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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G169330
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44297160-44298770 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1189 bp · TkA08G169330|TK1151|cDNA

AGTGAACCTGGCCGGTTAAAACCATGGAAACACGGAGAATATTCGTCACACAAGAGATCCCTCATCGAATATACCCCTTGATTGTTCCAAAATCCACTATTTCTTCATATATTTTATCAATCAAACCCATTGTCAATGCTCTAATTCTCTTTCTGTATATATATCTGTGAACAGACGTGATTCACAGCAAAACATTCATATTCTCGTTGAAATCGGTCCGAATTTCGACTTGTTTTATTGTCAAACAAGATGCAGTTCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

873 bp · TkA08G169330|TK1151|CDS

ATGCAGTTCTATAAGCTTCTGAAGAAATTGATCGACGAGATGTTTCCGGATTGGAGAGATAAGTTTCTCTCATATAAGGATCTTAAGAAGCTATTGAAGCGGGTTTACTCTAGAGACGGTCGCTGTAATAAAAGAATGAAATTGAGCAGCGGTGACGCGATTGAGACGATGGCGGAAGAGAAGGAGGTTGTGGATTTCGTGAAATTGTGCCAGGAGCAGACCGATAAGCTTAATGATTTTGTTTTGGAAAAACAAGAGTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

290 aa · TkA08G169330|TK1151|PROTEIN

MQFYKLLKKLIDEMFPDWRDKFLSYKDLKKLLKRVYSRDGRCNKRMKLSSGDAIETMAEEKEVVDFVKLCQEQTDKLNDFVLEKQEWYIIKVEVLEGNLIAAKDSRQELMKVARDLADLHGEIILLLNYSALNYTGLVKILKKHDKLSGALVRVPFIQKVLNEPFYKTDVLNNLVKKCEMMLDKISPMKEQTSSTSESIIMNEGRSSETLTEPNESSSVRVPDDLVEIENRENKYLKLTLSALTVLAEIRGGSSTINMFS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G169330
TK1151 IDTkA08G169330
OH-1004 IDLXL04_032359
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G169330
位置Chr08:44297160-44298770 (+)
描述Similar to SPX2: SPX domain-containing protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26660 可能以 Pi 依赖方式抑制 PHR1 的 DNA 结合活性。
SPX1 is a phosphate-dependent inhibitor of Phosphate Starvation Response 1 in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1404654111
At5g20150 在植物适应磷酸盐饥饿方面发挥积极作用。
Characterization of a sub-family of Arabidopsis genes with the SPX domain reveals their diverse functions in plant tolerance to phosphorus starvation.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03460.x
SPX1 is a phosphate-dependent inhibitor of Phosphate Starvation Response 1 in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1404654111

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0603600 参与植物对磷酸盐 饥饿的适应。
Involvement of OsSPX1 in phosphate homeostasis in rice.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03734.x
Regulation of OsSPX1 and OsSPX3 on expression of OsSPX domain genes and Pi-starvation signaling in rice.2009 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2009.00834.x
OsSPX1 suppresses the function of OsPHR2 in the regulation of expression of OsPT2 and phosphate homeostasis in shoots of rice.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04170.x
Rice SPX1 and SPX2 inhibit phosphate starvation responses through interacting with PHR2 in a phosphate-dependent manner.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1404680111
An SPX-RLI1 Module Regulates Leaf Inclination in Response to Phosphate Availability in Rice.2018 · DOI: 10.1105/tpc.17.00738
UniProt: B8B4D0 参与植物对磷酸盐 (Pi) 缺乏的适应（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X254 通过磷酸盐（Pi）依赖的蛋白相互作用抑制PHR2的DNA结合活性（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032359 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0051511 negative regulation of unidimensional cell growth 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0080040 positive regulation of cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:2000024 regulation of leaf development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26660
ath:AT5G20150
dosa:Os02g0202200
dosa:Os06g0603600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.525
排名 1 · TkA08G169330 · TK1151
细胞质0.421
排名 2 · TkA08G169330 · TK1151
细胞膜0.184
排名 3 · TkA08G169330 · TK1151
内质网0.052
排名 4 · TkA08G169330 · TK1151
溶酶体／液泡0.044
排名 5 · TkA08G169330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03105SPX8-37 aa
PF30927DUF876143-86 aa
PF15874Il2rg44-96 aa
PF03105SPX50-112 aa
PF15874Il2rg115-128 aa
PF03105SPX117-160 aa
PF15874Il2rg202-236 aa
PF03105SPX205-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G169330PF03105SPX8372.1e-1558.3
TkA08G169330PF30927DUF876143860.002818.2
TkA08G169330PF15874Il2rg44960.113.6
TkA08G169330PF03105SPX501122.1e-1558.3
TkA08G169330PF15874Il2rg1151280.113.6
TkA08G169330PF03105SPX1171602.1e-1558.3
TkA08G169330PF15874Il2rg2022360.113.6
TkA08G169330PF03105SPX2052142.1e-1558.3
TkA08G169330PF30927DUF87612112490.002818.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O48781拟南芥sp|O48781|SPX2_ARATH SPX domain-containing protein 247.200%Swiss-Prot中等置信
Q8LBH4拟南芥sp|Q8LBH4|SPX1_ARATH SPX domain-containing protein 143.000%Swiss-Prot中等置信
Q69XJ0水稻sp|Q69XJ0|SPX1_ORYSJ SPX domain-containing protein 144.000%Swiss-Prot中等置信
B8B4D0水稻sp|B8B4D0|SPX1_ORYSI SPX domain-containing protein 144.000%Swiss-Prot中等置信
A2X254水稻sp|A2X254|SPX2_ORYSI SPX domain-containing protein 240.700%Swiss-Prot中等置信

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