TkA05G432660 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G432660

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 107942223-107944716 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2116 bp · TkA05G432660|TK1151|cDNA

GCCCGCGATACACATCAACAGAACTCGCGCCAATTTGTGTAGGAGCTGTAACCTTCTGCATATCTTTTCGGATCTAAATTGTGCTGGTGAATAGTGTTTGAGGATGGCCGGGAAAGGTGAAGGTCCGGCGATCGGAATTGATCTAGGTACGACGTATTCATGCGTCGGAGTGTGGCAGCATGATCGAGTTGAGATCATCGCGAATGATCAAGGCAACAGGACGACTCCTTCTTATGTTGCGTTTACGGATTCCGAGCGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1950 bp · TkA05G432660|TK1151|CDS

ATGGCCGGGAAAGGTGAAGGTCCGGCGATCGGAATTGATCTAGGTACGACGTATTCATGCGTCGGAGTGTGGCAGCATGATCGAGTTGAGATCATCGCGAATGATCAAGGCAACAGGACGACTCCTTCTTATGTTGCGTTTACGGATTCCGAGCGTCTAATTGGTGATGCTGCTAAGAATCAGGTCGCCATGAATCCTATGAACACGGTCTTCGATGCAAAGCGACTAATTGGAAGGAGATTCAGCGACGCATCTGTTCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

649 aa · TkA05G432660|TK1151|PROTEIN

MAGKGEGPAIGIDLGTTYSCVGVWQHDRVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDSERLIGDAAKNQVAMNPMNTVFDAKRLIGRRFSDASVQDDMKLWPFKITPGPAEKPMIGVDYKGESKQFAAEEISSMVLIKMREIAEAFVGSTVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKAASVGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEEGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFVQEFKRKHKKDIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G432660`
TK1151 ID	TkA05G432660
OH-1004 ID	LXL04_021942
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 25.622 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G432660

位置 Chr05:107942223-107944716 (+)

描述 Similar to HSP70-1: Heat shock 70 kDa protein 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g12580`	与其他伴侣蛋白合作，Hsp70 是关键组分，可促进新合成蛋白的折叠，协助前体蛋白转运进入细胞器，并负责在应激条件下降解受损蛋白（可能）。	Comprehensive expression profile analysis of the Arabidopsis Hsp70 gene family.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.789 Heat shock protein cognate 70-4 and an E3 ubiquitin ligase, CHIP, mediate plastid-destined precursor degradation through the ubiquitin-26S proteasome system in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.071548
`At5g02490`	在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021942 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0006950 response to stress 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009615 response to virus 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程

GO:0010286 heat acclimation 生物过程

GO:0042026 protein refolding 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0090332 stomatal closure 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G02490

ath:AT5G02500

sly:101247772

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.610

排名 1 · TkA05G432660 · TK1151

细胞核0.403

排名 2 · TkA05G432660 · TK1151

细胞膜0.124

排名 3 · TkA05G432660 · TK1151

线粒体0.089

排名 4 · TkA05G432660 · TK1151

内质网0.079

排名 5 · TkA05G432660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01968Hydantoinase_A5-31 aa

PF00012HSP709-618 aa

PF06723MreB_Mbl9-67 aa

PF06723MreB_Mbl142-380 aa

PF01968Hydantoinase_A179-217 aa

PF02782FGGY_C317-385 aa

PF06723MreB_Mbl533-570 aa

PF01968Hydantoinase_A558-586 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G432660	`PF01968`	Hydantoinase_A	5	31	6.4	6.6
TkA05G432660	`PF00012`	HSP70	9	618	2.6e-260	865.5
TkA05G432660	`PF06723`	MreB_Mbl	9	67	1e-14	54.8
TkA05G432660	`PF06723`	MreB_Mbl	142	380	1e-14	54.8
TkA05G432660	`PF01968`	Hydantoinase_A	179	217	6.4	6.6
TkA05G432660	`PF02782`	FGGY_C	317	385	0.04	14.5
TkA05G432660	`PF06723`	MreB_Mbl	533	570	1e-14	54.8
TkA05G432660	`PF01968`	Hydantoinase_A	558	586	6.4	6.6
TkA05G432660	`PF15590`	Imm27	576	604	0.18	12.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LHA8`	拟南芥	sp\|Q9LHA8\|HS704_ARATH Heat shock 70 kDa protein 4	87.700%	Swiss-Prot	高置信
`P22954`	拟南芥	sp\|P22954\|HS702_ARATH Heat shock 70 kDa protein 2	87.900%	Swiss-Prot	高置信

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