同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00239

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00239

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00239 Chr05 68859415-71469116 Chr04 100354422-102753803 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00239`	Chr05:68859415-71469116	Chr04:100354422-102753803	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA05G278520 → LXL04_020635

100.0%

TkA05G278530 → LXL04_020635

97.8%

TkA05G278550 → LXL04_020636

97.8%

TkA05G279400 → LXL04_020642

100.0%

TkA05G279420 → LXL04_020645

80.8%

TkA05G280710 → LXL04_020645

75.6%

TkA05G282200 → LXL04_020647

100.0%

TkA05G284340 → LXL04_020651

100.0%

TkA05G285050 → LXL04_020652

100.0%

TkA05G285290 → LXL04_020654

98.5%

TkA05G286310 → LXL04_020655

52.8%

TkA05G287010 → LXL04_020657

99.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G278520`	`LXL04_020635`	`JCVI_TKOH_00239`	100.0	49.51 / 26.72	待复核
`TkA05G278530`	`LXL04_020635`	`JCVI_TKOH_00239`	97.8	22.167 / 11.905	Complex
`TkA05G278550`	`LXL04_020636`	`JCVI_TKOH_00239`	97.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G279400`	`LXL04_020642`	`JCVI_TKOH_00239`	100.0	85.915 / 99.187	待复核
`TkA05G279420`	`LXL04_020645`	`JCVI_TKOH_00239`	80.8	90.244 / 88.772	待复核
`TkA05G280710`	`LXL04_020645`	`JCVI_TKOH_00239`	75.6	100.0 / 69.825	Complex
`TkA05G282200`	`LXL04_020647`	`JCVI_TKOH_00239`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G284340`	`LXL04_020651`	`JCVI_TKOH_00239`	100.0	84.528 / 74.419	Complex
`TkA05G285050`	`LXL04_020652`	`JCVI_TKOH_00239`	100.0	100.0 / 28.307	待复核
`TkA05G285290`	`LXL04_020654`	`JCVI_TKOH_00239`	98.5	100.0 / 27.917	待复核
`TkA05G286310`	`LXL04_020655`	`JCVI_TKOH_00239`	52.8	81.915 / 19.432	Complex
`TkA05G287010`	`LXL04_020657`	`JCVI_TKOH_00239`	99.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G287460`	`LXL04_020655`	`JCVI_TKOH_00239`	93.9	100.0 / 68.013	待复核
`TkA05G288160`	`LXL04_020657`	`JCVI_TKOH_00239`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G288950`	`LXL04_020661`	`JCVI_TKOH_00239`	86.3	98.131 / 78.523	待复核
`TkA05G289240`	`LXL04_020663`	`JCVI_TKOH_00239`	97.8	97.713 / 85.126	Strict