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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G453140
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 113423065-113424972 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1746 bp · TkA05G453140|TK1151|cDNA

ATGCCTAAAAGAAACGTTGTATCTTGGAACATGATCATTTCCATATTATCCAAGCATGGTCATGTCACAAAGACACTTGGTATGTTCATCGAGATGTGTATTCAAGGTTTTCGACCAAATTCCATGACATATGCCAGTGTTCTCAGTGCTTGTACTAGCATGCATGACCTTCCATGGGGCATCCACTTACATGGGCGAATTGTCCGAATGCAACAACATATCGATGCATATATAGCCACCGCTTTAATCGACATGTATGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1746 bp · TkA05G453140|TK1151|CDS

ATGCCTAAAAGAAACGTTGTATCTTGGAACATGATCATTTCCATATTATCCAAGCATGGTCATGTCACAAAGACACTTGGTATGTTCATCGAGATGTGTATTCAAGGTTTTCGACCAAATTCCATGACATATGCCAGTGTTCTCAGTGCTTGTACTAGCATGCATGACCTTCCATGGGGCATCCACTTACATGGGCGAATTGTCCGAATGCAACAACATATCGATGCATATATAGCCACCGCTTTAATCGACATGTATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

581 aa · TkA05G453140|TK1151|PROTEIN

MPKRNVVSWNMIISILSKHGHVTKTLGMFIEMCIQGFRPNSMTYASVLSACTSMHDLPWGIHLHGRIVRMQQHIDAYIATALIDMYAKCGHYKKARQIFNNLKEHNIVSWTSMIGGATHCGNELEAFSLFKQMKEIPIPSDQFTLATILGACCSLKDLHLGTQIHGYSIAIGMESRIPVANALVTMYAKCGDIQNATNAFNLMPHKDIISWTTMITGYSNTGNVEKAREYFDKMPERNIISWNSMLGGYIQNGIWEEGFK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G453140
TK1151 IDTkA05G453140
OH-1004 IDLXL04_022244
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)90.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.074 / OH-1004 44.143
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G453140
位置Chr05:113423065-113424972 (+)
描述Similar to PHT1-9: Probable inorganic phosphate transporter 1-9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g13650 含五重复肽基序蛋白 At4g13650。 暂无已核实直接文献
At1g11290 参与叶绿体中多个位点的RNA编辑事件。
Pentatricopeptide repeat proteins with the DYW motif have distinct molecular functions in RNA editing and RNA cleavage in Arabidopsis chloroplasts.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.064667
At4g33170 含五肽重复序列的蛋白 At4g33170。 暂无已核实直接文献
At1g15510 调节叶绿体转录本 accD 的 RNA 编辑，对于叶绿体生物发生的早期阶段至关重要。
AtECB2, a pentatricopeptide repeat protein, is required for chloroplast transcript accD RNA editing and early chloroplast biogenesis in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03930.x
Editing of accD and ndhF chloroplast transcripts is partially affected in the Arabidopsis vanilla cream1 mutant.2010 · DOI: 10.1007/s11103-010-9616-5
A point mutation in the pentatricopeptide repeat motif of the AtECB2 protein causes delayed chloroplast development.2011 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2011.01030.x
At3g11460 参与线粒体 RNA 的 C 到 U 编辑。
MEF10 is required for RNA editing at nad2-842 in mitochondria of Arabidopsis thaliana and interacts with MORF8.2013 · DOI: 10.1007/s11103-012-0003-2

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022244 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:1901684 arsenate ion transmembrane transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0015293 symporter activity 分子功能
GO:0015415 ATPase-coupled phosphate ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20860
ath:AT1G76430
ath:AT4G13650
dosa:Os06g0324800
dosa:Os06g0325200
osa:4340904
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.682
排名 1 · TkA05G453140 · TK1151
质体0.183
排名 2 · TkA05G453140 · TK1151
细胞核0.047
排名 3 · TkA05G453140 · TK1151
细胞质0.035
排名 4 · TkA05G453140 · TK1151
细胞膜0.007
排名 5 · TkA05G453140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12854PPR_13-32 aa
PF13041PPR_24-51 aa
PF13812PPR_35-52 aa
PF01535PPR7-36 aa
PF05172RRM_Nup3510-29 aa
PF23276TPR_2411-101 aa
PF17177PPR_long12-103 aa
PF12854PPR_136-49 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G453140PF12854PPR_13323.3e-2691.4
TkA05G453140PF13041PPR_24515e-63209.7
TkA05G453140PF13812PPR_35523e-2382.4
TkA05G453140PF01535PPR7364.2e-56184.1
TkA05G453140PF05172RRM_Nup3510290.3211.7
TkA05G453140PF23276TPR_24111014.5e-0937.0
TkA05G453140PF17177PPR_long121030.000221.5
TkA05G453140PF12854PPR_136493.3e-2691.4
TkA05G453140PF01535PPR43634.2e-56184.1
TkA05G453140PF17177PPR_long441940.000221.5
TkA05G453140PF18768RNPP_C641030.001219.1
TkA05G453140PF29070MSC6_N661213e-0833.9
TkA05G453140PF09295ChAPs682050.06213.0
TkA05G453140PF17049AEP1691131.2e-0525.3
TkA05G453140PF00637Clathrin711040.01715.6
TkA05G453140PF10553MSV199711100.1413.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SVP7拟南芥sp|Q9SVP7|PP307_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g1365034.600%Swiss-Prot中等置信
Q3E6Q1拟南芥sp|Q3E6Q1|PPR32_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g11290, chloroplastic31.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SMZ2拟南芥sp|Q9SMZ2|PP347_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g3317031.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M9E2拟南芥sp|Q9M9E2|PPR45_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g15510, chloroplastic30.200%Swiss-Prot中等置信
Q9CAY1拟南芥sp|Q9CAY1|PP223_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g11460, mitochondrial29.500%Swiss-Prot低置信

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