RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G080290
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 20520602-20526267 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4314 bp · TkA01G080290|TK1151|cDNA

ACCTCGCTATAATGGATACTGTAAATCCAATAATGGATGTTTATGCAGATAGTTCTGTTCCAACTACACCCCCACTATACCAATGGAAGATAGTCAAGATACCCAACTTACTACTACAGAAACAATGGAAGAGAACCAGAGACTACTATTTGCCATTAACGGAGAGCGCTTTGAGCTCTCTTCGATAGATCCTTCAATTACTCTGCTTCAATTCCTTCGTTCTCATACTCGCTTCAAGAGTGTGAAGCTCGGTTGCGGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

4050 bp · TkA01G080290|TK1151|CDS

ATGGAAGATAGTCAAGATACCCAACTTACTACTACAGAAACAATGGAAGAGAACCAGAGACTACTATTTGCCATTAACGGAGAGCGCTTTGAGCTCTCTTCGATAGATCCTTCAATTACTCTGCTTCAATTCCTTCGTTCTCATACTCGCTTCAAGAGTGTGAAGCTCGGTTGCGGTGAAGGTGGTTGTGGTGCTTGTAATGTTCTACTATCCAAATTCGACTCCAACCTCAATCAAGTTGAAGATTACAAAGTGAGTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1349 aa · TkA01G080290|TK1151|PROTEIN

MEDSQDTQLTTTETMEENQRLLFAINGERFELSSIDPSITLLQFLRSHTRFKSVKLGCGEGGCGACNVLLSKFDSNLNQVEDYKVSSCLTPLCSINGCSITTTEGLGNIKDGFHSIHQRFAGFHGSQCGFCTPGMCVSLFSALVNADKKTEHQEPPVGFSNLTVSEAEKSISGNLCRCTGYRPIADVCKSFACDVDMEDLGLNSFWKKGDDVDSKSQKLPFYDPKQICTYPEFLKKEHKSPMYMEYNKRFWYTPVSINEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G080290
TK1151 IDTkA01G080290
OH-1004 IDLXL04_005110
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G080290
位置Chr01:20520602-20526267 (-)
描述Similar to AAO2: Indole-3-acetaldehyde oxidase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g20960 在高等植物中，醛氧化酶（AO）似乎是由AO亚基组成的同源和异源二聚体，可能具有不同的生理功能。 暂无已核实直接文献
At2g27150 在高等植物中，醛氧化酶 似乎是 AO 亚基的同二聚体和异二聚体组装体，可能具有不同的生理功能。
Abscisic aldehyde oxidase in leaves of Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00812.x
The Arabidopsis aldehyde oxidase 3 (AAO3) gene product catalyzes the final step in abscisic acid biosynthesis in leaves.2000 · DOI: 10.1073/pnas.220426197
Comparative studies on the Arabidopsis aldehyde oxidase (AAO) gene family revealed a major role of AAO3 in ABA biosynthesis in seeds.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch198
Both abscisic acid (ABA)-dependent and ABA-independent pathways govern the induction of NCED3, AAO3 and ABA1 in response to salt stress.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2006.01576.x
At3g43600 在高等植物中，醛氧化酶（AO）似乎是由AO亚基组成的同源和异源二聚体，可能具有不同的生理功能。 暂无已核实直接文献
At1g04580 醛氧化酶具有广泛的底物特异性。
An aldehyde oxidase in developing seeds of Arabidopsis converts benzaldehyde to benzoic Acid.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135848
Aldehyde Oxidase 4 Plays a Critical Role in Delaying Silique Senescence by Catalyzing Aldehyde Detoxification.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01939

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005110 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0110096 cellular response to aldehyde 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004031 aldehyde oxidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04580
ath:AT2G27150
ath:AT3G43600
ath:AT5G20960
zma:542229
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.725
排名 1 · TkA01G080290 · TK1151
细胞核0.245
排名 2 · TkA01G080290 · TK1151
线粒体0.098
排名 3 · TkA01G080290 · TK1151
过氧化物酶体0.083
排名 4 · TkA01G080290 · TK1151
内质网0.044
排名 5 · TkA01G080290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00111Fer224-92 aa
PF01799Fer2_2102-188 aa
PF00111Fer2125-132 aa
PF00941FAD_binding_5251-425 aa
PF03450CO_deh_flav_C447-547 aa
PF01315Ald_Xan_dh_C605-709 aa
PF02738MoCoBD_1739-968 aa
PF20256MoCoBD_2997-1260 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G080290PF00111Fer224924.1e-0627.4
TkA01G080290PF01799Fer2_21021881e-2074.3
TkA01G080290PF00111Fer21251324.1e-0627.4
TkA01G080290PF00941FAD_binding_52514252.9e-38132.1
TkA01G080290PF03450CO_deh_flav_C4475479.7e-2071.3
TkA01G080290PF01315Ald_Xan_dh_C6057092.2e-2486.6
TkA01G080290PF02738MoCoBD_17399684.3e-79265.7
TkA01G080290PF20256MoCoBD_299712601.5e-69235.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q7G193拟南芥sp|Q7G193|ALDO1_ARATH Indole-3-acetaldehyde oxidase60.400%Swiss-Prot高置信
Q7G9P4拟南芥sp|Q7G9P4|ALDO3_ARATH Abscisic-aldehyde oxidase59.500%Swiss-Prot高置信
Q7G192拟南芥sp|Q7G192|ALDO2_ARATH Indole-3-acetaldehyde oxidase60.500%Swiss-Prot高置信
Q7G191拟南芥sp|Q7G191|ALDO4_ARATH Aldehyde oxidase 459.400%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看