RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G104970
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 27321099-27332347 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

7799 bp · TkA04G104970|TK1151|cDNA

AACTCCCAGTCTTGGACCCATGGTCTCTCTCATTTATGTATATCTTTAAGGCGCCTCACCAAAAAACCAACCAACAAACCAAACCCCAACCAAACCACACTTAATTCCAACCCCCATTCCATCCCCCCTACAACTACTCGCATCTCTCCAGATTTCCGCCATTCCAGTTTCTTCACAATCTCTTCTAATCTCTTCTTCTTTTCAATTCTCTCTCTGCTGTTCAAAGCAGCTTCAAAAAGACAAAAACTCTATTCGTCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1776 bp · TkA04G104970|TK1151|CDS

ATGGAGCATTTAGTGTACCCTAATCCAGCTGCCTACAGAGATAAACTAATACGGTTTTCTACCCTCAACCACACAAATTACTCCGAGTTAGCATTGAAGGCAAGTCAACTACTAGAACAAACTAAACTAAGTGAACTTCGTTCAAGTATAGCTAGAAGTCTCTCAGAACTAGAAATGTTCACAGAAGAAGGTGAAAACATGGACACCCCTAAAAGAAAAAGCGCCATTAATGAAAGAATGGAGGATATTGTTAGCGCCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

591 aa · TkA04G104970|TK1151|PROTEIN

MEHLVYPNPAAYRDKLIRFSTLNHTNYSELALKASQLLEQTKLSELRSSIARSLSELEMFTEEGENMDTPKRKSAINERMEDIVSAPLAVEDALVGLFDHSDHTLQRRVVETYVRRLYQPYLAKGSVRMQWHRSGLIASWQFMEGHIEEVNSSEYEMTETPLVEKKWGAMVIIKSLQFLPDVIKAALKETTNNSNGNHGNMMHIALAGINNQMSLLQDSGDEDQAQERVNRLAKILKDKEVSSCLKSAGYGVISCIIQRD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G104970
TK1151 IDTkA04G104970
OH-1004 IDLXL04_035827
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.525 / OH-1004 22.626
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G104970
位置Chr04:27321099-27332347 (-)
描述Similar to ACC1: Acetyl-CoA carboxylase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g36160 多功能酶，催化乙酰辅酶A羧化，形成丙二酰辅酶A，用于质体中的脂肪酸合成以及细胞质中的各种生物合成途径，包括脂肪酸延伸。
Multifunctional acetyl-CoA carboxylase 1 is essential for very long chain fatty acid elongation and embryo development in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.016010.x
gurke and pasticcino3 mutants affected in embryo development are impaired in acetyl-CoA carboxylase.2004 · DOI: 10.1038/sj.embor.7400124
The GURKE gene encoding an acetyl-CoA carboxylase is required for partitioning the embryo apex into three subregions in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch148
Targeting of the Arabidopsis homomeric acetyl-coenzyme A carboxylase to plastids of rapeseeds.1997 · DOI: 10.1104/pp.113.1.75
The PASTICCINO genes of Arabidopsis thaliana are involved in the control of cell division and differentiation.1998 · DOI: 10.1242/dev.125.5.909
At1g36180 多功能酶，催化乙酰辅酶A羧化，形成丙二酰辅酶A，用于质体中的脂肪酸合成以及细胞质中的各种生物合成途径，包括脂肪酸延伸。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0363300 多功能酶，催化乙酰辅酶A羧化，形成丙二酰辅酶A，用于质体中的脂肪酸合成以及细胞质中的各种生物合成途径，包括脂肪酸延伸。 暂无已核实直接文献
Os05g0295300 多功能酶，催化乙酰辅酶A羧化，形成丙二酰辅酶A，用于质体中的脂肪酸合成以及细胞质中的各种生物合成途径，包括脂肪酸延伸。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035827 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009933 meristem structural organization 生物过程
GO:0010072 primary shoot apical meristem specification 生物过程
GO:0030497 fatty acid elongation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0101026 mitotic nuclear membrane biogenesis 生物过程
GO:2001295 malonyl-CoA biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G36160
ath:AT1G36180
dosa:Os05g0295300
dosa:Os10g0363300
osa:4348450
spo:2543344
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.457
排名 1 · TkA04G104970 · TK1151
细胞质0.340
排名 2 · TkA04G104970 · TK1151
线粒体0.155
排名 3 · TkA04G104970 · TK1151
细胞膜0.073
排名 4 · TkA04G104970 · TK1151
内质网0.057
排名 5 · TkA04G104970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08326ACC_central11-504 aa
PF28047HrpE-like202-234 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G104970PF08326ACC_central115046.8e-90303.0
TkA04G104970PF28047HrpE-like2022340.2112.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38970拟南芥sp|Q38970|ACC1_ARATH Acetyl-CoA carboxylase 169.800%Swiss-Prot高置信
F4I1L3拟南芥sp|F4I1L3|ACC2_ARATH Acetyl-CoA carboxylase 266.900%Swiss-Prot高置信
Q8S6N5水稻sp|Q8S6N5|ACC1_ORYSJ Acetyl-CoA carboxylase 161.900%Swiss-Prot高置信
B9FK36水稻sp|B9FK36|ACC2_ORYSJ Acetyl-CoA carboxylase 254.400%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看