ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 45224 条。当前显示第 453 / 453 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkAUNG098000
ChrUn:27682659-27685103 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_006972
Chr02:32633154-32634586 (-)
CM104800.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
96.600 查询 94.224 / 对象 89.691 |
TkAUNG098000 | |
|
TkAUNG098040
ChrUn:27706121-27706612 (+)
GWHBCHF00000001
|
未映射 | 未映射 | no protein hit 未映射 |
查询 / 对象 |
TkAUNG098040 | |
|
TkAUNG098090
ChrUn:27710910-27711749 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_014018
Chr03:40652569-40656216 (-)
CM104801.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
47.000 查询 93.548 / 对象 27.490 |
TkAUNG098090 | |
|
TkAUNG098100
ChrUn:27712163-27719482 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_010555
Chr02:148994112-148999951 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 84.871 / 对象 99.353 |
TkAUNG098100 | |
|
TkAUNG098110
ChrUn:27719521-27721625 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_022819
Chr05:10228521-10231197 (-)
CM104803.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
89.600 查询 98.049 / 对象 99.505 |
TkAUNG098110 | |
|
TkAUNG098130
ChrUn:27723124-27729500 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_010556
Chr02:149005388-149010038 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 98.986 / 对象 59.134 |
TkAUNG098130 | |
|
TkAUNG098160
ChrUn:27730114-27731301 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_035451
Chr08:22827131-22830652 (-)
CM104806.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
87.800 查询 33.065 / 对象 4.039 |
TkAUNG098160 | |
|
TkAUNG098280
ChrUn:27757681-27762721 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_036986
Chr08:51252224-51259674 (-)
CM104806.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
99.900 查询 100.000 / 对象 68.625 |
TkAUNG098280 | |
|
TkAUNG098290
ChrUn:27763729-27765440 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_036986
Chr08:51252224-51259674 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.174 / 对象 26.394 |
TkAUNG098290 | |
|
TkAUNG098310
ChrUn:27766798-27767845 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026958
Chr06:5882086-5885596 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.590 / 对象 27.740 |
TkAUNG098310 | |
|
TkAUNG098330
ChrUn:27771579-27773592 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026957
Chr06:5876683-5877840 (+)
CM104804.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG098330 | |
|
TkAUNG098340
ChrUn:27774651-27782769 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026956
Chr06:5863825-5865857 (+)
CM104804.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
63.900 查询 99.565 / 对象 96.017 |
TkAUNG098340 | |
|
TkAUNG098360
ChrUn:27787270-27789727 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_036907
Chr08:49958666-49960855 (+)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 86.176 / 对象 100.000 |
TkAUNG098360 | |
|
TkAUNG098490
ChrUn:27822341-27825558 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026084
Chr05:120717113-120720006 (+)
CM104803.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
97.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG098490 | |
|
TkAUNG098500
ChrUn:27826170-27828047 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026085
Chr05:120720899-120723388 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 99.765 / 对象 51.146 |
TkAUNG098500 | |
|
TkAUNG098510
ChrUn:27829074-27831285 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026086
Chr05:120723992-120725117 (-)
CM104803.1
|
多对一 | 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因 复杂 |
95.800 查询 74.214 / 对象 85.053 |
TkAUNG098510 | |
|
TkAUNG098590
ChrUn:27841685-27844412 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_026085
Chr05:120720899-120723388 (-)
CM104803.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
34.100 查询 86.207 / 对象 83.233 |
TkAUNG098590 | |
|
TkAUNG098670
ChrUn:27855866-27858130 (-)
GWHBCHF00000001
|
未映射 | 未映射 | no protein hit 未映射 |
查询 / 对象 |
TkAUNG098670 | |
|
TkAUNG098740
ChrUn:27870043-27872579 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_023271
Chr05:29945321-29947776 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG098740 | |
|
TkAUNG098750
ChrUn:27873161-27876037 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_009443
Chr02:126686029-126689367 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.300 查询 99.003 / 对象 90.840 |
TkAUNG098750 | |
|
TkAUNG098780
ChrUn:27888365-27890752 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_011999
Chr03:4447410-4453834 (-)
CM104801.1
|
多对一 | non reciprocal best hit 复杂 |
64.900 查询 92.803 / 对象 20.131 |
TkAUNG098780 | |
|
TkAUNG098790
ChrUn:27899124-27900710 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_011816
Chr03:802307-803458 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG098790 | |
|
TkAUNG098820
ChrUn:27904844-27906406 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_011817
Chr03:807719-809281 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG098820 | |
|
TkAUNG098840
ChrUn:27908551-27910604 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_011818
Chr03:811801-813820 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 70.936 |
TkAUNG098840 |
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