同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00375
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 27
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00375当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00375 |
ChrUn:12220301-12490279 | Chr01:23205942-23587806 | mixed | 27 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 27 · 当前范围 1–27 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkAUNG044020 | LXL04_001270 | JCVI_TKOH_00375 | 95.2 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkAUNG044050 | LXL04_001271 | JCVI_TKOH_00375 | 95.4 | 100.0 / 94.163 | Complex |
TkAUNG044060 | LXL04_001272 | JCVI_TKOH_00375 | 98.2 | 95.62 / 89.318 | Complex |
TkAUNG044070 | LXL04_001273 | JCVI_TKOH_00375 | 99.4 | 94.891 / 99.426 | Complex |
TkAUNG044100 | LXL04_001274 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044110 | LXL04_001277 | JCVI_TKOH_00375 | 97.9 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044120 | LXL04_001278 | JCVI_TKOH_00375 | 97.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044130 | LXL04_001279 | JCVI_TKOH_00375 | 99.5 | 95.455 / 67.5 | Complex |
TkAUNG044230 | LXL04_001264 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 18.122 | 待复核 |
TkAUNG044320 | LXL04_001267 | JCVI_TKOH_00375 | 98.2 | 93.204 / 75.74 | Complex |
TkAUNG044330 | LXL04_001269 | JCVI_TKOH_00375 | 81.2 | 98.916 / 86.447 | Complex |
TkAUNG044520 | LXL04_001271 | JCVI_TKOH_00375 | 94.9 | 100.0 / 94.163 | Complex |
TkAUNG044530 | LXL04_001272 | JCVI_TKOH_00375 | 99.0 | 95.62 / 89.318 | Complex |
TkAUNG044540 | LXL04_001273 | JCVI_TKOH_00375 | 96.2 | 94.891 / 99.426 | Complex |
TkAUNG044580 | LXL04_001274 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044610 | LXL04_001277 | JCVI_TKOH_00375 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044620 | LXL04_001278 | JCVI_TKOH_00375 | 99.6 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044740 | LXL04_001279 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044750 | LXL04_001280 | JCVI_TKOH_00375 | 91.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044780 | LXL04_001281 | JCVI_TKOH_00375 | 96.3 | 90.532 / 89.958 | Complex |
TkAUNG044810 | LXL04_001283 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 80.42 | Strict |
TkAUNG044830 | LXL04_001284 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044840 | LXL04_001285 | JCVI_TKOH_00375 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044850 | LXL04_001286 | JCVI_TKOH_00375 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044880 | LXL04_001287 | JCVI_TKOH_00375 | 96.7 | 100.0 / 99.18 | 待复核 |
TkAUNG044890 | LXL04_001288 | JCVI_TKOH_00375 | 93.7 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG044910 | LXL04_001293 | JCVI_TKOH_00375 | 98.6 | 100.0 / 27.238 | 待复核 |