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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G227190
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 59151022-59155764 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2431 bp · TkA08G227190|TK1151|cDNA

TTTGGACATGATGTCGAAAACAGCCCCTATAAATACAATGCCATTTATTTAAAAAATGGAAAACCGTCAATAGATTTCCGATAAAGTCAACAATTCCAGAGAGAGAAAGCAGAGTGTCGGAGAGAGAAGAATCGTGGACTGCTGATTTCTGTGATGCGTGGAAGCAGGTGGCAGAACAATGAAGAGATCTCGGTGGAAACTTTCTTCTTATTAAAATGGCAACTCCTCACTCCATCCGAACCCTAGCGCCAAATCCCTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1932 bp · TkA08G227190|TK1151|CDS

ATGACGGAGGTAGCGAAATTGCTGTACATAGTGGTGGAGGAGGATGAAGAAACGAAAGGGAATGAAGAATCGTCATTTAGATACACGCGTCCTGTTCTTCAGAGCACTTTGCAGTTAATGGGATGTAAAGCACGTCACGCCTTCAAGATAAGCCAGAGAGTATTCGAAATCATGAGAAATAAATGCTTAGAGGACACTTTGGCAGACATAGGTGTAATTCAATGGGGAAAAGATTTCTTCAAAGTTCATCCTCTATCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

643 aa · TkA08G227190|TK1151|PROTEIN

MTEVAKLLYIVVEEDEETKGNEESSFRYTRPVLQSTLQLMGCKARHAFKISQRVFEIMRNKCLEDTLADIGVIQWGKDFFKVHPLSDKMNTSNHVISEKDGKPFESYKKRTTIVIKRSRFIDVVCDALSEYKYIGPNQRADFLLACRIRERKESVTVLLCGTSGCGKSTLSALLASRLGITTVISTDSIRHMMRSFVDEKQNPLLWSSTYHAGEHLDPVAVSEAKAKKKATKESTDHPVTKEASSLTTVDLISPKQMAIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G227190
TK1151 IDTkA08G227190
OH-1004 IDLXL04_033042
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.844 / OH-1004 99.852
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G227190
位置Chr08:59151022-59155764 (-)
描述Similar to At3g45090: P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g45090 种子中植酸的积累可能不需要。
Genetic analysis of two OsLpa1-like genes in Arabidopsis reveals that only one is required for wild-type seed phytic acid levels.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1243-5
At5g60760 种子中植酸积累所需。
Genetic analysis of two OsLpa1-like genes in Arabidopsis reveals that only one is required for wild-type seed phytic acid levels.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1243-5

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0819400 种子中植酸积累所需。
The rice OsLpa1 gene encodes a novel protein involved in phytic acid metabolism.2008 · DOI: 10.1007/s00122-008-0818-z
Os09g0572200 种子中植酸积累所需。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033042 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010264 myo-inositol hexakisphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45090
ath:AT5G60760
ddi:DDB_G0273453
ddi:DDB_G0273565
dosa:Os02g0819400
dosa:Os09g0572200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.447
排名 1 · TkA08G227190 · TK1151
细胞核0.426
排名 2 · TkA08G227190 · TK1151
细胞膜0.117
排名 3 · TkA08G227190 · TK1151
高尔基体0.071
排名 4 · TkA08G227190 · TK1151
内质网0.064
排名 5 · TkA08G227190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28345LPA1_N10-151 aa
PF01583APS_kinase89-126 aa
PF03215Rad17148-182 aa
PF20703nSTAND1148-284 aa
PF03193RsgA_GTPase149-182 aa
PF05496RuvB_N149-184 aa
PF06414Zeta_toxin150-211 aa
PF24883NPHP3_N151-274 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G227190PF28345LPA1_N101511.3e-53181.6
TkA08G227190PF01583APS_kinase891260.08213.7
TkA08G227190PF03215Rad171481820.00417.8
TkA08G227190PF20703nSTAND11482840.2611.6
TkA08G227190PF03193RsgA_GTPase1491820.006317.1
TkA08G227190PF05496RuvB_N1491840.05513.9
TkA08G227190PF06414Zeta_toxin1502110.003917.4
TkA08G227190PF24883NPHP3_N1512740.01316.4
TkA08G227190PF02367TsaE1511840.1113.2
TkA08G227190PF015916PF2K1521761.09.3
TkA08G227190PF20720nSTAND31531990.02315.1
TkA08G227190PF01583APS_kinase1541920.08213.7
TkA08G227190PF13555AAA_291541700.1113.0
TkA08G227190PF00005ABC_tran1551780.01117.0
TkA08G227190PF13671AAA_331572044.3e-0731.0
TkA08G227190PF13238AAA_181572012.1e-0628.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZS1拟南芥sp|Q93ZS1|LPAH2_ARATH P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog 261.800%Swiss-Prot高置信
Q9FJH9拟南芥sp|Q9FJH9|LPAH1_ARATH P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog 158.200%Swiss-Prot高置信
B9F4I8水稻sp|B9F4I8|LPA1_ORYSJ P-loop NTPase domain-containing protein LPA161.600%Swiss-Prot高置信
Q651A1水稻sp|Q651A1|LPA1H_ORYSJ P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog58.400%Swiss-Prot高置信

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