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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G257980
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 67251307-67255394 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2452 bp · TkA08G257980|TK1151|cDNA

TTTTTTCGTACAAGAAATTTATTGCATCTACTGAACTTGGACTCGGTCTATTTCCAATCTCCAAAAAGGAAATAAAAGTTGTGTTTGAGAGAAACCGCTTTCATTCATTCATCTCACAAAGTCGCCATCACCAAGAAGAAAAAAAAAAAGACAATCCTCCTTCTTTTTCTCGCTGTTTTCAGGGGATAAGAGCGATCTGGGTCCCGATATACTCCCTTCTTTCGGTGTTCATGCTTTGGTGTTCATAAATCTTGTATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1578 bp · TkA08G257980|TK1151|CDS

ATGTCGTCTTCATCAACTTCAACATCGACTTCAACACAACCCACAAAACCCCCAATTTTGAAGAAACCAATCCTACCACCATCATCGAACCCGAAACCTAACTGGGTACTCAAGCAAAAAACCCCAATCCTTCAACAGTTGTACACAATCGGAAGAAAATTAGGACAAGGACAGTTCGGTACAACCCATCTATGCACAGAGAAATCCACAGGCATTCCTTACGCCTGCAAATCGATACCCAAGAAGAAACTCATATGCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

525 aa · TkA08G257980|TK1151|PROTEIN

MSSSSTSTSTSTQPTKPPILKKPILPPSSNPKPNWVLKQKTPILQQLYTIGRKLGQGQFGTTHLCTEKSTGIPYACKSIPKKKLICREDYEDVLKEIQIMHHLSEHTNVVRIKGTYEDALYVHIVMELCAGGELFDRIVQKGQYSEREAAKLIKTIVGVVEACHSLGVMHRDLKPENFLFSTTHEDATLKATDFGLSVFYKPGETFSDVVGSPYYVAPEVLRKHYGPESDVWSAGVILYILLSGVPPFWAETEMGIFRQI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G257980
TK1151 IDTkA08G257980
OH-1004 IDLXL04_032800
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)63.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.000 / OH-1004 78.974
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G257980
位置Chr08:67251307-67255394 (-)
描述Similar to CPK20: Calcium-dependent protein kinase 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g23580 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Expression of three members of the calcium-dependent protein kinase gene family in Arabidopsis thaliana.1996 · DOI: 10.1007/bf00019557
At4g09570 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
A novel yeast two-hybrid approach to identify CDPK substrates: characterization of the interaction between AtCPK11 and AtDi19, a nuclear zinc finger protein.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.01.013
Two calcium-dependent protein kinases, CPK4 and CPK11, regulate abscisic acid signal transduction in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050666

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0169800 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os04g0584600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
Os11g0171500 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032800 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1900055 regulation of leaf senescence 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38910
ath:AT3G10660
ath:AT5G04870
dosa:Os03g0788500
dosa:Os03g0789000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.574
排名 1 · TkA08G257980 · TK1151
细胞核0.246
排名 2 · TkA08G257980 · TK1151
细胞膜0.238
排名 3 · TkA08G257980 · TK1151
高尔基体0.136
排名 4 · TkA08G257980 · TK1151
内质网0.078
排名 5 · TkA08G257980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase48-306 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr49-300 aa
PF09373PMBR87-97 aa
PF01636APH88-155 aa
PF06293Kdo124-188 aa
PF03109ABC1124-202 aa
PF14531Kinase-like141-292 aa
PF24548EF_EFCAB10_C161-176 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G257980PF00069Pkinase483061.5e-78264.5
TkA08G257980PF07714PK_Tyr_Ser-Thr493003.1e-2899.5
TkA08G257980PF09373PMBR87970.06914.0
TkA08G257980PF01636APH881550.05414.0
TkA08G257980PF06293Kdo1241885.9e-0523.3
TkA08G257980PF03109ABC11242020.005916.5
TkA08G257980PF14531Kinase-like1412920.03414.1
TkA08G257980PF24548EF_EFCAB10_C1611769.9e-1038.6
TkA08G257980PF01636APH1661830.05414.0
TkA08G257980PF29176Allatotropin-like_C2793010.4610.8
TkA08G257980PF23564EF-hand_FSTL12812990.0003421.7
TkA08G257980PF13499EF-hand_72853001.3e-2899.9
TkA08G257980PF13405EF-hand_62853011.3e-2896.6
TkA08G257980PF13833EF-hand_83353765.3e-1865.2
TkA08G257980PF12763EH3464144.9e-0833.6
TkA08G257980PF25825SAPC2_N3474130.0005420.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42396拟南芥sp|Q42396|CDPKC_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1278.000%Swiss-Prot高置信
Q38869拟南芥sp|Q38869|CDPK4_ARATH Calcium-dependent protein kinase 475.900%Swiss-Prot高置信
Q2QX45水稻sp|Q2QX45|CDPKS_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2876.100%Swiss-Prot高置信
Q9FXQ3水稻sp|Q9FXQ3|CDPKD_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1372.400%Swiss-Prot高置信
Q53P85水稻sp|Q53P85|CDPKO_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2474.300%Swiss-Prot高置信

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