ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 57 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA05G369110
Chr05:91645253-91648715 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021229
Chr04:125032799-125037340 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.000 查询 100.000 / 对象 66.447 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G369110 |
|
TkA05G369150
Chr05:91664619-91672290 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021230
Chr04:125052964-125061189 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.500 查询 97.750 / 对象 85.111 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G369150 |
|
TkA05G369710
Chr05:91792080-91792661 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021236
Chr04:125176767-125177385 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.700 查询 93.525 / 对象 88.770 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G369710 |
|
TkA05G369830
Chr05:91819158-91819514 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_025584
Chr05:113839141-113841312 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.500 查询 100.000 / 对象 39.073 |
TkA05G369830 | |
|
TkA05G370640
Chr05:92000816-92001142 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_002655
Chr01:53947708-53949222 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.000 查询 62.963 / 对象 50.000 |
TkA05G370640 | |
|
TkA05G371500
Chr05:92254587-92255104 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021248
Chr04:125595927-125598880 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 97.368 / 对象 28.316 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G371500 |
|
TkA05G371780
Chr05:92347259-92349836 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_015727
Chr03:82184837-82185795 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.600 查询 96.947 / 对象 61.353 |
TkA05G371780 | |
|
TkA05G372780
Chr05:92554026-92554742 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021256
Chr04:125892063-125895504 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 96.471 / 对象 36.771 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G372780 |
|
TkA05G372830
Chr05:92579466-92582443 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021257
Chr04:125911293-125913618 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G372830 |
|
TkA05G373630
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GWHBCHF00000006
|
LXL04_021262
Chr04:126089872-126090691 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
70.900 查询 58.333 / 对象 98.319 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G373630 |
|
TkA05G375980
Chr05:93345210-93346829 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021276
Chr04:126382720-126384354 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.000 查询 100.000 / 对象 99.081 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G375980 |
|
TkA05G375990
Chr05:93347953-93348621 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021277
Chr04:126384810-126386132 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.200 查询 69.672 / 对象 76.344 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G375990 |
|
TkA05G376640
Chr05:93519349-93519693 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021275
Chr04:126367927-126368190 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.800 查询 66.667 / 对象 86.207 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G376640 |
|
TkA05G376700
Chr05:93539455-93539871 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_026176
Chr05:122187377-122187709 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
56.900 查询 56.098 / 对象 51.818 |
TkA05G376700 | |
|
TkA05G376710
Chr05:93541455-93542210 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021276
Chr04:126382720-126384354 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 85.556 / 对象 28.309 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G376710 |
|
TkA05G376810
Chr05:93555438-93556842 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_039036
Chr09:57215028-57219205 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
62.000 查询 33.333 / 对象 21.368 |
TkA05G376810 | |
|
TkA05G377050
Chr05:93614557-93616545 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021278
Chr04:126455832-126457786 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G377050 |
|
TkA05G377090
Chr05:93621813-93623420 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_029747
Chr06:99061506-99064477 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.400 查询 99.143 / 对象 59.520 |
TkA05G377090 | |
|
TkA05G377930
Chr05:93867377-93871437 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021291
Chr04:126720079-126732897 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.800 查询 89.716 / 对象 43.036 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G377930 |
|
TkA05G378120
Chr05:93940031-93940654 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021294
Chr04:126797160-126797783 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
70.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G378120 |
|
TkA05G378290
Chr05:93988374-93988835 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021298
Chr04:126878160-126878621 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G378290 |
|
TkA05G378540
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|
LXL04_021304
Chr04:126930632-126933144 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G378540 |
|
TkA05G378600
Chr05:94054243-94054932 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_015848
Chr03:91837470-91839986 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.800 查询 99.367 / 对象 45.906 |
TkA05G378600 | |
|
TkA05G378730
Chr05:94085054-94086164 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021310
Chr04:126975530-126977334 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.500 查询 100.000 / 对象 58.010 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G378730 |
|
TkA05G378890
Chr05:94130331-94136303 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021311
Chr04:127032242-127037617 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 54.015 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G378890 |
|
TkA05G379050
Chr05:94170633-94171540 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_039020
Chr09:56803929-56807795 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 21.414 |
TkA05G379050 | |
|
TkA05G379070
Chr05:94178152-94180438 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021312
Chr04:127042693-127044275 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 58.355 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G379070 |
|
TkA05G380730
Chr05:94550274-94551769 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021329
Chr04:127438242-127439373 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G380730 |
|
TkA05G381500
Chr05:94751083-94754657 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024997
Chr05:103769216-103771742 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.200 查询 98.819 / 对象 57.403 |
TkA05G381500 | |
|
TkA05G382030
Chr05:94891316-94893565 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_000051
Chr01:1222338-1223395 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G382030 | |
|
TkA05G382480
Chr05:95033064-95033465 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_010782
Chr02:153419208-153422972 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 99.074 / 对象 39.338 |
TkA05G382480 | |
|
TkA05G383390
Chr05:95252144-95252689 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021359
Chr04:128149630-128150175 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G383390 |
|
TkA05G383500
Chr05:95270035-95272118 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_008360
Chr02:97235909-97238261 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 97.608 / 对象 97.561 |
TkA05G383500 | |
|
TkA05G383530
Chr05:95277466-95282355 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_023669
Chr05:62211811-62215567 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.900 查询 52.950 / 对象 64.935 |
TkA05G383530 | |
|
TkA05G384090
Chr05:95407145-95407573 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024649
Chr05:95950961-95953757 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 55.135 |
TkA05G384090 | |
|
TkA05G384170
Chr05:95431038-95432425 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021381
Chr04:128556337-128557727 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
69.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G384170 |
|
TkA05G384610
Chr05:95540368-95540715 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021366
Chr04:128281867-128286134 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 77.451 / 对象 53.020 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G384610 |
|
TkA05G385000
Chr05:95681103-95681956 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021373
Chr04:128398022-128398880 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00242 | TkA05G385000 |
|
TkA05G385720
Chr05:95848278-95848706 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024649
Chr05:95950961-95953757 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 55.135 |
TkA05G385720 | |
|
TkA05G386120
Chr05:95944135-95946122 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_031683
Chr07:9515990-9517608 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G386120 | |
|
TkA05G388430
Chr05:96521913-96525303 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021410
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 99.401 / 对象 28.819 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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75.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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96.400 查询 18.919 / 对象 40.580 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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|
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CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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CM104805.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.000 查询 58.222 / 对象 100.000 |
TkA05G406010 | |
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TkA05G406950
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Chr04:132527798-132532105 (-)
CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.100 查询 58.108 / 对象 53.975 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.900 查询 100.000 / 对象 87.643 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 51.093 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.000 查询 91.371 / 对象 44.444 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.778 / 对象 59.661 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 93.671 / 对象 49.333 |
TkA05G410520 | |
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97.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.400 查询 95.588 / 对象 15.625 |
TkA05G412800 | |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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92.700 查询 38.318 / 对象 7.765 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.300 查询 100.000 / 对象 49.646 |
JCVI_TKOH_00243 | TkA05G413980 |