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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G532730
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 133730182-133732640 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2159 bp · TkA01G532730|TK1151|cDNA

GGGATAGAAGGCGTGTGGGGGCGGAACGACCAGCGTGCCTTTTCCCTTTACATTACTGCAAACCTCTTGAAACTCATGTTTTTTATTCGAAATTCGATCTTCAATTTGGTCAAATTTGACGCATCACCAAGTTAGTTTCATCGATTTTACCCTAAACTGACCATTTCGGTTCAGCGATTCCTCAATTTGGTGAACTACCTGCTCTGACTTTTAGGGTGTTTGGAGCTCCTTCGATTTTGTTCAATGGTGGTGGTTTCGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1680 bp · TkA01G532730|TK1151|CDS

ATGGTGGTGGTTTCGAGTGGATTCGCTAGCTCTGTTGTTCTTACTGAATCCGATTTCAGAAACATGATGATCAGTCGTTCTTCTTCTTCATCTCGTTCGTTCGTTCATTTTAATCCACCGTCTTCGTCTTTAGCTTATGTTCCATCTCAGCTTCGTATAGACTCTAAGCCGGTTGGTGTTAGGAGATCGATATCCGATAGGGGATCAGCTCGTGTAAACCCTAGATGCGAGGATATGTCGGAGGGAACCACCGGTGATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

559 aa · TkA01G532730|TK1151|PROTEIN

MVVVSSGFASSVVLTESDFRNMMISRSSSSSRSFVHFNPPSSSLAYVPSQLRIDSKPVGVRRSISDRGSARVNPRCEDMSEGTTGDGSPASAKSSSLSALEALKTSAGDRYTKERSSVMVIGLNFHTSPVDIREKLSIPEAQLPQAISELCSLHHIEEAAVLSTCNRMEIYVVALSQHRGVKEVTEWMSKVSGVSVSEISRHQFLLYNKDATTHLFEVSSGLDSLVLGEGQILSQVKHVVKVSQGVPGFDRKISGLFKHA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G532730
TK1151 IDTkA01G532730
OH-1004 IDLXL04_001472
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.821 / OH-1004 62.486
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G532730
位置Chr01:133730182-133732640 (-)
描述Similar to HEMA1: Glutamyl-tRNA reductase 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g58290 催化 NADPH 依赖性谷氨酰-tRNA 还原为谷氨酸 1-半醛。
Divergent regulation of the HEMA gene family encoding glutamyl-tRNA reductase in Arabidopsis thaliana: expression of HEMA2 is regulated by sugars, but is independent of light and plastid signalling.2002 · DOI: 10.1023/a:1016081114758
Light regulation of chlorophyll biosynthesis at the level of 5-aminolevulinate formation in Arabidopsis.1994 · DOI: 10.1105/tpc.6.2.265
At1g09940 催化 NADPH 依赖性谷氨酰-tRNA 还原为谷氨酸 1-半醛。
Divergent regulation of the HEMA gene family encoding glutamyl-tRNA reductase in Arabidopsis thaliana: expression of HEMA2 is regulated by sugars, but is independent of light and plastid signalling.2002 · DOI: 10.1023/a:1016081114758
Induction of isoforms of tetrapyrrole biosynthetic enzymes, AtHEMA2 and AtFC1, under stress conditions and their physiological functions in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.100065
A second and differentially expressed glutamyl-tRNA reductase gene from Arabidopsis thaliana.1996 · DOI: 10.1007/bf00049321

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Z928 催化 NADPH 依赖性谷氨酰-tRNA (Glu) 还原为谷氨酸 1-半醛 (GSA)。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001472 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006779 porphyrin-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0006782 protoporphyrinogen IX biosynthetic process 生物过程
GO:0006783 heme biosynthetic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0015995 chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0033014 tetrapyrrole biosynthetic process 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分
GO:0008883 glutamyl-tRNA reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:CAA63140
ath:AT1G09940
ath:AT1G58290
csv:101208135
csv:101220615
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.910
排名 1 · TkA01G532730 · TK1151
线粒体0.127
排名 2 · TkA01G532730 · TK1151
细胞质0.037
排名 3 · TkA01G532730 · TK1151
细胞核0.028
排名 4 · TkA01G532730 · TK1151
过氧化物酶体0.015
排名 5 · TkA01G532730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01488Shikimate_DH2-30 aa
PF02254TrkA_N12-27 aa
PF05201GlutR_N121-271 aa
PF16574CEP209_CC5170-223 aa
PF16912Glu_dehyd_C278-417 aa
PF01488Shikimate_DH286-422 aa
PF23247LRR_RPS2289-309 aa
PF028262-Hacid_dh_C291-370 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G532730PF01488Shikimate_DH2305e-42144.0
TkA01G532730PF02254TrkA_N12270.0003321.7
TkA01G532730PF05201GlutR_N1212713.2e-49167.3
TkA01G532730PF16574CEP209_CC51702230.06914.0
TkA01G532730PF16912Glu_dehyd_C2784172.7e-0524.4
TkA01G532730PF01488Shikimate_DH2864225e-42144.0
TkA01G532730PF23247LRR_RPS22893090.2312.1
TkA01G532730PF028262-Hacid_dh_C2913700.001618.6
TkA01G532730PF00899ThiF2973290.001318.6
TkA01G532730PF13241NAD_binding_72993720.000421.6
TkA01G532730PF01113DapB_N3003700.001819.1
TkA01G532730PF02423OCD_Mu_crystall3003840.02314.4
TkA01G532730PF00044Gp_dh_N3003590.02415.6
TkA01G532730PF01408GFO_IDH_MocA3003730.1113.9
TkA01G532730PF03807F420_oxidored3013711.6e-0629.3
TkA01G532730PF21799MurD-like_N3013370.1812.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42804拟南芥sp|P42804|HEM11_ARATH Glutamyl-tRNA reductase 1, chloroplastic68.000%Swiss-Prot高置信
P49294拟南芥sp|P49294|HEM12_ARATH Glutamyl-tRNA reductase 2, chloroplastic66.500%Swiss-Prot高置信
A2Z928水稻sp|A2Z928|HEM1_ORYSI Glutamyl-tRNA reductase, chloroplastic60.300%Swiss-Prot高置信

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