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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 45224 条。当前显示第 453 / 453 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkAUNG098000
ChrUn:27682659-27685103 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_006972
Chr02:32633154-32634586 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
96.600
查询 94.224 / 对象 89.691
TkAUNG098000
TkAUNG098040
ChrUn:27706121-27706612 (+)
GWHBCHF00000001
未映射 未映射 no protein hit
未映射

查询 / 对象
TkAUNG098040
TkAUNG098090
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GWHBCHF00000001
LXL04_014018
Chr03:40652569-40656216 (-)
CM104801.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
47.000
查询 93.548 / 对象 27.490
TkAUNG098090
TkAUNG098100
ChrUn:27712163-27719482 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_010555
Chr02:148994112-148999951 (+)
CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.800
查询 84.871 / 对象 99.353
TkAUNG098100
TkAUNG098110
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GWHBCHF00000001
LXL04_022819
Chr05:10228521-10231197 (-)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
89.600
查询 98.049 / 对象 99.505
TkAUNG098110
TkAUNG098130
ChrUn:27723124-27729500 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_010556
Chr02:149005388-149010038 (-)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
97.800
查询 98.986 / 对象 59.134
TkAUNG098130
TkAUNG098160
ChrUn:27730114-27731301 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_035451
Chr08:22827131-22830652 (-)
CM104806.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
87.800
查询 33.065 / 对象 4.039
TkAUNG098160
TkAUNG098280
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GWHBCHF00000001
LXL04_036986
Chr08:51252224-51259674 (-)
CM104806.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
99.900
查询 100.000 / 对象 68.625
TkAUNG098280
TkAUNG098290
ChrUn:27763729-27765440 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_036986
Chr08:51252224-51259674 (-)
CM104806.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 95.174 / 对象 26.394
TkAUNG098290
TkAUNG098310
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GWHBCHF00000001
LXL04_026958
Chr06:5882086-5885596 (+)
CM104804.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 97.590 / 对象 27.740
TkAUNG098310
TkAUNG098330
ChrUn:27771579-27773592 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_026957
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CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG098330
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GWHBCHF00000001
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CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
63.900
查询 99.565 / 对象 96.017
TkAUNG098340
TkAUNG098360
ChrUn:27787270-27789727 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_036907
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CM104806.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.800
查询 86.176 / 对象 100.000
TkAUNG098360
TkAUNG098490
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GWHBCHF00000001
LXL04_026084
Chr05:120717113-120720006 (+)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
97.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG098490
TkAUNG098500
ChrUn:27826170-27828047 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_026085
Chr05:120720899-120723388 (-)
CM104803.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.500
查询 99.765 / 对象 51.146
TkAUNG098500
TkAUNG098510
ChrUn:27829074-27831285 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_026086
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CM104803.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
95.800
查询 74.214 / 对象 85.053
TkAUNG098510
TkAUNG098590
ChrUn:27841685-27844412 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_026085
Chr05:120720899-120723388 (-)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
34.100
查询 86.207 / 对象 83.233
TkAUNG098590
TkAUNG098670
ChrUn:27855866-27858130 (-)
GWHBCHF00000001
未映射 未映射 no protein hit
未映射

查询 / 对象
TkAUNG098670
TkAUNG098740
ChrUn:27870043-27872579 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_023271
Chr05:29945321-29947776 (-)
CM104803.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG098740
TkAUNG098750
ChrUn:27873161-27876037 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_009443
Chr02:126686029-126689367 (-)
CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
97.300
查询 99.003 / 对象 90.840
TkAUNG098750
TkAUNG098780
ChrUn:27888365-27890752 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_011999
Chr03:4447410-4453834 (-)
CM104801.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
64.900
查询 92.803 / 对象 20.131
TkAUNG098780
TkAUNG098790
ChrUn:27899124-27900710 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_011816
Chr03:802307-803458 (-)
CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG098790
TkAUNG098820
ChrUn:27904844-27906406 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_011817
Chr03:807719-809281 (+)
CM104801.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG098820
TkAUNG098840
ChrUn:27908551-27910604 (+)
GWHBCHF00000001
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Chr03:811801-813820 (+)
CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 70.936
TkAUNG098840
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