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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G413980
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 103015888-103022375 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2895 bp · TkA05G413980|TK1151|cDNA

TACAAGTCCACTCTCTTCTCCGCCATTAAACTAATCCAAAGTGAAAGCAAAAAAGAGACCCAACCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTTTCTCCGATCTCTCTCTTGCTCTCTCTTTCTCAGTTTATTCTCACAGAACATCACTTGGAAACCTCACAATTCCATATCATTTTACTAGATTTTGTTTGTTTTTCGCCCTTTCTTCTTTTTCTTAGCTTAATTCAGACGTCCAACTTTCGCGGCTGCTCGATTTTTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1197 bp · TkA05G413980|TK1151|CDS

ATGTGTGCTATGAAGGAAGTTACATTGTTCTCTGATGATGCGAAGTCAAAGGAAAGTGCAAGACAGCTGGGACAAGAAGTTTCTTTACTGAGCCGATTAAGCCATCCAAATATTGTGCAGTATTATGGTTCTGAAATGGTTGATGACAAACTTTATATATATTTGGAATACGTATCTGGTGGTTCAATTTATAAACTTCTTCAAGAATACGGACAATTTGGTGAGTCAGCAATCCGAAGCTACACACAACAGATTCTATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

398 aa · TkA05G413980|TK1151|PROTEIN

MCAMKEVTLFSDDAKSKESARQLGQEVSLLSRLSHPNIVQYYGSEMVDDKLYIYLEYVSGGSIYKLLQEYGQFGESAIRSYTQQILSGLAYLHAKNTIHRDIKGANILVDPNGRVKLADFGMAKHITGQTCPLSFKGSPYWMAPEIIKNSNGSNLAVDIWSLGCTVLEMATTKPPWSQYEGVAALFKIGNSKELPVIPDHLSEEGKDFVRQCLQRNPQHRPTAAQLLDHSFIKNAPPLERPVPYPEPSDPLPSTGGIGHP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G413980
TK1151 IDTkA05G413980
OH-1004 IDLXL04_021652
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)94.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 49.646
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G413980
位置Chr05:103015888-103022375 (-)
描述Similar to YDA: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g63700 在 MAP 激酶级联反应中发挥作用，作为分子开关调节受精卵和早期胚胎的第一次细胞命运决定。 暂无已核实直接文献
At1g53570 丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶 3。 暂无已核实直接文献
At5g66850 丝裂原激活蛋白激酶 参与宿主细胞表面几丁质受体复合物 CERK1-LYK5 和细胞内 MAPK 级联之间的信号转导，从而导致几丁质诱导的免疫。
The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation.2016 · DOI: 10.15252/embj.201694248
At1g09000 可能参与氧化应激介导的信号级联反应，磷酸化下游 MAP 激酶 MPK3 和 MPK6。
Functional analysis of oxidative stress-activated mitogen-activated protein kinase cascade in plants.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.6.2940
An Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinase kinase gene family encodes essential positive regulators of cytokinesis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001164

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010098 suspensor development 生物过程
GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09000
ath:AT1G53570
ath:AT1G54960
ath:AT1G63700
ath:AT5G66850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.658
排名 1 · TkA05G413980 · TK1151
细胞核0.318
排名 2 · TkA05G413980 · TK1151
细胞膜0.187
排名 3 · TkA05G413980 · TK1151
高尔基体0.054
排名 4 · TkA05G413980 · TK1151
溶酶体／液泡0.046
排名 5 · TkA05G413980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase2-232 aa
PF03109ABC112-128 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr13-227 aa
PF06293Kdo62-127 aa
PF14531Kinase-like70-178 aa
PF07387Seadorna_VP786-120 aa
PF17667Pkinase_fungal87-149 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G413980PF00069Pkinase22321.8e-64218.4
TkA05G413980PF03109ABC1121284.6e-0626.7
TkA05G413980PF07714PK_Tyr_Ser-Thr132273.2e-43148.6
TkA05G413980PF06293Kdo621270.1412.3
TkA05G413980PF14531Kinase-like701789.3e-0522.5
TkA05G413980PF07387Seadorna_VP7861200.03913.7
TkA05G413980PF17667Pkinase_fungal871490.2111.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAD5拟南芥sp|Q9CAD5|YODA_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA62.100%Swiss-Prot高置信
F4HRJ4拟南芥sp|F4HRJ4|M3K3A_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 358.100%Swiss-Prot高置信
Q9C5H5拟南芥sp|Q9C5H5|M3K5G_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 561.600%Swiss-Prot中等置信
O22040拟南芥sp|O22040|ANP1_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase ANP151.900%Swiss-Prot中等置信

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