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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G399920
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 101553197-101556968 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2338 bp · TkA02G399920|TK1151|cDNA

ACCCTTTAACATAGTATCTATATTACATGATAGAAAAGTAATATATGATCTTGAAAGTCAAATATAATTTATTATAATTGGTAAAAAAGGTGTAAAGAAACTTGATTAAACGGGAAAGAGTTATAAAAATTTGGAACCTATAAATCCTTTTAACCCTAAAAGAAAATCCTGAATGAAGGTGTGGTGAACTAAAATCCACCATTTCCATCCCTACAATCCCTCTCCAACATTCACCCATGCTTTCATCTCTTTCTCTCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1617 bp · TkA02G399920|TK1151|CDS

ATGGGGAACTGTTGTTCCCTAATTCACGCCAGAAGAAAACATGGAGACCCTGAATCCAAGCAAGCCCTAAAAGGAGACAACAAACCGCAAGAAGAAAAGAAAAACACAACCACCGCCCCCCCAAAACCCGTCACCGCCTCATCCGCCACCACAGCTGCTCAGCCACCGAAGAATGGCAACAACAAATCCGGTAGCGGGACGGTTTTGGGGCGTCCAATGGAAGACATTCGAACTCTCTACACCATCGGGAAGGAGCTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

538 aa · TkA02G399920|TK1151|PROTEIN

MGNCCSLIHARRKHGDPESKQALKGDNKPQEEKKNTTTAPPKPVTASSATTAAQPPKNGNNKSGSGTVLGRPMEDIRTLYTIGKELGRGQFGVTHLCTCKQTGKQLACKTIAKRKLANKEDIEDVRREVQIMHHLAGQPNIVELKGAFEDKHSVHLVMELCAGGELFDRIIAKGHYTERAAASLLRTIVRIIHTCHSMGVIHRDLKPENFLLQSTDEDAPLLATDFGLSVFYKQGEVFKDIVGSAYYIAPEVLKRKYGPE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G399920
TK1151 IDTkA02G399920
OH-1004 IDLXL04_005801
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)73.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.502 / OH-1004 86.932
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G399920
位置Chr02:101553197-101556968 (+)
描述Similar to CPK1: Calcium-dependent protein kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g12180 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g19360 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0808400 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0491900 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os11g0136600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005801 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G23650
ath:AT5G12180
ath:AT5G19360
dosa:Os05g0585500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.598
排名 1 · TkA02G399920 · TK1151
细胞质0.369
排名 2 · TkA02G399920 · TK1151
细胞核0.185
排名 3 · TkA02G399920 · TK1151
高尔基体0.093
排名 4 · TkA02G399920 · TK1151
内质网0.067
排名 5 · TkA02G399920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase80-338 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr81-333 aa
PF14531Kinase-like84-137 aa
PF01636APH117-186 aa
PF06293Kdo155-219 aa
PF03109ABC1155-234 aa
PF14531Kinase-like175-291 aa
PF01636APH198-216 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G399920PF00069Pkinase803383.8e-77260.0
TkA02G399920PF07714PK_Tyr_Ser-Thr813333.6e-2899.3
TkA02G399920PF14531Kinase-like841371.7e-0525.0
TkA02G399920PF01636APH1171860.04314.3
TkA02G399920PF06293Kdo1552191.8e-0525.0
TkA02G399920PF03109ABC11552340.00616.5
TkA02G399920PF14531Kinase-like1752911.7e-0525.0
TkA02G399920PF01636APH1982160.04314.3
TkA02G399920PF17959EF-hand_142342550.02915.4
TkA02G399920PF06293Kdo3583841.8e-0525.0
TkA02G399920PF20742DUF5580_M3684440.0116.6
TkA02G399920PF12763EH3784456.2e-0936.4
TkA02G399920PF25825SAPC2_N3794452e-0731.5
TkA02G399920PF24082SPEF2_C3794050.007316.8
TkA02G399920PF21008AIF-13824452.9e-1041.3
TkA02G399920PF25578EF-hand_STIM13854070.0001622.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FMP5拟南芥sp|Q9FMP5|CDPKH_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1775.200%Swiss-Prot高置信
Q3E9C0拟南芥sp|Q3E9C0|CDPKY_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3475.000%Swiss-Prot高置信
Q5VQQ5水稻sp|Q5VQQ5|CDPK2_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 283.100%Swiss-Prot高置信
B9FKW9水稻sp|B9FKW9|CDPKE_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1481.400%Swiss-Prot高置信
Q2RAV0水稻sp|Q2RAV0|CDPKP_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2578.400%Swiss-Prot高置信

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