同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00419
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 7
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00419

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00419 ChrUn 6707174-6841495 Chr09 48185698-48375544 mixed Medium 7 anchors
ChrUn 6707174-6841495 Chr09 48185698-48375544 JCVI_TKOH_00419 · 7 gene pairs TkAUNG025080 | LXL04_038695 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkAUNG025170 | LXL04_038693 | 98.4% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkAUNG025190 | LXL04_038692 | 99.2% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG025220 | LXL04_038701 | 98.6% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG025280 | LXL04_038703 | 99.4% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG025410 | LXL04_038703 | 98.9% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG025570 | LXL04_038701 | 99.7% | multi_source_to_OH1004 | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00419 ChrUn:6707174-6841495 Chr09:48185698-48375544 mixed 7 中等置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 7 · 当前范围 1–7 · 页码 1/1

TkAUNG025080 → LXL04_038695
100.0%
TkAUNG025170 → LXL04_038693
98.4%
TkAUNG025190 → LXL04_038692
99.2%
TkAUNG025220 → LXL04_038701
98.6%
TkAUNG025280 → LXL04_038703
99.4%
TkAUNG025410 → LXL04_038703
98.9%
TkAUNG025570 → LXL04_038701
99.7%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkAUNG025080LXL04_038695JCVI_TKOH_00419100.0100.0 / 100.0Probable
TkAUNG025170LXL04_038693JCVI_TKOH_0041998.4100.0 / 100.0Probable
TkAUNG025190LXL04_038692JCVI_TKOH_0041999.2100.0 / 84.602Complex
TkAUNG025220LXL04_038701JCVI_TKOH_0041998.6100.0 / 100.0Complex
TkAUNG025280LXL04_038703JCVI_TKOH_0041999.4100.0 / 100.0Complex
TkAUNG025410LXL04_038703JCVI_TKOH_0041998.9100.0 / 100.0Complex
TkAUNG025570LXL04_038701JCVI_TKOH_0041999.7100.0 / 100.0Complex