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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G413650
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 102868261-102873246 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3494 bp · TkA03G413650|TK1151|cDNA

CAAGAGATGAGAAGGCACCGATGGCATTGCGTGCGCCATTGGTTGACCATTAAACCTCTTCTGTCCGTCTGATTTAAAGCAAGCAACCGATCTCATGATCTCATCTCTTTTATTTGGCATCTTGCTATGAATCACAATGGAAAGGAACCGACCCTTTGACCACGGTGGCGTTAATTTTTAACGGCACACAAAGCAGCCTACCATGTTACGCAATCATATATAACAATCACGAAAAGAAAGAAATCATTTACCAAACCCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2835 bp · TkA03G413650|TK1151|CDS

ATGGAGGTCTCATCGTCATCATGTTCCTCCCCACTTTCGATTCATCGACTCGATTTCGCCCCACCTGTTTTGATCCGACCCATGTCGCGTTTCTCCTCCAAACCCGTTACCCGATTCACCCCTTCCACCACCTGTAACACTTCCTCTTCTTATGCATCTTCTTCTTCTGCTTCGTCGTCTTATTTTGGAGTCTCACTCTCGCACAAGCCCTTGAAATCGAAGAACAATAGCACCCTTTCTCGAAAAAGGCGTGGGTCGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

944 aa · TkA03G413650|TK1151|PROTEIN

MEVSSSSCSSPLSIHRLDFAPPVLIRPMSRFSSKPVTRFTPSTTCNTSSSYASSSSASSSYFGVSLSHKPLKSKNNSTLSRKRRGSFYIVAGVFERFTERAIKAVMFSQREAKALGKDMVFTQHLLLGLIAEDRSPGGFLESGITIDDAREAVRSIWDDEEPDQKEQVTTTSATDVSFSNSTKRVFEAAVEYSRTMGYKFIAPEHIAIGLLTVDDGSAGRVLQKLGADLNQLADVAVSRLQGELAKDGREAPKMLKNSSF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G413650
TK1151 IDTkA03G413650
OH-1004 IDLXL04_009257
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G413650
位置Chr03:102868261-102873246 (-)
描述Similar to CLPD: Chaperone protein ClpD, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g51070 与 ClpP 样蛋白酶相互作用的分子伴侣，参与叶绿体中变性蛋白质的降解。
Insights into the Clp/HSP100 chaperone system from chloroplasts of Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.211946
Chloroplastic Hsp100 chaperones ClpC2 and ClpD interact in vitro with a transit peptide only when it is located at the N-terminus of a protein.2012 · DOI: 10.1186/1471-2229-12-57
Characterization of the accessory protein ClpT1 from Arabidopsis thaliana: oligomerization status and interaction with Hsp100 chaperones.2014 · DOI: 10.1186/s12870-014-0228-0

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0405000 分子伴侣蛋白，可能与参与叶绿体中变性蛋白降解的ClpP样蛋白酶相互作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0526400 可能在热应激反应中发挥作用的分子伴侣。
Genome-wide analysis of rice ClpB/HSP100, ClpC and ClpD genes.2010 · DOI: 10.1186/1471-2164-11-95
Constitutive over-expression of rice ClpD1 protein enhances tolerance to salt and desiccation stresses in transgenic Arabidopsis plants.2016 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2016.06.004
Os12g0230100 分子伴侣蛋白，可能与参与叶绿体中变性蛋白降解的ClpP样蛋白酶相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009257 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:0065003 protein-containing complex assembly 生物过程
GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G51070
dosa:Os02g0526400
dosa:Os04g0405000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.948
排名 1 · TkA03G413650 · TK1151
线粒体0.066
排名 2 · TkA03G413650 · TK1151
细胞质0.028
排名 3 · TkA03G413650 · TK1151
细胞核0.026
排名 4 · TkA03G413650 · TK1151
过氧化物酶体0.020
排名 5 · TkA03G413650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02861Clp_N96-224 aa
PF02861Clp_N178-238 aa
PF00308Bac_DnaA292-342 aa
PF13191AAA_16296-345 aa
PF00158Sigma54_activat297-398 aa
PF20030bpMoxR297-352 aa
PF25201nSTAND6298-336 aa
PF01637ATPase_2299-338 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G413650PF02861Clp_N962245.4e-2795.2
TkA03G413650PF02861Clp_N1782385.4e-2795.2
TkA03G413650PF00308Bac_DnaA2923420.0007120.5
TkA03G413650PF13191AAA_162963451e-0836.6
TkA03G413650PF00158Sigma54_activat2973987e-0729.8
TkA03G413650PF20030bpMoxR2973520.008515.9
TkA03G413650PF25201nSTAND62983360.0713.9
TkA03G413650PF01637ATPase_22993380.0002221.8
TkA03G413650PF02367TsaE3003490.000720.3
TkA03G413650PF23569NBD_SMAX13003920.004717.5
TkA03G413650PF00931NB-ARC3003330.1912.0
TkA03G413650PF13604AAA_303063370.2112.0
TkA03G413650PF01078Mg_chelatase3103560.0007919.6
TkA03G413650PF01695IstB_IS213133400.0002321.5
TkA03G413650PF04851ResIII3133420.03414.8
TkA03G413650PF13401AAA_223143981.4e-0939.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42762拟南芥sp|P42762|CLPD_ARATH Chaperone protein ClpD, chloroplastic70.500%Swiss-Prot高置信
Q7XL03水稻sp|Q7XL03|CLPD2_ORYSJ Chaperone protein ClpD2, chloroplastic65.400%Swiss-Prot高置信
Q6H795水稻sp|Q6H795|CLPD1_ORYSJ Chaperone protein ClpD1, chloroplastic66.400%Swiss-Prot高置信
Q2QVG9水稻sp|Q2QVG9|CLPC2_ORYSJ Chaperone protein ClpC2, chloroplastic47.800%Swiss-Prot中等置信

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