同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00008

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 21

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00008

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00008 Chr01 22364561-23170740 Chr01 154081740-154482436 mixed High 21 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00008`	Chr01:22364561-23170740	Chr01:154081740-154482436	mixed	21	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 21 · 当前范围 1–21 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G087830 → LXL04_005072

93.3%

TkA01G087980 → LXL04_005073

94.5%

TkA01G087990 → LXL04_005077

42.2%

TkA01G088300 → LXL04_005084

95.0%

TkA01G088380 → LXL04_005084

98.8%

TkA01G088390 → LXL04_005082

61.1%

TkA01G088400 → LXL04_005082

98.6%

TkA01G088410 → LXL04_005080

64.1%

TkA01G088420 → LXL04_005079

99.7%

TkA01G088610 → LXL04_005085

97.0%

TkA01G088970 → LXL04_005089

96.8%

TkA01G089390 → LXL04_005094

79.7%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G087830`	`LXL04_005072`	`JCVI_TKOH_00008`	93.3	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G087980`	`LXL04_005073`	`JCVI_TKOH_00008`	94.5	99.593 / 99.593	Complex
`TkA01G087990`	`LXL04_005077`	`JCVI_TKOH_00008`	42.2	100.0 / 84.099	Complex
`TkA01G088300`	`LXL04_005084`	`JCVI_TKOH_00008`	95.0	100.0 / 35.159	待复核
`TkA01G088380`	`LXL04_005084`	`JCVI_TKOH_00008`	98.8	97.17 / 90.813	Strict
`TkA01G088390`	`LXL04_005082`	`JCVI_TKOH_00008`	61.1	96.893 / 80.823	待复核
`TkA01G088400`	`LXL04_005082`	`JCVI_TKOH_00008`	98.6	95.172 / 10.714	待复核
`TkA01G088410`	`LXL04_005080`	`JCVI_TKOH_00008`	64.1	95.68 / 84.375	Complex
`TkA01G088420`	`LXL04_005079`	`JCVI_TKOH_00008`	99.7	98.196 / 76.815	Probable
`TkA01G088610`	`LXL04_005085`	`JCVI_TKOH_00008`	97.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G088970`	`LXL04_005089`	`JCVI_TKOH_00008`	96.8	95.445 / 42.252	待复核
`TkA01G089390`	`LXL04_005094`	`JCVI_TKOH_00008`	79.7	100.0 / 15.397	Complex
`TkA01G089410`	`LXL04_005094`	`JCVI_TKOH_00008`	99.0	100.0 / 36.795	待复核
`TkA01G089460`	`LXL04_005095`	`JCVI_TKOH_00008`	96.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G089490`	`LXL04_005096`	`JCVI_TKOH_00008`	93.6	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G089610`	`LXL04_005097`	`JCVI_TKOH_00008`	96.0	93.396 / 24.49	待复核
`TkA01G089830`	`LXL04_005067`	`JCVI_TKOH_00008`	72.4	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G090080`	`LXL04_005069`	`JCVI_TKOH_00008`	98.6	60.397 / 96.919	待复核
`TkA01G090320`	`LXL04_005070`	`JCVI_TKOH_00008`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G090390`	`LXL04_005071`	`JCVI_TKOH_00008`	98.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G091420`	`LXL04_005072`	`JCVI_TKOH_00008`	94.1	100.0 / 100.0	Complex