ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 43 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G043730
Chr04:11764191-11771437 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036459
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CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 63.985 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G043730 |
|
TkA04G043840
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036456
Chr08:42509063-42521620 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.800 查询 93.540 / 对象 35.711 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G043840 |
|
TkA04G043870
Chr04:11803485-11806176 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036456
Chr08:42509063-42521620 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 89.683 / 对象 16.120 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G043870 |
|
TkA04G043900
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036451
Chr08:42480965-42481390 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G043900 |
|
TkA04G044150
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_003301
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CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.800 查询 100.000 / 对象 54.965 |
TkA04G044150 | |
|
TkA04G044540
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GWHBCHF00000005
|
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CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 98.893 / 对象 94.700 |
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|
TkA04G044600
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_003132
Chr01:68848657-68851410 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
45.700 查询 63.636 / 对象 77.778 |
TkA04G044600 | |
|
TkA04G045200
Chr04:12197926-12201314 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036447
Chr08:42318649-42319500 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 98.893 / 对象 94.700 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G045200 |
|
TkA04G046640
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036437
Chr08:41937429-41939332 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.900 查询 97.924 / 对象 52.214 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G046640 |
|
TkA04G046910
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036435
Chr08:41880958-41882694 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 99.567 / 对象 41.865 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G046910 |
|
TkA04G047470
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|
LXL04_036426
Chr08:41758376-41760190 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.200 查询 100.000 / 对象 64.073 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G047470 |
|
TkA04G047590
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036424
Chr08:41742370-41744203 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.700 查询 100.000 / 对象 65.854 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G047590 |
|
TkA04G048240
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036420
Chr08:41698697-41703502 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 62.171 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G048240 |
|
TkA04G048300
Chr04:12955723-12956061 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_032056
Chr07:15743324-15743950 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 82.143 / 对象 63.448 |
TkA04G048300 | |
|
TkA04G049230
Chr04:13218324-13220687 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036408
Chr08:41445742-41447824 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 50.436 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G049230 |
|
TkA04G049290
Chr04:13234789-13237120 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036407
Chr08:41429713-41431817 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G049290 |
|
TkA04G049340
Chr04:13259886-13262302 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036406
Chr08:41416724-41418815 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G049340 |
|
TkA04G049600
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_005827
Chr01:174221362-174222100 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G049600 | |
|
TkA04G049920
Chr04:13377466-13379049 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036402
Chr08:41351286-41352869 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G049920 |
|
TkA04G050080
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036398
Chr08:41322013-41325847 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.400 查询 59.077 / 对象 26.966 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G050080 |
|
TkA04G050680
Chr04:13575769-13576209 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036388
Chr08:41175711-41176151 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G050680 |
|
TkA04G050970
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|
LXL04_036384
Chr08:41111716-41114645 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 82.121 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G050970 |
|
TkA04G051090
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|
LXL04_036380
Chr08:41071552-41072264 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G051090 |
|
TkA04G051100
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|
LXL04_036379
Chr08:41069581-41070097 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G051100 |
|
TkA04G051110
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|
LXL04_036378
Chr08:41068136-41069168 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G051110 |
|
TkA04G051120
Chr04:13677377-13679666 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036377
Chr08:41055395-41057435 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 96.825 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G051120 |
|
TkA04G051670
Chr04:13888170-13890605 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036367
Chr08:40874350-40880643 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 99.548 / 对象 39.497 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G051670 |
|
TkA04G051780
Chr04:13918862-13920758 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036362
Chr08:40831855-40832545 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G051780 |
|
TkA04G052250
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_019307
Chr04:28443151-28449877 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.500 查询 59.836 / 对象 34.928 |
TkA04G052250 | |
|
TkA04G052570
Chr04:14101559-14106335 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036356
Chr08:40614745-40616956 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.800 查询 92.732 / 对象 99.282 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G052570 |
|
TkA04G052670
Chr04:14122648-14123088 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036352
Chr08:40597307-40597720 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 83.562 / 对象 89.051 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G052670 |
|
TkA04G052770
Chr04:14150649-14153731 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036351
Chr08:40566729-40571962 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 94.619 / 对象 46.993 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G052770 |
|
TkA04G053650
Chr04:14330521-14333710 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036342
Chr08:40385577-40385906 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 48.230 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G053650 |
|
TkA04G053730
Chr04:14353383-14353712 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036338
