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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G407200
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 101261206-101262591 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1221 bp · TkA05G407200|TK1151|cDNA

ATGGAGGAGTGTTTTCACGCGCACCAGTTCTTCAGGATTCCAAAATTCAATCAACATATGCAGGAGAATCAGCTCTACCACAAAGTTGTATCCTATCTCAATTCGTTACCATCAGCCGCGGATTCCGATTTCGTCAATCTTCAACACATTCATAAAGTCGCGGAGGAGATCGAGCTAAAGAGTAACGAAGTCAGGCTATACATCAACGCGGAAACCGAACCAGAGAAGAACGGGAGATGGAAATCGATTCCGTTCACACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1221 bp · TkA05G407200|TK1151|CDS

ATGGAGGAGTGTTTTCACGCGCACCAGTTCTTCAGGATTCCAAAATTCAATCAACATATGCAGGAGAATCAGCTCTACCACAAAGTTGTATCCTATCTCAATTCGTTACCATCAGCCGCGGATTCCGATTTCGTCAATCTTCAACACATTCATAAAGTCGCGGAGGAGATCGAGCTAAAGAGTAACGAAGTCAGGCTATACATCAACGCGGAAACCGAACCAGAGAAGAACGGGAGATGGAAATCGATTCCGTTCACACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

406 aa · TkA05G407200|TK1151|PROTEIN

MEECFHAHQFFRIPKFNQHMQENQLYHKVVSYLNSLPSAADSDFVNLQHIHKVAEEIELKSNEVRLYINAETEPEKNGRWKSIPFTHPATIDTAMIDSEFKTKVKSDLEQFLKSKQYYHRLGRVWKRSYLLYGQSGTGKSSFIAGMAKFLCYDLYDVDMSKVTGDSDLKLLLLQTTSKSMIVVEDLDRYLFEKEKSTAVSLSGILNFMDGIISCCGEERVMVFTVSNKDQIDPTVLRPGRIDVHIHFPLCDFSSFKNLAN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G407200
TK1151 IDTkA05G407200
OH-1004 IDLXL04_021572
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)87.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 87.643
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G407200
位置Chr05:101261206-101262591 (+)
描述Similar to At2g46620: AAA-ATPase At2g46620
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g46620 AAA-ATP酶 At2g46620。 暂无已核实直接文献
At5g17760 AAA-ATP酶 At5g17760。 暂无已核实直接文献
At3g28580 AAA-ATP酶 At3g28580。 暂无已核实直接文献
At4g25835 AAA-ATP酶 At4g25835。 暂无已核实直接文献
At3g50930 蛋白 HYPER-SENSITIVITY-RELATED 4。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021572 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000304 response to singlet oxygen 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G46620
ath:AT3G28540
ath:AT3G28580
ath:AT4G25835
ath:AT5G57480
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.356
排名 1 · TkA05G407200 · TK1151
细胞质0.325
排名 2 · TkA05G407200 · TK1151
细胞膜0.116
排名 3 · TkA05G407200 · TK1151
线粒体0.100
排名 4 · TkA05G407200 · TK1151
质体0.078
排名 5 · TkA05G407200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14363AAA_assoc4-40 aa
PF25201nSTAND630-69 aa
PF05673DUF81575-229 aa
PF27394Aq_aa2779-93 aa
PF25568AAA_lid_At3g2854088-114 aa
PF27113GbsR_C92-124 aa
PF13191AAA_16117-151 aa
PF03193RsgA_GTPase125-146 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G407200PF14363AAA_assoc4400.04914.8
TkA05G407200PF25201nSTAND630690.1313.0
TkA05G407200PF05673DUF815752290.0001122.2
TkA05G407200PF27394Aq_aa2779930.09313.3
TkA05G407200PF25568AAA_lid_At3g28540881143.9e-1246.6
TkA05G407200PF27113GbsR_C921240.0714.4
TkA05G407200PF13191AAA_161171510.01816.3
TkA05G407200PF03193RsgA_GTPase1251460.07113.6
TkA05G407200PF12775AAA_71261740.1312.6
TkA05G407200PF13479AAA_241271540.00318.0
TkA05G407200PF13555AAA_291271510.01116.2
TkA05G407200PF13401AAA_221271680.07914.0
TkA05G407200PF25201nSTAND61281480.1313.0
TkA05G407200PF00004AAA1292491.7e-1248.6
TkA05G407200PF07728AAA_51301690.02715.2
TkA05G407200PF27394Aq_aa271301970.09313.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IJ77拟南芥sp|F4IJ77|AATP4_ARATH AAA-ATPase At2g4662050.000%Swiss-Prot高置信
Q9FN75拟南芥sp|Q9FN75|AATPI_ARATH AAA-ATPase At5g1776040.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LJJ7拟南芥sp|Q9LJJ7|AATP9_ARATH AAA-ATPase At3g2858037.000%Swiss-Prot中等置信
Q8RY66拟南芥sp|Q8RY66|AATPD_ARATH AAA-ATPase At4g2583538.100%Swiss-Prot中等置信
Q8VZG2拟南芥sp|Q8VZG2|HSR4_ARATH Protein HYPER-SENSITIVITY-RELATED 442.900%Swiss-Prot中等置信

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