LXL04_031910 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_031910

当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 13079911-13085139 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

834 bp · LXL04_031910|LXL04_031910|OH1004|cDNA

ATGTGTCGGACCAAAGACTcagactcggaccacggactcggtccgtggtctgtgCGTTTGATAATGTCCGtcggactcggaccacggactcggtccgaccttttgcctcggactcggtccgcccaaAAAAATCGCAGACTGAGAAATAAgcctctgatgtcggactcggtccgtggtccgaggcgtttgataggcgagtttgatgtcggactcggtccgtggtccgtggtccgtggtctgagtccgagtccgaATTGGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

834 bp · LXL04_031910|LXL04_031910|OH1004|CDS

ATGTGTCGGACCAAAGACTCAGACTCGGACCACGGACTCGGTCCGTGGTCTGTGCGTTTGATAATGTCCGTCGGACTCGGACCACGGACTCGGTCCGACCTTTTGCCTCGGACTCGGTCCGCCCAAAAAAATCGCAGACTGAGAAATAAGCCTCTGATGTCGGACTCGGTCCGTGGTCCGAGGCGTTTGATAGGCGAGTTTGATGTCGGACTCGGTCCGTGGTCCGTGGTCCGTGGTCTGAGTCCGAGTCCGAATTGGGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

277 aa · LXL04_031910|LXL04_031910|OH1004|PROTEIN

MCRTKDSDSDHGLGPWSVRLIMSVGLGPRTRSDLLPRTRSAQKNRRLRNKPLMSDSVRGPRRLIGEFDVGLGPWSVVRGLSPSPNWVTFRKDDDKDGGNAMIWKSDFFFFRSGNQMFSTKERGDKASTGDEGAESVLASMDMVFHFHHDDDGSVSFNHRPPWVSPRASVRELKRLENRKGCYACIIIGEIKAVVIATGVHTFFGKAAHLVDSTNQVRMAVEIVVMYPIQKRSYMSGIDNLLVLLIGGIPIDMPTLLSVTV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_031910`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

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SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_031910

位置 Chr07:13079911-13085139 (-)

描述 Similar to AHA3: ATPase 3, plasma membrane-type

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g57350`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	暂无已核实直接文献
`At1g80660`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	暂无已核实直接文献
`At4g30190`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	Mechanism of proton transport by plant plasma membrane proton ATPases.2003 · DOI: 10.1007/s10265-003-0111-9 The effect of a genetically reduced plasma membrane protonmotive force on vegetative growth of Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.189167 Abscisic acid suppresses hypocotyl elongation by dephosphorylating plasma membrane H(+)-ATPase in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1093/pcp/pcu028 The plasma membrane H(+) -ATPase AHA2 contributes to the root architecture in response to different nitrogen supply.2015 · DOI: 10.1111/ppl.12305 Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306 Direct observation of proton pumping by a eukaryotic P-type ATPase.2016 · DOI: 10.1126/science.aad6429
`At2g18960`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
`At3g47950`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031910 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程

GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程

GO:0120029 proton export across plasma membrane 生物过程

GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程

GO:1990069 stomatal opening 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G80660

ath:AT2G18960

ath:AT3G47950

ath:AT4G30190

ath:AT5G57350

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.363

排名 1 · LXL04_031910 · OH-1004

细胞核0.337

排名 2 · LXL04_031910 · OH-1004

细胞膜0.150

排名 3 · LXL04_031910 · OH-1004

线粒体0.141

排名 4 · LXL04_031910 · OH-1004

内质网0.097

排名 5 · LXL04_031910 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P20431`	拟南芥	ATPase 3, plasma membrane-type	68.627%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q42556`	拟南芥	ATPase 9, plasma membrane-type	67.647%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`P19456`	拟南芥	ATPase 2, plasma membrane-type	67.647%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`P20649`	拟南芥	ATPase 1, plasma membrane-type	68.627%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SU58`	拟南芥	ATPase 4, plasma membrane-type	67.647%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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