同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00234

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 32

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00234

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00234 Chr05 34055925-37531730 Chr04 49958359-53097738 + High 32 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00234`	Chr05:34055925-37531730	Chr04:49958359-53097738	+	32	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 32 · 当前范围 1–32 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA05G129920 → LXL04_020060

99.5%

TkA05G131570 → LXL04_020065

99.2%

TkA05G131580 → LXL04_020066

100.0%

TkA05G131670 → LXL04_020067

100.0%

TkA05G131900 → LXL04_020068

94.2%

TkA05G133370 → LXL04_020078

96.7%

TkA05G133380 → LXL04_020079

93.8%

TkA05G133400 → LXL04_020079

89.7%

TkA05G133420 → LXL04_020080

94.5%

TkA05G133660 → LXL04_020082

99.8%

TkA05G133670 → LXL04_020083

97.0%

TkA05G133770 → LXL04_020091

82.1%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G129920`	`LXL04_020060`	`JCVI_TKOH_00234`	99.5	100.0 / 72.015	Probable
`TkA05G131570`	`LXL04_020065`	`JCVI_TKOH_00234`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G131580`	`LXL04_020066`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	71.693 / 100.0	Complex
`TkA05G131670`	`LXL04_020067`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G131900`	`LXL04_020068`	`JCVI_TKOH_00234`	94.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G133370`	`LXL04_020078`	`JCVI_TKOH_00234`	96.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G133380`	`LXL04_020079`	`JCVI_TKOH_00234`	93.8	24.242 / 5.664	Complex
`TkA05G133400`	`LXL04_020079`	`JCVI_TKOH_00234`	89.7	56.686 / 34.513	待复核
`TkA05G133420`	`LXL04_020080`	`JCVI_TKOH_00234`	94.5	100.0 / 96.756	Probable
`TkA05G133660`	`LXL04_020082`	`JCVI_TKOH_00234`	99.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G133670`	`LXL04_020083`	`JCVI_TKOH_00234`	97.0	97.455 / 70.526	Probable
`TkA05G133770`	`LXL04_020091`	`JCVI_TKOH_00234`	82.1	76.23 / 98.214	Complex
`TkA05G134950`	`LXL04_020091`	`JCVI_TKOH_00234`	99.3	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G135060`	`LXL04_020093`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	100.0 / 26.995	待复核
`TkA05G135730`	`LXL04_020100`	`JCVI_TKOH_00234`	99.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G135850`	`LXL04_020101`	`JCVI_TKOH_00234`	99.1	95.972 / 77.728	Complex
`TkA05G135930`	`LXL04_020102`	`JCVI_TKOH_00234`	98.8	97.229 / 45.415	待复核
`TkA05G135940`	`LXL04_020103`	`JCVI_TKOH_00234`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G137190`	`LXL04_020109`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G138360`	`LXL04_020109`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G139030`	`LXL04_020113`	`JCVI_TKOH_00234`	96.2	61.905 / 18.978	Complex
`TkA05G139490`	`LXL04_020114`	`JCVI_TKOH_00234`	98.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G140380`	`LXL04_020120`	`JCVI_TKOH_00234`	99.4	100.0 / 25.204	待复核
`TkA05G140390`	`LXL04_020121`	`JCVI_TKOH_00234`	93.6	90.306 / 56.325	Complex
`TkA05G141430`	`LXL04_020128`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G141440`	`LXL04_020129`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	99.545 / 79.636	Complex
`TkA05G141800`	`LXL04_020131`	`JCVI_TKOH_00234`	99.3	98.41 / 94.061	Complex
`TkA05G141810`	`LXL04_020132`	`JCVI_TKOH_00234`	99.8	91.977 / 53.047	待复核
`TkA05G141950`	`LXL04_020134`	`JCVI_TKOH_00234`	100.0	100.0 / 82.375	Complex
`TkA05G143650`	`LXL04_020138`	`JCVI_TKOH_00234`	98.8	84.192 / 100.0	Strict
`TkA05G144100`	`LXL04_020139`	`JCVI_TKOH_00234`	91.1	100.0 / 100.0	Probable
`TkA05G144550`	`LXL04_020140`	`JCVI_TKOH_00234`	99.6	100.0 / 100.0	Strict