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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G284320
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 71327576-71328460 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

802 bp · TkA07G284320|TK1151|cDNA

AAAACAGTGGCGACAACGAGCCTTCGAAGTTTCAACATGGCTATGATGTCATCATCACCACCATTACGCGCCGGAGATATCTATCCACCTCCACCTCCAGCTCACTCCACCACCGCCAGCACTCAACTCGTAACAAAATCTCAACTTCCTCGCCGACGAGAACCTATCCATTTGTCTGAAAAAATCAATCATCTCTGCCAATTGAAAAACCTCACCGGAGCTCTGACTTTGCTCCACGTTTCCCCTCCCGAGCTCACAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

570 bp · TkA07G284320|TK1151|CDS

ATGGCTATGATGTCATCATCACCACCATTACGCGCCGGAGATATCTATCCACCTCCACCTCCAGCTCACTCCACCACCGCCAGCACTCAACTCGTAACAAAATCTCAACTTCCTCGCCGACGAGAACCTATCCATTTGTCTGAAAAAATCAATCATCTCTGCCAATTGAAAAACCTCACCGGAGCTCTGACTTTGCTCCACGTTTCCCCTCCCGAGCTCACAGAAACCGCCAAAGCAACCGGTATTCTATTGCAGGCATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

189 aa · TkA07G284320|TK1151|PROTEIN

MAMMSSSPPLRAGDIYPPPPPAHSTTASTQLVTKSQLPRRREPIHLSEKINHLCQLKNLTGALTLLHVSPPELTETAKATGILLQACGGNKDIETGRKVHQLVSSSTHLRNNVILNTQIITMYSVCGSPSDSRLVFEQLQEKNLYQWNAIISGYTRNDLCLYRSFKFEMWTGGSGIGGEVKFDIGCFRR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G284320
TK1151 IDTkA07G284320
OH-1004 IDLXL04_030552
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)91.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 84.127 / OH-1004 10.320
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G284320
位置Chr07:71327576-71328460 (-)
描述Similar to SPPA: Serine protease SPPA, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18485 含五重复肽结构域的蛋白 At1g18485。 暂无已核实直接文献
At2g37320 含五十二肽重复的蛋白At2g37320。 暂无已核实直接文献
At3g13770 假定含有五肽重复蛋白的蛋白 At3g13770，存在于线粒体中。 暂无已核实直接文献
At3g09040 含五肽重复序列的蛋白 At3g09040，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g21470 含五重复肽的蛋白 At3g21470。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030552 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0006465 signal peptide processing 生物过程
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:0009642 response to light intensity 生物过程
GO:0031425 chloroplast RNA processing 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18485
ath:AT1G73990
ath:AT3G03580
ath:AT3G63370
ath:AT4G21300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.433
排名 1 · TkA07G284320 · TK1151
质体0.409
排名 2 · TkA07G284320 · TK1151
细胞核0.070
排名 3 · TkA07G284320 · TK1151
细胞质0.035
排名 4 · TkA07G284320 · TK1151
细胞膜0.007
排名 5 · TkA07G284320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01535PPR50-66 aa
PF01535PPR82-100 aa
PF01535PPR119-143 aa
PF01535PPR147-159 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G284320PF01535PPR50660.0002222.0
TkA07G284320PF01535PPR821000.0002222.0
TkA07G284320PF01535PPR1191430.0002222.0
TkA07G284320PF01535PPR1471590.0002222.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WN60拟南芥sp|Q0WN60|PPR48_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g1848550.000%Swiss-Prot中等置信
Q9ZUT4拟南芥sp|Q9ZUT4|PP192_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g3732032.100%Swiss-Prot低置信
Q9LIC3拟南芥sp|Q9LIC3|PP227_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g13770, mitochondrial29.000%Swiss-Prot低置信
Q9SS83拟南芥sp|Q9SS83|PP220_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g09040, mitochondrial36.800%Swiss-Prot低置信
Q9LVF9拟南芥sp|Q9LVF9|PP245_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g2147036.200%Swiss-Prot低置信

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