基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G169330 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:44297160-44298770 (+) |
| 描述 | Similar to SPX2: SPX domain-containing protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032359 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g26660 |
可能以 Pi 依赖方式抑制 PHR1 的 DNA 结合活性。 | |
At5g20150 |
在植物适应磷酸盐饥饿方面发挥积极作用。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0603600 |
参与植物对磷酸盐 饥饿的适应。 |
Regulation of OsSPX1 and OsSPX3 on expression of OsSPX domain genes and Pi-starvation signaling in rice.2009 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2009.00834.x OsSPX1 suppresses the function of OsPHR2 in the regulation of expression of OsPT2 and phosphate homeostasis in shoots of rice.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04170.x
|
UniProt: B8B4D0 |
参与植物对磷酸盐 (Pi) 缺乏的适应(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2X254 |
通过磷酸盐(Pi)依赖的蛋白相互作用抑制PHR2的DNA结合活性(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016036 | cellular response to phosphate starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.241; 覆盖度=100.0; E 值=7.1e-78; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051511 | negative regulation of unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.333; 覆盖度=103.448; E 值=2.84e-73; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070417 | cellular response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.333; 覆盖度=103.448; E 值=2.84e-73; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071456 | cellular response to hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.241; 覆盖度=100.0; E 值=7.1e-78; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080040 | positive regulation of cellular response to phosphate starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.333; 覆盖度=103.448; E 值=2.84e-73; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000024 | regulation of leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.333; 覆盖度=103.448; E 值=2.84e-73; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.241; 覆盖度=100.0; E 值=7.1e-78; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.241; 覆盖度=100.0; E 值=7.1e-78; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.007; 覆盖度=98.621; E 值=2.68e-70; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G26660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.241; 覆盖度=100.0; E 值=7.1e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G20150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.007; 覆盖度=98.621; E 值=2.68e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0202200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.525; 覆盖度=95.862; E 值=1.53e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0603600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.333; 覆盖度=103.448; E 值=2.84e-73 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |