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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_021473
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 130859530-130862379 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2364 bp · LXL04_021473|LXL04_021473|OH1004|cDNA

ATGACGGATGATGATTACGCAATTAATGAGCAGACTTCCAAGCAACACTGGGAAGATCTCCTCCGTAAGATGTTGCCGGTCGGCGCCCCCTTACCCGACGAAGATCAACTCGATTTCTCAATTTCCGTCGAATACCAACCCCCCACGCACCCACACAATAACGTCCACTACCACCCCCTTTCCGGAACCACCAGCCCTATACCCAtaatcaaaaattcaaatttcacCAGACCCCCAAAAATTCACCATAAGTACACTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2364 bp · LXL04_021473|LXL04_021473|OH1004|CDS

ATGACGGATGATGATTACGCAATTAATGAGCAGACTTCCAAGCAACACTGGGAAGATCTCCTCCGTAAGATGTTGCCGGTCGGCGCCCCCTTACCCGACGAAGATCAACTCGATTTCTCAATTTCCGTCGAATACCAACCCCCCACGCACCCACACAATAACGTCCACTACCACCCCCTTTCCGGAACCACCAGCCCTATACCCATAATCAAAAATTCAAATTTCACCAGACCCCCAAAAATTCACCATAAGTACACTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

787 aa · LXL04_021473|LXL04_021473|OH1004|PROTEIN

MTDDDYAINEQTSKQHWEDLLRKMLPVGAPLPDEDQLDFSISVEYQPPTHPHNNVHYHPLSGTTSPIPIIKNSNFTRPPKIHHKYTTATSNLAASVVTPVPESGEDKNSDVPSFDTTQDEEEEQQEEDNASSTSVTASPVVETGGKKNQKKSICSRCGNGNRLKDKEGCIVCDARYCNNCLLKAMGSMPEGRKCVGCIGQPIDESRRQKLGKSSKMLSKICSPLEVRQIMLAEKECFANQLRPEQLVVNGRQLKQEDLSE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_021473
TK1151 IDTkA05G398730
OH-1004 IDLXL04_021473
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 48.412
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_021473
位置Chr04:130859530-130862379 (+)
描述Similar to XLG3: Extra-large guanine nucleotide-binding protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31930 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。
Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
Regulation of root-wave response by extra large and conventional G proteins in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03506.x
At2g23460 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。
Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
At4g34390 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。
Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
Arabidopsis extra large G-protein 2 (XLG2) interacts with the Gbeta subunit of heterotrimeric G protein and functions in disease resistance.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssp001
Ca2+-dependent GTPase, extra-large G protein 2 (XLG2), promotes activation of DNA-binding protein related to vernalization 1 (RTV1), leading to activation of floral integrator genes and early flowering in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.317412

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0333200 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）可能作为各种跨膜信号系统的调节因子或传导子（可能）。
The U-box E3 ubiquitin ligase TUD1 functions with a heterotrimeric G α subunit to regulate Brassinosteroid-mediated growth in rice.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003391
UniProt: A2Y3B5 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为调节因子或转导因子参与各种跨膜信号系统。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021473 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007188 adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0034052 positive regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048639 positive regulation of developmental growth 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31930
ath:AT2G23460
ath:AT4G34390
dosa:Os05g0333200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.449
排名 1 · LXL04_021473 · OH-1004
细胞质0.362
排名 2 · LXL04_021473 · OH-1004
细胞核0.264
排名 3 · LXL04_021473 · OH-1004
高尔基体0.065
排名 4 · LXL04_021473 · OH-1004
内质网0.062
排名 5 · LXL04_021473 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00503.27G-alpha402-759 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_021473PF00503.27G-alpha4027598.1e-70236.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C516拟南芥Extra-large guanine nucleotide-binding protein 353.270%Swiss-Prot强数据库同源证据
O80462拟南芥Extra-large guanine nucleotide-binding protein 147.571%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C6KIE6拟南芥Extra-large guanine nucleotide-binding protein 242.630%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q0DJ33水稻Guanine nucleotide-binding protein alpha-1 subunit36.119%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
A2Y3B5水稻Guanine nucleotide-binding protein alpha-1 subunit36.119%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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