同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00123

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 22

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00123

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00123 Chr03 7760774-8433443 Chr02 8947218-9565832 - High 22 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00123`	Chr03:7760774-8433443	Chr02:8947218-9565832	-	22	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 22 · 当前范围 1–22 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G028980 → LXL04_006389

100.0%

TkA03G029110 → LXL04_006388

99.8%

TkA03G029190 → LXL04_006387

98.0%

TkA03G030070 → LXL04_006383

99.9%

TkA03G030090 → LXL04_006382

98.5%

TkA03G030130 → LXL04_006381

100.0%

TkA03G030140 → LXL04_006383

99.8%

TkA03G030160 → LXL04_006382

98.5%

TkA03G030200 → LXL04_006381

100.0%

TkA03G030350 → LXL04_006379

97.9%

TkA03G030520 → LXL04_006377

79.3%

TkA03G030650 → LXL04_006375

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G028980`	`LXL04_006389`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 78.125	Probable
`TkA03G029110`	`LXL04_006388`	`JCVI_TKOH_00123`	99.8	100.0 / 97.841	Strict
`TkA03G029190`	`LXL04_006387`	`JCVI_TKOH_00123`	98.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G030070`	`LXL04_006383`	`JCVI_TKOH_00123`	99.9	100.0 / 77.971	Probable
`TkA03G030090`	`LXL04_006382`	`JCVI_TKOH_00123`	98.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G030130`	`LXL04_006381`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 56.346	待复核
`TkA03G030140`	`LXL04_006383`	`JCVI_TKOH_00123`	99.8	100.0 / 48.156	待复核
`TkA03G030160`	`LXL04_006382`	`JCVI_TKOH_00123`	98.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G030200`	`LXL04_006381`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G030350`	`LXL04_006379`	`JCVI_TKOH_00123`	97.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G030520`	`LXL04_006377`	`JCVI_TKOH_00123`	79.3	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G030650`	`LXL04_006375`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G030690`	`LXL04_006374`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G030760`	`LXL04_006373`	`JCVI_TKOH_00123`	98.8	96.142 / 49.923	待复核
`TkA03G030920`	`LXL04_006373`	`JCVI_TKOH_00123`	98.0	94.444 / 15.716	待复核
`TkA03G031000`	`LXL04_006370`	`JCVI_TKOH_00123`	85.3	95.565 / 51.535	待复核
`TkA03G031080`	`LXL04_006368`	`JCVI_TKOH_00123`	99.1	79.71 / 43.307	待复核
`TkA03G031360`	`LXL04_006366`	`JCVI_TKOH_00123`	99.0	100.0 / 39.009	待复核
`TkA03G031380`	`LXL04_006366`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 24.651	待复核
`TkA03G031390`	`LXL04_006365`	`JCVI_TKOH_00123`	100.0	100.0 / 88.247	Strict
`TkA03G031400`	`LXL04_006365`	`JCVI_TKOH_00123`	99.1	93.548 / 11.554	待复核
`TkA03G031420`	`LXL04_006364`	`JCVI_TKOH_00123`	93.7	100.0 / 91.931	Probable