同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00286

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 29

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00286

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00286 Chr06 104347113-106547170 Chr05 12893631-16152104 mixed High 29 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00286`	Chr06:104347113-106547170	Chr05:12893631-16152104	mixed	29	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 29 · 当前范围 1–29 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G421690 → LXL04_022970

99.2%

TkA06G421770 → LXL04_022970

99.2%

TkA06G422150 → LXL04_022969

98.0%

TkA06G422450 → LXL04_022961

99.8%

TkA06G423470 → LXL04_022958

99.0%

TkA06G425250 → LXL04_022947

99.7%

TkA06G425360 → LXL04_022945

100.0%

TkA06G425410 → LXL04_022944

98.5%

TkA06G425420 → LXL04_022943

84.2%

TkA06G425740 → LXL04_022937

91.4%

TkA06G426770 → LXL04_022932

87.0%

TkA06G426780 → LXL04_022931

99.6%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G421690`	`LXL04_022970`	`JCVI_TKOH_00286`	99.2	100.0 / 78.107	Complex
`TkA06G421770`	`LXL04_022970`	`JCVI_TKOH_00286`	99.2	100.0 / 78.107	Complex
`TkA06G422150`	`LXL04_022969`	`JCVI_TKOH_00286`	98.0	95.327 / 69.863	Complex
`TkA06G422450`	`LXL04_022961`	`JCVI_TKOH_00286`	99.8	95.985 / 69.485	待复核
`TkA06G423470`	`LXL04_022958`	`JCVI_TKOH_00286`	99.0	94.258 / 20.913	待复核
`TkA06G425250`	`LXL04_022947`	`JCVI_TKOH_00286`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G425360`	`LXL04_022945`	`JCVI_TKOH_00286`	100.0	100.0 / 16.691	待复核
`TkA06G425410`	`LXL04_022944`	`JCVI_TKOH_00286`	98.5	100.0 / 91.741	Strict
`TkA06G425420`	`LXL04_022943`	`JCVI_TKOH_00286`	84.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G425740`	`LXL04_022937`	`JCVI_TKOH_00286`	91.4	95.395 / 26.962	Complex
`TkA06G426770`	`LXL04_022932`	`JCVI_TKOH_00286`	87.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G426780`	`LXL04_022931`	`JCVI_TKOH_00286`	99.6	100.0 / 96.241	Strict
`TkA06G426830`	`LXL04_022930`	`JCVI_TKOH_00286`	98.2	99.606 / 28.379	待复核
`TkA06G427130`	`LXL04_022926`	`JCVI_TKOH_00286`	49.7	38.393 / 71.782	Complex
`TkA06G427280`	`LXL04_022926`	`JCVI_TKOH_00286`	94.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G427540`	`LXL04_022925`	`JCVI_TKOH_00286`	91.9	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G427570`	`LXL04_022924`	`JCVI_TKOH_00286`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G427600`	`LXL04_022923`	`JCVI_TKOH_00286`	99.5	96.916 / 26.036	待复核
`TkA06G427620`	`LXL04_022922`	`JCVI_TKOH_00286`	90.5	99.563 / 90.323	Probable
`TkA06G427910`	`LXL04_022919`	`JCVI_TKOH_00286`	100.0	100.0 / 88.095	Complex
`TkA06G428000`	`LXL04_022917`	`JCVI_TKOH_00286`	99.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G428050`	`LXL04_022916`	`JCVI_TKOH_00286`	99.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G428060`	`LXL04_022919`	`JCVI_TKOH_00286`	32.4	100.0 / 83.333	Complex
`TkA06G428200`	`LXL04_022915`	`JCVI_TKOH_00286`	99.4	100.0 / 96.515	Strict
`TkA06G428570`	`LXL04_022912`	`JCVI_TKOH_00286`	84.8	99.688 / 83.073	待复核
`TkA06G429900`	`LXL04_022905`	`JCVI_TKOH_00286`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G430190`	`LXL04_022901`	`JCVI_TKOH_00286`	99.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G430320`	`LXL04_022902`	`JCVI_TKOH_00286`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G430660`	`LXL04_022904`	`JCVI_TKOH_00286`	99.6	100.0 / 91.216	Strict