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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G346800
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 85312322-85315950 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3518 bp · TkA03G346800|TK1151|cDNA

GTTGAATCCTTCCTTATTTTAGTACAAACCTGCTATACTTCATTTTGGTTCTGTTTATTTTCTGACTCATTTGAACCACGAATCTCAAGAATCCATTGAAGTAAAGTTTTTAAAGCAGAAGATTTAGCAGCAGAATCATGTCCGCAGAAAAGTTTATACTGATCGTGTTCTTGATTTTAGTCACAGGAAGTGAAGCCATTGGAGAGTTGCTTGACTTCGACAAGGAGGTACTTCTGGGTCTGAGATCATTCCTAGAACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

3198 bp · TkA03G346800|TK1151|CDS

ATGTCCGCAGAAAAGTTTATACTGATCGTGTTCTTGATTTTAGTCACAGGAAGTGAAGCCATTGGAGAGTTGCTTGACTTCGACAAGGAGGTACTTCTGGGTCTGAGATCATTCCTAGAACAGAGGAATAATGTTAATCAACGCGATTACAACCAATGGGACCCACAAGCGTCTTCGCCGTGTACATGGCCTGGAATTTCATGCTCCGGCAACCGAGTCGTCGGGATTAACCTCTCCAACAACAATATCGCCGGGAAGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1065 aa · TkA03G346800|TK1151|PROTEIN

MSAEKFILIVFLILVTGSEAIGELLDFDKEVLLGLRSFLEQRNNVNQRDYNQWDPQASSPCTWPGISCSGNRVVGINLSNNNIAGKIFNNFSALTELAYLDLSTNNIGGSIPVDLSKCQSLKVLNLSHNMIDSELNLTGLGSLEVLDLSVNRLSGNISKSFPMICSSLVVANLSANNFSGEIGNSIDGCIKLKYVDMSANFLTGIISFGFHRFKEFAVCENQLNNMLEPWIFAENCSLETLDLSENAFIGEIPMEISNCK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G346800
TK1151 IDTkA03G346800
OH-1004 IDLXL04_031452
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.531 / OH-1004 98.521
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G346800
位置Chr03:85312322-85315950 (-)
描述Similar to At1g74360: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g74360
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g74360 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g74360。 暂无已核实直接文献
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743
Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247
The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903
The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031452 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0002215 defense response to nematode 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55610
ath:AT1G74360
ath:AT4G39400
sly:101261320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · TkA03G346800 · TK1151
内质网0.090
排名 2 · TkA03G346800 · TK1151
细胞质0.066
排名 3 · TkA03G346800 · TK1151
细胞核0.047
排名 4 · TkA03G346800 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA03G346800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_227-69 aa
PF29594LRR_SKP272-154 aa
PF00560LRR_176-94 aa
PF12799LRR_476-107 aa
PF13855LRR_876-107 aa
PF13516LRR_677-85 aa
PF29247LRR_MHP1-HER1-GIP377-106 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2181-148 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G346800PF08263LRRNT_227694.8e-0627.5
TkA03G346800PF29594LRR_SKP2721540.03514.1
TkA03G346800PF00560LRR_176941.7e-47149.8
TkA03G346800PF12799LRR_4761072.4e-32110.9
TkA03G346800PF13855LRR_8761073.3e-32110.7
TkA03G346800PF13516LRR_677859.6e-0522.9
TkA03G346800PF29247LRR_MHP1-HER1-GIP3771066.86.5
TkA03G346800PF25019LRR_R13L1-DRL21811480.06813.8
TkA03G346800PF23598LRR_14841457.7e-2691.4
TkA03G346800PF23952LRR_EndoS881510.3212.0
TkA03G346800PF25013LRR_Zer-1911531.9e-0628.8
TkA03G346800PF24048LRR_NXF1-5941523.28.1
TkA03G346800PF00560LRR_1971181.7e-47149.8
TkA03G346800PF13516LRR_6991099.6e-0522.9
TkA03G346800PF24758LRR_At5g563701091300.002718.1
TkA03G346800PF13855LRR_81171533.3e-32110.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGJ1拟南芥sp|C0LGJ1|Y1743_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g7436060.700%Swiss-Prot高置信
Q9LYN8拟南芥sp|Q9LYN8|EMS1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS145.500%Swiss-Prot低置信
O22476拟南芥sp|O22476|BRI1_ARATH Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 141.200%Swiss-Prot低置信

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