ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 82 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA08G123570
Chr08:32109083-32110099 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031704
Chr07:9864742-9865758 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 55.340 / 对象 98.276 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G123570 |
|
TkA08G124070
Chr08:32232333-32237674 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018798
Chr04:18418083-18422967 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.500 查询 100.000 / 对象 50.256 |
TkA08G124070 | |
|
TkA08G124080
Chr08:32239341-32242754 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018797
Chr04:18399638-18400714 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.800 查询 68.080 / 对象 76.257 |
TkA08G124080 | |
|
TkA08G124330
Chr08:32292857-32295657 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031699
Chr07:9781558-9784454 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.000 查询 100.000 / 对象 94.085 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G124330 |
|
TkA08G124970
Chr08:32466653-32467247 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031707
Chr07:9957283-9958039 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 92.373 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G124970 |
|
TkA08G125190
Chr08:32516371-32518797 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_008092
Chr02:85543788-85546128 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
62.900 查询 99.062 / 对象 98.797 |
JCVI_TKOH_00329 | TkA08G125190 |
|
TkA08G125310
Chr08:32554992-32555380 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_001389
Chr01:25448755-25451233 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.600 查询 72.807 / 对象 50.331 |
TkA08G125310 | |
|
TkA08G125730
Chr08:32665961-32666497 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031717
Chr07:10154508-10155045 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G125730 |
|
TkA08G125760
Chr08:32671384-32673148 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031718
Chr07:10159447-10160787 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.000 查询 100.000 / 对象 62.733 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G125760 |
|
TkA08G125780
Chr08:32675311-32675921 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_012734
Chr03:17966949-17971771 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 9.421 |
TkA08G125780 | |
|
TkA08G125800
Chr08:32676935-32680414 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_012734
Chr03:17966949-17971771 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 96.045 / 对象 14.050 |
TkA08G125800 | |
|
TkA08G125940
Chr08:32727332-32728538 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031721
Chr07:10226788-10227594 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 58.209 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G125940 |
|
TkA08G125960
Chr08:32732522-32734111 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031722
Chr07:10232126-10234543 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 52.919 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G125960 |
|
TkA08G126090
Chr08:32759754-32768194 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032742
Chr07:28907205-28908566 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 100.000 / 对象 93.377 |
TkA08G126090 | |
|
TkA08G126120
Chr08:32775948-32777839 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031724
Chr07:10239743-10241663 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.900 查询 74.737 / 对象 75.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G126120 |
|
TkA08G126470
Chr08:32885645-32887557 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031730
Chr07:10352058-10353666 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 89.503 / 对象 31.953 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G126470 |
|
TkA08G126760
Chr08:32960473-32962655 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031734
Chr07:10442447-10444770 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.100 查询 96.505 / 对象 79.601 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G126760 |
|
TkA08G126780
Chr08:32966734-32967159 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031735
Chr07:10444989-10448884 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.700 查询 90.071 / 对象 48.289 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G126780 |
|
TkA08G126980
Chr08:33007437-33008665 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031080
Chr07:113622-114842 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 90.237 / 对象 96.338 |
TkA08G126980 | |
|
TkA08G126990
Chr08:33008929-33011677 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031738
Chr07:10494257-10515847 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.300 查询 99.611 / 对象 29.060 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G126990 |
|
TkA08G127030
Chr08:33022259-33024135 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031738
Chr07:10494257-10515847 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.800 查询 94.336 / 对象 26.236 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127030 |
|
TkA08G127060
Chr08:33038224-33040065 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031738
Chr07:10494257-10515847 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 96.667 / 对象 14.177 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127060 |
|
TkA08G127150
Chr08:33067202-33068429 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031739
Chr07:10540916-10548708 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 100.000 / 对象 18.987 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127150 |
|
TkA08G127160
Chr08:33070371-33073409 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031740
Chr07:10552444-10555038 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.900 查询 93.569 / 对象 58.434 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127160 |
|
TkA08G127200
Chr08:33086094-33086453 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031743
Chr07:10567952-10568344 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.900 查询 39.496 / 对象 36.154 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127200 |
|
TkA08G127290
Chr08:33107697-33108496 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_021341
Chr04:127662295-127664078 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 52.542 |
TkA08G127290 | |
|
TkA08G127300
Chr08:33109065-33111049 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_025460
Chr05:112062747-112071342 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 93.933 / 对象 25.056 |
TkA08G127300 | |
|
TkA08G127310
Chr08:33111898-33112595 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_025460
Chr05:112062747-112071342 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 87.821 / 对象 7.645 |
TkA08G127310 | |
|
TkA08G127440
Chr08:33137870-33140425 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031746
Chr07:10595881-10597850 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127440 |
|
TkA08G127560
Chr08:33191249-33192051 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_005948
Chr01:176093357-176094159 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G127560 | |
|
TkA08G127910
Chr08:33250940-33251686 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031755
Chr07:10733710-10734456 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G127910 |
|
TkA08G128430
Chr08:33359518-33361316 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031757
Chr07:10912993-10915125 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.100 查询 100.000 / 对象 99.361 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G128430 |
|
TkA08G128450
Chr08:33376749-33377766 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031758
Chr07:10950270-10951596 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 68.598 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G128450 |
|
TkA08G129220
Chr08:33524420-33526155 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031768
Chr07:11096787-11098271 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 90.421 / 对象 81.992 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G129220 |
|
TkA08G129680
Chr08:33650946-33652993 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031780
Chr07:11223677-11226022 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.800 查询 100.000 / 对象 93.403 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G129680 |
|
TkA08G130040
Chr08:33735970-33737754 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031784
Chr07:11307655-11315677 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.400 查询 90.909 / 对象 30.036 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G130040 |
|
TkA08G130060
Chr08:33741305-33743060 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031784
Chr07:11307655-11315677 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.400 查询 94.103 / 对象 31.565 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G130060 |
|
TkA08G130420
Chr08:33827164-33827753 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031789
Chr07:11399838-11400427 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G130420 |
|
TkA08G130430
Chr08:33828505-33833182 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031790
Chr07:11401141-11406218 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.600 查询 94.286 / 对象 84.774 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G130430 |
|
TkA08G130740
Chr08:33919396-33922608 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031804
Chr07:11486300-11489430 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.100 查询 75.377 / 对象 63.702 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G130740 |
|
TkA08G130790
Chr08:33934070-33934591 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_016979
Chr03:138316624-138317511 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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