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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G344010
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 86953884-86958718 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3344 bp · TkA04G344010|TK1151|cDNA

GATTGATTAGATATCGAGCAACATTTAATGGGGTTTAGGTAGTTCATTATAAATAGAAGTATAGATCAAGAAACCAAAATTAAATTAAAAAAATTAAAAAAATACCAGAAGAATAGAGAAGTATTAAAGAGAGTAACCTCAGGCTCGTGAAGCAGCAGGCAAGAAGAGGAAATAATTTAAATTAAACAAAAAAACAATTCTGAAAAAAATATAAAAAAATCCATCATCTCCTTCCCTTCTCTTTCCTCTCTGTGAAACCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2106 bp · TkA04G344010|TK1151|CDS

ATGTCGCATTCACGGAAGCCGGATTCGGGGTTAGGGTTTGATACACTCTCCGATCGCCTCCGGAAGACAGTCACTTGCGGCGGAGATAACACCAATAAACCGGACTTCCGAGAACTTGATTTGGGTTCGCCCATTTCGCCTTTACGAGATGGACCGGCGATTAGTAGCAGCTCTAGCTCATCCGGGTCGGTTTCTGGTCGGACTGGAAATGGACTCCAGGTTGGGTCCGGTACTAGAAAGTCAGACTCCGGTGGGACTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

701 aa · TkA04G344010|TK1151|PROTEIN

MSHSRKPDSGLGFDTLSDRLRKTVTCGGDNTNKPDFRELDLGSPISPLRDGPAISSSSSSSGSVSGRTGNGLQVGSGTRKSDSGGTPNNHSGELSVDSSPTFSAGGSRGLKSGHTRSDSGSVSGGHPSIFTGGSSATSPPVNVLPTGNICPSGRVLKTGMMSTRTSKPDVLSLGTGNYGHGSIMRGGSSSGSGSSPTIKSSASAGKPETPVSGGSNSPYSRRSSMDPEDLKKLGNEEYKKGHFLEALSFYDRAISQSPAN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G344010
TK1151 IDTkA04G344010
OH-1004 IDLXL04_037739
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G344010
位置Chr04:86953884-86958718 (+)
描述Similar to TTL1: TPR repeat-containing thioredoxin TTL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g53300 参与对渗透压和脱落酸 的反应。
The Arabidopsis tetratricopeptide repeat-containing protein TTL1 is required for osmotic stress responses and abscisic acid sensitivity.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.085191
The Arabidopsis tetratricopeptide thioredoxin-like gene family is required for osmotic stress tolerance and male sporogenesis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188920
At3g58620 参与渗透压和盐胁迫耐受性。
The Arabidopsis tetratricopeptide thioredoxin-like gene family is required for osmotic stress tolerance and male sporogenesis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188920
At2g42580 参与渗透压和盐胁迫耐受性。 暂无已核实直接文献
At3g14950 在雄配子体的传递中发挥作用。
The Arabidopsis tetratricopeptide thioredoxin-like gene family is required for osmotic stress tolerance and male sporogenesis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188920

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037739 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53300
ath:AT2G42580
ath:AT3G14950
ath:AT3G58620
ddi:DDB_G0288639
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.552
排名 1 · TkA04G344010 · TK1151
细胞核0.343
排名 2 · TkA04G344010 · TK1151
细胞膜0.086
排名 3 · TkA04G344010 · TK1151
高尔基体0.073
排名 4 · TkA04G344010 · TK1151
过氧化物酶体0.066
排名 5 · TkA04G344010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29407CFAP70_TPR_C223-264 aa
PF13371TPR_9226-261 aa
PF07719TPR_2228-260 aa
PF13428TPR_14228-269 aa
PF25575TPR_BSK1_C229-296 aa
PF00515TPR_1230-259 aa
PF29386CFAP70_mid_TPR230-316 aa
PF25068ARM_TT21_4th231-288 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G344010PF29407CFAP70_TPR_C2232640.311.3
TkA04G344010PF13371TPR_92262616.4e-0626.8
TkA04G344010PF07719TPR_22282603e-2896.2
TkA04G344010PF13428TPR_142282695.6e-1245.8
TkA04G344010PF25575TPR_BSK1_C2292966.4e-0730.0
TkA04G344010PF00515TPR_12302597.1e-2689.6
TkA04G344010PF29386CFAP70_mid_TPR2303160.001719.3
TkA04G344010PF25068ARM_TT21_4th2312885.4e-0524.2
TkA04G344010PF03704BTAD2312830.2412.4
TkA04G344010PF13432TPR_162322936.9e-1246.3
TkA04G344010PF13424TPR_122322545.7e-0523.9
TkA04G344010PF13181TPR_82332601.1e-0835.3
TkA04G344010PF21033RMD1-32332720.006916.3
TkA04G344010PF13374TPR_102332540.09813.4
TkA04G344010PF13414TPR_112342711.5e-1970.1
TkA04G344010PF14559TPR_192402862e-1660.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MAH1拟南芥sp|Q9MAH1|TTL1_ARATH TPR repeat-containing thioredoxin TTL153.200%Swiss-Prot高置信
Q84JR9拟南芥sp|Q84JR9|TTL4_ARATH TPR repeat-containing thioredoxin TTL444.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SIN1拟南芥sp|Q9SIN1|TTL3_ARATH Inactive TPR repeat-containing thioredoxin TTL343.200%Swiss-Prot中等置信
F4IXE4拟南芥sp|F4IXE4|TTL2_ARATH TPR repeat-containing thioredoxin TTL245.100%Swiss-Prot中等置信

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