Chr08:40339166-40339495 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G053730 |
|
TkA04G053880
Chr04:14385163-14385600 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036337
Chr08:40308190-40308918 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.900 查询 93.103 / 对象 55.785 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G053880 |
|
TkA04G053940
Chr04:14407493-14409211 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_007484
Chr02:50022103-50026731 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.300 查询 100.000 / 对象 35.603 |
TkA04G053940 | |
|
TkA04G054720
Chr04:14625492-14626029 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036327
Chr08:40115805-40117268 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.800 查询 92.903 / 对象 29.569 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G054720 |
|
TkA04G054730
Chr04:14626041-14626562 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036327
Chr08:40115805-40117268 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 35.524 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G054730 |
|
TkA04G054780
Chr04:14640904-14641431 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036326
Chr08:40105679-40106472 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 73.143 / 对象 63.054 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G054780 |
|
TkA04G055070
Chr04:14701253-14704746 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036322
Chr08:40011546-40014289 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G055070 |
|
TkA04G055110
Chr04:14710042-14712226 (+)
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|
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CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA04G055130
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LXL04_036320
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CM104806.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 53.304 / 对象 100.000 |
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CM104800.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 52.000 |
TkA04G055560 | |
|
TkA04G055600
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.087 / 对象 30.004 |
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CM104806.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.300 查询 100.000 / 对象 78.811 |
TkA04G056760 | |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 98.148 / 对象 52.268 |
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TkA04G056920
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 94.821 / 对象 49.128 |
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CM104806.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 95.768 / 对象 43.897 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.800 查询 41.317 / 对象 53.906 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.100 查询 92.486 / 对象 19.822 |
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84.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104806.1
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96.200 查询 96.324 / 对象 37.861 |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.500 查询 90.476 / 对象 43.869 |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.283 / 对象 24.387 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
35.500 查询 50.262 / 对象 80.417 |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 53.363 |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.500 查询 39.378 / 对象 77.551 |
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Chr08:38971555-38982699 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.100 查询 100.000 / 对象 99.301 |
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CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 90.756 |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.700 查询 49.324 / 对象 47.468 |
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CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 100.000 / 对象 17.656 |
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|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.300 查询 100.000 / 对象 55.336 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
63.000 查询 54.000 / 对象 28.571 |
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Chr08:38386036-38388005 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
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Chr08:37974494-37975917 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
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Chr07:33168273-33172479 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 16.327 |
TkA04G063450 | |
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|
LXL04_009068
Chr02:117331615-117332265 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G064360 | |
|
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|
LXL04_001107
Chr01:20439443-20441404 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 80.864 |
TkA04G066620 | |
|
TkA04G066840
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|
LXL04_036164
Chr08:37392309-37397009 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 97.514 / 对象 46.023 |
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|
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Chr08:37397442-37397830 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G066860 |
|
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|
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Chr08:37412333-37417077 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 87.417 / 对象 21.394 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G066910 |
|
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|
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Chr09:42433374-42435351 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 57.186 / 对象 96.954 |
TkA04G067340 | |
|
TkA04G067920
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|
LXL04_034484
Chr07:102623323-102630472 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
69.800 查询 92.105 / 对象 46.945 |
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|
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|
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Chr02:126670757-126672717 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
34.100 查询 43.195 / 对象 41.582 |
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|
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|
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Chr08:37636160-37639166 (-)
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|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 58.523 |
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|
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Chr08:37771584-37772647 (+)
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
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Chr08:37773241-37776333 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.200 查询 95.062 / 对象 77.389 |
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|
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96.300 查询 97.514 / 对象 46.023 |
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Chr06:99061506-99064477 (-)
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100.000 查询 100.000 / 对象 26.415 |
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|
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Chr08:36669738-36670727 (+)
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.100 查询 100.000 / 对象 96.154 |
TkA04G071640 | |
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