同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00288

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00288

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00288 Chr06 118328041-119062341 Chr05 118515-757855 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00288`	Chr06:118328041-119062341	Chr05:118515-757855	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G477650 → LXL04_022537

88.4%

TkA06G477730 → LXL04_022535

78.8%

TkA06G479290 → LXL04_022531

100.0%

TkA06G479560 → LXL04_022530

100.0%

TkA06G479570 → LXL04_022529

97.6%

TkA06G479590 → LXL04_022529

99.8%

TkA06G479600 → LXL04_022528

97.1%

TkA06G479610 → LXL04_022527

93.6%

TkA06G479620 → LXL04_022527

86.0%

TkA06G479680 → LXL04_022526

95.7%

TkA06G479920 → LXL04_022524

58.8%

TkA06G480070 → LXL04_022526

99.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G477650`	`LXL04_022537`	`JCVI_TKOH_00288`	88.4	57.255 / 95.639	Complex
`TkA06G477730`	`LXL04_022535`	`JCVI_TKOH_00288`	78.8	51.212 / 27.875	待复核
`TkA06G479290`	`LXL04_022531`	`JCVI_TKOH_00288`	100.0	90.8 / 46.708	待复核
`TkA06G479560`	`LXL04_022530`	`JCVI_TKOH_00288`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G479570`	`LXL04_022529`	`JCVI_TKOH_00288`	97.6	100.0 / 33.017	待复核
`TkA06G479590`	`LXL04_022529`	`JCVI_TKOH_00288`	99.8	100.0 / 51.465	待复核
`TkA06G479600`	`LXL04_022528`	`JCVI_TKOH_00288`	97.1	100.0 / 93.498	待复核
`TkA06G479610`	`LXL04_022527`	`JCVI_TKOH_00288`	93.6	79.915 / 26.342	Complex
`TkA06G479620`	`LXL04_022527`	`JCVI_TKOH_00288`	86.0	75.354 / 21.681	Complex
`TkA06G479680`	`LXL04_022526`	`JCVI_TKOH_00288`	95.7	96.667 / 10.061	待复核
`TkA06G479920`	`LXL04_022524`	`JCVI_TKOH_00288`	58.8	75.837 / 53.311	Complex
`TkA06G480070`	`LXL04_022526`	`JCVI_TKOH_00288`	99.3	100.0 / 11.709	待复核
`TkA06G480080`	`LXL04_022526`	`JCVI_TKOH_00288`	93.7	100.0 / 27.493	Complex
`TkA06G480110`	`LXL04_022524`	`JCVI_TKOH_00288`	99.7	94.906 / 39.073	待复核
`TkA06G480260`	`LXL04_022526`	`JCVI_TKOH_00288`	90.0	27.094 / 9.54	Complex
`TkA06G480290`	`LXL04_022527`	`JCVI_TKOH_00288`	48.1	85.324 / 23.446	Complex