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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G097750
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 25469813-25470832 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

951 bp · TkA04G097750|TK1151|cDNA

ATGTTTCTTCTCAAGTTCTTCAGTTGCTTTACGATTTCCGATAATTCCGCAACCGGCGTGAAGAAGTTTTCATGGGAGGAGATAAGAAAACGGACCAGGAATTTCTCAAGGGTCATCGGCTCCGGCGGGTTTAGTACTGTATACCTTGCTCGACTACCGGATTCTGGATTAACCGCCGTGAAAGTCCAATCAGCTTGCACGGAGATGCTCGCCGGAATTTATGAACAAGAGCTTAAGGTCTTGCTCCGATTAAACCACCG...

CDS

下载 CDS FASTA

951 bp · TkA04G097750|TK1151|CDS

ATGTTTCTTCTCAAGTTCTTCAGTTGCTTTACGATTTCCGATAATTCCGCAACCGGCGTGAAGAAGTTTTCATGGGAGGAGATAAGAAAACGGACCAGGAATTTCTCAAGGGTCATCGGCTCCGGCGGGTTTAGTACTGTATACCTTGCTCGACTACCGGATTCTGGATTAACCGCCGTGAAAGTCCAATCAGCTTGCACGGAGATGCTCGCCGGAATTTATGAACAAGAGCTTAAGGTCTTGCTCCGATTAAACCACCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

316 aa · TkA04G097750|TK1151|PROTEIN

MFLLKFFSCFTISDNSATGVKKFSWEEIRKRTRNFSRVIGSGGFSTVYLARLPDSGLTAVKVQSACTEMLAGIYEQELKVLLRLNHRNIVKILGYCDDRDDERVLLFEFASNGTLHDKLHVSSSLTLTWKVRKSIALQLAEALEYVHGLHIIHGDIKASNILLDEQQNCKLCDFGSAKLGFTSMVLPPSSTKMKRMIMGSQGYMDPHYLKTGLVSKKNDVYSYGVILLELVTGREAFSLEKSEKLTEVIGPVVSGVVGVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G097750
TK1151 IDTkA04G097750
OH-1004 IDLXL04_018678
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)35.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.405 / OH-1004 31.385
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G097750
位置Chr04:25469813-25470832 (+)
描述Similar to At5g48740: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g48740
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g33260 可能的类似受体的蛋白激酶 At1g33260。 暂无已核实直接文献
At4g10390 可能的受体样蛋白激酶At4g10390。 暂无已核实直接文献
At5g15730 钙/钙调蛋白调控的类似受体激酶 2。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XW02 可能作为双特异性蛋白激酶（可能）。 暂无已核实直接文献
Os04g0540900 可能作为双特异性蛋白激酶（可能）。
The Receptor-Like Cytoplasmic Kinase STRK1 Phosphorylates and Activates CatC, Thereby Regulating H2O2 Homeostasis and Improving Salt Tolerance in Rice.2018 · DOI: 10.1105/tpc.17.01000
The zinc finger protein DHHC09 S-acylates the kinase STRK1 to regulate H2O2 homeostasis and promote salt tolerance in rice.2024 · DOI: 10.1093/plcell/koae001
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018678 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G67720
ath:AT2G14510
ath:AT5G48740
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.556
排名 1 · TkA04G097750 · TK1151
细胞质0.343
排名 2 · TkA04G097750 · TK1151
细胞核0.233
排名 3 · TkA04G097750 · TK1151
内质网0.051
排名 4 · TkA04G097750 · TK1151
高尔基体0.048
排名 5 · TkA04G097750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr35-245 aa
PF00069Pkinase36-302 aa
PF03109ABC137-64 aa
PF01636APH74-147 aa
PF10707YrbL-PhoP_reg85-115 aa
PF12330Haspin_kinase100-179 aa
PF03109ABC1101-177 aa
PF01163RIO1102-175 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G097750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr352456.1e-35121.5
TkA04G097750PF00069Pkinase363029.7e-44150.4
TkA04G097750PF03109ABC137645.6e-0626.4
TkA04G097750PF01636APH741470.00318.1
TkA04G097750PF10707YrbL-PhoP_reg851150.1412.6
TkA04G097750PF12330Haspin_kinase1001790.2311.2
TkA04G097750PF03109ABC11011775.6e-0626.4
TkA04G097750PF01163RIO11021750.008316.5
TkA04G097750PF14531Kinase-like1261760.01615.2
TkA04G097750PF06293Kdo1271750.003717.4
TkA04G097750PF10707YrbL-PhoP_reg1311750.1412.6
TkA04G097750PF19974TCAD91421780.02314.6
TkA04G097750PF01636APH1491800.00318.1
TkA04G097750PF01163RIO12242470.008316.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0DKI6拟南芥sp|P0DKI6|Y1332_ARATH Probable receptor-like protein kinase At1g3326043.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SV83拟南芥sp|Q9SV83|Y4103_ARATH Probable receptor-like protein kinase At4g1039044.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LFV3拟南芥sp|Q9LFV3|CRLK2_ARATH Calcium/calmodulin-regulated receptor-like kinase 235.900%Swiss-Prot中等置信
A2XW02水稻sp|A2XW02|STRK1_ORYSI Salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 147.400%Swiss-Prot中等置信
Q7XR88水稻sp|Q7XR88|STRK1_ORYSJ Salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 147.400%Swiss-Prot中等置信

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