LXL04_006365 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_006365

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 8953533-8959236 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3015 bp · LXL04_006365|LXL04_006365|OH1004|cDNA

ATggccggaccaccgccggagACACTGTCGGAATCACCGTTAGAACCAAACGCCATCACCGGAACCGCTGGAACGAAGCATGACAGATTGCCAATTTCGCGATCTATTTTTCTGATCTCGGAAAGTAACTCTCCCGTATCTGCTCTTCCTGAACAAACTTACTTCGCCTCTCCACTTCGTAATCATCTTCGCTCATCCTCTTccaaaaaaacaattaaaaaaatgAGTGAATCGTTTTCTCCTGATCTCGTTCCACTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3015 bp · LXL04_006365|LXL04_006365|OH1004|CDS

ATGGCCGGACCACCGCCGGAGACACTGTCGGAATCACCGTTAGAACCAAACGCCATCACCGGAACCGCTGGAACGAAGCATGACAGATTGCCAATTTCGCGATCTATTTTTCTGATCTCGGAAAGTAACTCTCCCGTATCTGCTCTTCCTGAACAAACTTACTTCGCCTCTCCACTTCGTAATCATCTTCGCTCATCCTCTTCCAAAAAAACAATTAAAAAAATGAGTGAATCGTTTTCTCCTGATCTCGTTCCACTGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1004 aa · LXL04_006365|LXL04_006365|OH1004|PROTEIN

MAGPPPETLSESPLEPNAITGTAGTKHDRLPISRSIFLISESNSPVSALPEQTYFASPLRNHLRSSSSKKTIKKMSESFSPDLVPLDSMDREFLLLAPKLVKANYRLGSSAVKAKPALMHLSLWKPISHCAAMILDKKGRKKNGSDHNSSDENKKNPLVLRRLQEHKLREALEEASEDGSLVKSQDIDSESAANKNQDDGLGRSRSLARLETQKEFLRATALAANRTFETEDSIPDLHQSFNKFLTMYPKYQSSEKIDHL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_006365`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_006365

位置 Chr02:8953533-8959236 (+)

描述 Similar to ABA3: Molybdenum cofactor sulfurase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g16540`	对钼辅因子进行硫化。	The Arabidopsis LOS5/ABA3 locus encodes a molybdenum cofactor sulfurase and modulates cold stress- and osmotic stress-responsive gene expression.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010101 ABA3 is a molybdenum cofactor sulfurase required for activation of aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1074/jbc.c100472200 Tandem orientation of duplicated xanthine dehydrogenase genes from Arabidopsis thaliana: differential gene expression and enzyme activities.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m312929200 Characterization of the NifS-like domain of ABA3 from Arabidopsis thaliana provides insight into the mechanism of molybdenum cofactor sulfuration.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m411195200 Binding of sulfurated molybdenum cofactor to the C-terminal domain of ABA3 from Arabidopsis thaliana provides insight into the mechanism of molybdenum cofactor sulfuration.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m708549200

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006365 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006777 Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009749 response to glucose 生物过程

GO:0010118 stomatal movement 生物过程

GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程

GO:0018315 molybdenum incorporation into molybdenum-molybdopterin complex 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G16540

sly:543832

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.450

排名 1 · LXL04_006365 · OH-1004

细胞质0.294

排名 2 · LXL04_006365 · OH-1004

细胞膜0.186

排名 3 · LXL04_006365 · OH-1004

内质网0.105

排名 4 · LXL04_006365 · OH-1004

高尔基体0.074

排名 5 · LXL04_006365 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C5X8`	拟南芥	Molybdenum cofactor sulfurase	24.917%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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