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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G113010
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 29345008-29354476 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

822 bp · TkA04G113010|TK1151|cDNA

TGATCCAATCTCCCTCCAATGTCGATAGCAGACGATAGATTCTGCAGTGATGGTTGATTTTTGAGAGAGAGAAGGGCAGAAACGCAGCAAAAATGTCATCTGCAACTTCCCTTCGCTCCCCTTTCCTCTCACCTCCTCTTTCCCCATCGAAGATTTCTTCGTCTTCGTCTCCTCATTTTCACCCGCTTTCCTTCAGATGCTCAAGAAATCAACGCTCCCCTGCTTCTTATCCTCACCTCATCAAAGCCGAGCTCGACACG...

CDS

下载 CDS FASTA

2580 bp · TkA04G113010|TK1151|CDS

ATGTCATCTGCAACTTCCCTTCGCTCCCCTTTCCTCTCACCTCCTCTTTCCCCATCGAAGATTTCTTCGTCTTCGTCTCCTCATTTTCACCCGCTTTCCTTCAGATGCTCAAGAAATCAACGCTCCCCTGCTTCTTATCCTCACCTCATCAAAGCCGAGCTCGACACGAATACAGTGGTAGCAGTAGCAGTTGGGGTGGTGAGCGTCGCTTTTGGAATTGGTGTACCGATATTCTACGAATCGCAGATTGATAATGCGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

859 aa · TkA04G113010|TK1151|PROTEIN

MSSATSLRSPFLSPPLSPSKISSSSSPHFHPLSFRCSRNQRSPASYPHLIKAELDTNTVVAVAVGVVSVAFGIGVPIFYESQIDNAAKRDNTQPCFPCTGTGAQSCRFCTGSGNVTVELGGGEKEVSRCINCDGAGSLTCTTCQGSGIQPRYLDRRMMTREWDRRFKSVFQRGKVYQLVSERVGAGRRWEKTRLQKQHKGRRPPKLDNVEEFVGILHDQMKKQTKKTQAQTDDIELLKTKMDTVINHQDEMRKNMSKLLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G113010
TK1151 IDTkA04G113010
OH-1004 IDLXL04_031674
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)56.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 61.118 / OH-1004 21.243
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G113010
位置Chr04:29345008-29354476 (+)
描述Similar to Tf2-6: Transposon Tf2-6 polyprotein (Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g75690 蛋白质二硫键异构酶可能参与与 HHL1 形成复合物，通过调节 PSII 复合物的修复和重新组装来维持高光下光系统 II 的活性。
A small zinc finger thylakoid protein plays a role in maintenance of photosystem II in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.085456
HYPERSENSITIVE TO HIGH LIGHT1 interacts with LOW QUANTUM YIELD OF PHOTOSYSTEM II1 and functions in protection of photosystem II from photodamage in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.122424

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031674 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0015074 DNA integration 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003887 DNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0003964 RNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0004519 endonuclease activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
spo:2538755
spo:2541833
spo:2541991
spo:2542672
spo:2542797
spo:2543673
spo:3361218
spo:3361422
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.650
排名 1 · TkA04G113010 · TK1151
线粒体0.315
排名 2 · TkA04G113010 · TK1151
细胞质0.077
排名 3 · TkA04G113010 · TK1151
细胞核0.056
排名 4 · TkA04G113010 · TK1151
过氧化物酶体0.040
排名 5 · TkA04G113010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21002TMEM106_N87-118 aa
PF28694SCO2_C88-102 aa
PF17302DUF535193-104 aa
PF25112zf-AtTam3793-117 aa
PF30758Orange_C95-148 aa
PF25436BSD2_CRD95-119 aa
PF00684DnaJ_CXXCXGXG95-147 aa
PF28694SCO2_C105-137 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G113010PF21002TMEM106_N871180.004718.2
TkA04G113010PF28694SCO2_C881020.0813.7
TkA04G113010PF17302DUF5351931041.9e-0835.2
TkA04G113010PF25112zf-AtTam37931170.1713.3
TkA04G113010PF30758Orange_C951480.000222.4
TkA04G113010PF25436BSD2_CRD951190.002318.8
TkA04G113010PF00684DnaJ_CXXCXGXG951470.8410.7
TkA04G113010PF28694SCO2_C1051370.0813.7
TkA04G113010PF17302DUF53511061371.9e-0835.2
TkA04G113010PF25436BSD2_CRD1291490.002318.8
TkA04G113010PF21002TMEM106_N1291560.004718.2
TkA04G113010PF25112zf-AtTam371291470.1713.3
TkA04G113010PF17302DUF53511361471.9e-0835.2
TkA04G113010PF28694SCO2_C1391490.0813.7
TkA04G113010PF03732PEG10_N-capsid3183822.2e-1144.7
TkA04G113010PF19259Ty3_capsid3424602.3e-0731.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GSJ6拟南芥sp|Q8GSJ6|LQY1_ARATH Protein disulfide-isomerase LQY1, chloroplastic73.200%Swiss-Prot高置信

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