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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G125720
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 32665608-32671359 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1299 bp · TkA04G125720|TK1151|cDNA

ATGTGATGCCCTATGTTGATCCACAATATCCTTTTCTCAACTCATAGCAACAGTTCGGTGTTTCCCCTGTTCCTGAGCAAACCCCAAAGTTAGAGCAGAGAAGCAGACGACTACCATGGATGATTCCAAAATTAAAGAACTCAAGCTCTTCGTCGAGAGTTGCCAAGCCGACCCCTCAATTCTACATAGCCCATCTCTAGGTTTCTTCAAATCCTTTCTCCAAAGCCTCGGCGCCAAAATCCCACCAGCATCAACATCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1167 bp · TkA04G125720|TK1151|CDS

ATGGATGATTCCAAAATTAAAGAACTCAAGCTCTTCGTCGAGAGTTGCCAAGCCGACCCCTCAATTCTACATAGCCCATCTCTAGGTTTCTTCAAATCCTTTCTCCAAAGCCTCGGCGCCAAAATCCCACCAGCATCAACATCGAATGCAGGAAATGGACACACATCCAATGATGAGATTATGGAGTCAGACCTCGAGTTAGATGATTCAGATGTTGTAAAGCCTGACATAGACCCTCCCCAAAAGATGGGAGATCTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

388 aa · TkA04G125720|TK1151|PROTEIN

MDDSKIKELKLFVESCQADPSILHSPSLGFFKSFLQSLGAKIPPASTSNAGNGHTSNDEIMESDLELDDSDVVKPDIDPPQKMGDLSIEVTDENRDLAQTLKSKAIDAISQGKLNEAIDHLTEAIMMNPTSAILYATRANVFVKLQKPNAAIRDADVALQINADSAKGYKMRGIARAMLGLWEEAARDLGIASNLDYDDEIGSLLKKIEPNVHKIKEHRRKYERLRKEKKAKEDERERQKSRPKTEEMDASSQTNGEVVP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G125720
TK1151 IDTkA04G125720
OH-1004 IDLXL04_035515
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.041 / OH-1004 99.180
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G125720
位置Chr04:32665608-32671359 (-)
描述Similar to TDX: TPR repeat-containing thioredoxin TDX
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q8VWG7 硫醇-二硫键氧化还原酶，具有还原胰岛素二硫键的活性、二硫还原酶活性、折叠酶伴侣活性和保持伴侣活性。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0401200 可能的巯基-二硫键氧化还原酶，可能参与各种氧化还原反应，并在热冲击下充当分子伴侣。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035515 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0051259 protein complex oligomerization 生物过程
GO:0000118 histone deacetylase complex 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分
GO:0016667 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors 分子功能
GO:0016671 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor 分子功能
GO:0030544 Hsp70 protein binding 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G17880
ath:AT4G22670
dosa:Os09g0401200
gga:418003
osa:4346999
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.590
排名 1 · TkA04G125720 · TK1151
细胞核0.463
排名 2 · TkA04G125720 · TK1151
线粒体0.075
排名 3 · TkA04G125720 · TK1151
细胞膜0.056
排名 4 · TkA04G125720 · TK1151
内质网0.039
排名 5 · TkA04G125720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18253HipN2-43 aa
PF25575TPR_BSK1_C85-164 aa
PF25524RSLD_CPSF689-144 aa
PF13424TPR_1292-125 aa
PF13431TPR_1797-118 aa
PF00515TPR_198-130 aa
PF13728TraF98-141 aa
PF07719TPR_2103-130 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G125720PF18253HipN2436.8e-1968.0
TkA04G125720PF25575TPR_BSK1_C851640.007616.8
TkA04G125720PF25524RSLD_CPSF6891440.03615.0
TkA04G125720PF13424TPR_12921250.03515.0
TkA04G125720PF13431TPR_17971180.01316.4
TkA04G125720PF00515TPR_1981306.6e-0832.8
TkA04G125720PF13728TraF981410.02615.1
TkA04G125720PF07719TPR_21031304e-0833.5
TkA04G125720PF13432TPR_161041330.008617.2
TkA04G125720PF14559TPR_191081650.0005620.9
TkA04G125720PF29407CFAP70_TPR_C1081990.08413.1
TkA04G125720PF02064MAS201081323.38.1
TkA04G125720PF13371TPR_91091541.6e-0525.6
TkA04G125720PF13428TPR_141091390.1413.7
TkA04G125720PF13181TPR_81091300.212.7
TkA04G125720PF13414TPR_111101456.6e-0626.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VWG7拟南芥sp|Q8VWG7|TDX_ARATH TPR repeat-containing thioredoxin TDX57.800%Swiss-Prot高置信
Q6ES52水稻sp|Q6ES52|TDX_ORYSJ TPR repeat-containing thioredoxin TDX54.700%Swiss-Prot高置信

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