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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G442910
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 110650594-110653529 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1623 bp · TkA05G442910|TK1151|cDNA

GAATCGTTCGTGTTTCGGAGAAAAGAAAAGCGGATGGATTACGATGGAAAGCGAGGGTTACGGATTGATAGAATCCCTCCTAACTTTCCTCCCAAATCGGGGGGATAAGGAGGGAGATGATCTCACGTCGCATCCGATTTTTCCCTCCATTATAAACCATCTTCCCGTATTCATCTCCCACCCCCACGAAATCATATTTTTGCTGTTGTGTTCTTCAACATTGGGATTCCTTCTCTGCTGCCCTTCGCTGTTGCGGTGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

681 bp · TkA05G442910|TK1151|CDS

ATGATTGCTGTATGCAGATTGATGATTATAGATGCTAACTTGTGCGAGGCGAACCTGCAGCTACTGTTCACAGTAGTTGAGAGTGCACCATCAGAAACAGTTAGGTCCAACTGTACAATTGCACTTGGTGACCTGGCAGTTAGGTTTCCGAACCTTCTAGAACCTTGGACAAAAAACATGTACGCAAGGCTTCATGATCCTTCGGTTTCTGTTAGAACAAATGTTGTTTTGGTTCTCTCTCACCTCATTCTCAATGACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

227 aa · TkA05G442910|TK1151|PROTEIN

MIAVCRLMIIDANLCEANLQLLFTVVESAPSETVRSNCTIALGDLAVRFPNLLEPWTKNMYARLHDPSVSVRTNVVLVLSHLILNDMMKVKEHINEMAMRLEDENERISNLAKLFFNELSKKGNNPIYNLLPDILGKLSNQDLKRESFFNIMQFLIGSIKKDKQMEALVEKFCHRFSGVTDARQWENISYCLSQLSFTDKGIKKLIDLFKVYEHVLSNETVMDHFRT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G442910
TK1151 IDTkA05G442910
OH-1004 IDLXL04_018482
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 6.532
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G442910
位置Chr05:110650594-110653529 (+)
描述Similar to TY3B-I: Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein (Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g57060 必需蛋白。
The Arabidopsis CAP-D proteins are required for correct chromatin organisation, growth and fertility.2013 · DOI: 10.1007/s00412-013-0424-y
The condensin complexes play distinct roles to ensure normal chromosome morphogenesis during meiotic division in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12628

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018482 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006325 chromatin organization 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0007076 mitotic chromosome condensation 生物过程
GO:0010032 meiotic chromosome condensation 生物过程
GO:0015074 DNA integration 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0075523 viral translational frameshifting 生物过程
GO:0000779 condensed chromosome, centromeric region 细胞组分
GO:0000796 condensin complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G57060
sce:YGR109W-B
sce:YIL082W-A
spo:2542672
spo:2542797
spo:2543673
spo:3361218
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.682
排名 1 · TkA05G442910 · TK1151
细胞质0.346
排名 2 · TkA05G442910 · TK1151
高尔基体0.070
排名 3 · TkA05G442910 · TK1151
内质网0.044
排名 4 · TkA05G442910 · TK1151
细胞膜0.037
排名 5 · TkA05G442910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01602Adaptin_N8-105 aa
PF25567TPR_SYO110-49 aa
PF13646HEAT_221-104 aa
PF02985HEAT29-46 aa
PF20168PDS532-173 aa
PF21581SCD32-88 aa
PF12717Cnd133-193 aa
PF07840FadR_C61-131 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G442910PF01602Adaptin_N81050.0001121.7
TkA05G442910PF25567TPR_SYO110490.004417.4
TkA05G442910PF13646HEAT_2211040.1213.4
TkA05G442910PF02985HEAT29460.0001822.2
TkA05G442910PF20168PDS5321739.1e-0624.5
TkA05G442910PF21581SCD32880.01116.7
TkA05G442910PF12717Cnd1331939e-50169.6
TkA05G442910PF07840FadR_C611310.03614.7
TkA05G442910PF02985HEAT62830.0001822.2
TkA05G442910PF25567TPR_SYO166840.004417.4
TkA05G442910PF02985HEAT1011080.0001822.2
TkA05G442910PF25567TPR_SYO11351700.004417.4
TkA05G442910PF21581SCD1591760.01116.7
TkA05G442910PF02985HEAT1881960.0001822.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A0A1I9LM04拟南芥sp|A0A1I9LM04|CNDD2_ARATH Condensin-1 complex subunit CAP-D276.700%Swiss-Prot高置信

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