`	拟南芥	sp\|Q9SG92\|MES17_ARATH Methylesterase 17	60.900%	Swiss-Prot	低置信

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