TkA08G125960 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G125960

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 32732522-32734111 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1492 bp · TkA08G125960|TK1151|cDNA

CCAGAATTCAAGCAAACTCCATGTGGAGTGCATGGACATATGCAGTTGCAACGGGTTTCAGTATAAATTCGATAAGCTACAAGGGATCTATCTTTGTTACCCTAAATTTCTCTTGCTGAATGGATTCAGCTCGGTTAGTTTCCTTGGTTCATTTTATCTAAGAGCGCCAAAAGTTACGCTATCTTCTAGTACCATTAAAGCTACTCGCGAACTTGGATTAAACTGTTCTGGGAATCCTAGGATCGTAGAATTGGAACGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1281 bp · TkA08G125960|TK1151|CDS

ATGGACATATGCAGTTGCAACGGGTTTCAGTATAAATTCGATAAGCTACAAGGGATCTATCTTTGTTACCCTAAATTTCTCTTGCTGAATGGATTCAGCTCGGTTAGTTTCCTTGGTTCATTTTATCTAAGAGCGCCAAAAGTTACGCTATCTTCTAGTACCATTAAAGCTACTCGCGAACTTGGATTAAACTGTTCTGGGAATCCTAGGATCGTAGAATTGGAACGAGTTTATGAAAAGAAGAACGAAAGAGGGTCAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

426 aa · TkA08G125960|TK1151|PROTEIN

MDICSCNGFQYKFDKLQGIYLCYPKFLLLNGFSSVSFLGSFYLRAPKVTLSSSTIKATRELGLNCSGNPRIVELERVYEKKNERGSIKFLQLFTYVFGALEIVCIIYFFYKTRKSATKSQGYLQAATTGFERFSYRDLKKASENFSMEVGRGGGAVVYKGVLTDNRIAAIKRLKEANSNQGEAEFLAEISTLGRLNHMNLIDIWGYCAEGKHRILVYEYMENGSLADNLHSDNLNWDKRFEVAVGAAKGLAYLHEECLEW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G125960`
TK1151 ID	TkA08G125960
OH-1004 ID	LXL04_031722
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 52.919 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G125960

位置 Chr08:32732522-32734111 (-)

描述 Similar to PK1: Putative receptor protein kinase ZmPK1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g00340`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。	暂无已核实直接文献
`At1g34300`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。	暂无已核实直接文献
`At5g24080`	G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。	暂无已核实直接文献
`At4g32300`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031722 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0048544 recognition of pollen 生物过程

GO:0051707 response to other organism 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G19130

ath:AT4G00340

ath:AT5G24080

zma:542378

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.747

排名 1 · TkA08G125960 · TK1151

内质网0.115

排名 2 · TkA08G125960 · TK1151

细胞质0.108

排名 3 · TkA08G125960 · TK1151

细胞核0.081

排名 4 · TkA08G125960 · TK1151

高尔基体0.040

排名 5 · TkA08G125960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase64-83 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr146-420 aa

PF00069Pkinase147-418 aa

PF17667Pkinase_fungal151-190 aa

PF03109ABC1156-174 aa

PF03109ABC1211-295 aa

PF12260PIP49_C213-284 aa

PF17667Pkinase_fungal246-313 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G125960	`PF00069`	Pkinase	64	83	8.1e-47	160.5
TkA08G125960	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	146	420	7.1e-40	137.7
TkA08G125960	`PF00069`	Pkinase	147	418	8.1e-47	160.5
TkA08G125960	`PF17667`	Pkinase_fungal	151	190	0.31	10.4
TkA08G125960	`PF03109`	ABC1	156	174	0.0068	16.3
TkA08G125960	`PF03109`	ABC1	211	295	0.0068	16.3
TkA08G125960	`PF12260`	PIP49_C	213	284	0.049	13.9
TkA08G125960	`PF17667`	Pkinase_fungal	246	313	0.31	10.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39203`	拟南芥	sp\|Q39203\|SD22_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2	38.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9XID3`	拟南芥	sp\|Q9XID3\|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300	38.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FLV4`	拟南芥	sp\|Q9FLV4\|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080	42.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8RWZ5`	拟南芥	sp\|Q8RWZ5\|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5	43.200%	Swiss-Prot	中等置信

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