基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_031452
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 6170217-6173552
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3249 bp · LXL04_031452|LXL04_031452|OH1004|cDNA
ATGGCAGCAAAGAGGATTACAATGATCCTTTTCCTGATTTTAATCTCAgGAAAGGATGCAATTGGAGACTCGCTGGATTCCGATAAGGAAGTACTTCTCAATCTCAAGTCATTTTTGGAACAAAAGAACAAAGTGAATCAAGGAGACTATAGGAAATGGGACCCGCTATCTCAGACGCCGTGCAATTGGCCGGGGATTTCGTGTTCCGGGAATCGAGTAACCGGAATCAGCCTCCCTGACAACGACATAGCTGGTAATTT...
CDS
下载 CDS FASTA3249 bp · LXL04_031452|LXL04_031452|OH1004|CDS
ATGGCAGCAAAGAGGATTACAATGATCCTTTTCCTGATTTTAATCTCAGGAAAGGATGCAATTGGAGACTCGCTGGATTCCGATAAGGAAGTACTTCTCAATCTCAAGTCATTTTTGGAACAAAAGAACAAAGTGAATCAAGGAGACTATAGGAAATGGGACCCGCTATCTCAGACGCCGTGCAATTGGCCGGGGATTTCGTGTTCCGGGAATCGAGTAACCGGAATCAGCCTCCCTGACAACGACATAGCTGGTAATTT...
1082 aa · LXL04_031452|LXL04_031452|OH1004|PROTEIN
MAAKRITMILFLILISGKDAIGDSLDSDKEVLLNLKSFLEQKNKVNQGDYRKWDPLSQTPCNWPGISCSGNRVTGISLPDNDIAGNFFGNFSALTELTHLDLSTNTIDGTIPPDLGSCRNLKALNLSHNIIGGELNLTGLSSLEIIDLSMNRFSGDIMMSIPRVCDALVVANLSANHFTGEITTSMDVCPKLEYVDVSSNLLTGNLWFGINRFTEFSVSENIVNGTLPAWIFRENCSLQALDLSGNALVGGIPKEISNCR...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_031452 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_031452 |
|---|---|
| 位置 | Chr07:6170217-6173552 (+) |
| 描述 | Similar to At1g74360: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g74360 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程 GO:0002215 defense response to nematode 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009416 response to light stimulus 生物过程 GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程 GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009791 post-embryonic development 生物过程 GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程 GO:0009845 seed germination 生物过程 GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G55610 ath:AT1G74360 ath:AT4G39400 sly:101261320 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.868
内质网0.084
细胞质0.067
细胞核0.047
溶酶体／液泡0.025
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08263.18LRRNT_226-69 aaPF13855.13LRR_877-129 aaPF13855.13LRR_8231-270 aaPF23598.2LRR_14240-361 aaPF13855.13LRR_8284-342 aaPF12799.14LRR_4284-326 aaPF13855.13LRR_8334-393 aaPF23598.2LRR_14376-463 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_031452 | PF08263.18 | LRRNT_2 | 26 | 69 | 8.3e-07 | 29.9 |
| LXL04_031452 | PF13855.13 | LRR_8 | 77 | 129 | 3.8e-35 | 120.2 |
| LXL04_031452 | PF13855.13 | LRR_8 | 231 | 270 | 3.8e-35 | 120.2 |
| LXL04_031452 | PF23598.2 | LRR_14 | 240 | 361 | 1.1e-28 | 100.8 |
| LXL04_031452 | PF13855.13 | LRR_8 | 284 | 342 | 3.8e-35 | 120.2 |
| LXL04_031452 | PF12799.14 | LRR_4 | 284 | 326 | 1.4e-32 | 111.7 |
| LXL04_031452 | PF13855.13 | LRR_8 | 334 | 393 | 3.8e-35 | 120.2 |
| LXL04_031452 | PF23598.2 | LRR_14 | 376 | 463 | 1.1e-28 | 100.8 |
| LXL04_031452 | PF12799.14 | LRR_4 | 382 | 422 | 1.4e-32 | 111.7 |
| LXL04_031452 | PF13855.13 | LRR_8 | 405 | 465 | 3.8e-35 | 120.2 |
| LXL04_031452 | PF23598.2 | LRR_14 | 556 | 657 | 1.1e-28 | 100.8 |
| LXL04_031452 | PF00069.32 | Pkinase | 795 | 1000 | 1.8e-43 | 149.5 |
| LXL04_031452 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 797 | 1060 | 5.9e-41 | 141.2 |
| LXL04_031452 | PF03109.23 | ABC1 | 863 | 946 | 1.1e-08 | 35.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。